Hromosom 15 je jedan od 23 para hromosomu u ljudi. Ljudi obično imaju dvije kopije ovog hromosoma. Hromozom 15 obuhvata oko 101 milion baznih parova (gradivni materijal DNK) i predstavlja između 3% i 3,5% ukupne DNK u ćeliji.

Kratke činjenice Karakteristike, Dužina (bp) ...
Hromosom 15
Thumb
Par ljudskih hromosoma 15 nakon G-pruganja.
Jedan je od majke, drugi od oca .
Thumb
Par hromosome 15 pair
u kariogramu muškarca.
Karakteristike
Dužina (bp)101,991.189 bp
(GRCh38)[1]
Br. gena561 (CCDS)[2]
VrstaAutosom
Pozicija centromereAkrocentrik[3]
(19,0 Mbp)
Kompletan spisak gena
CCDSSpisak gena
HGNCSpisak gena
UniProtSpisak gena
NCBISpisak gena
Vanjski preglednici karata
EnsemblHromosom 15
EntrezHromosom 15
NCBIHromosom 15
UCSCHromosom 15
Potpune DNK sekvence
RefSeqNC_000015 (FASTA)
GenBankCM000677 (FASTA)
Zatvori
Thumb
Thumb

HLA sistem leukocitnih antigena za β2-mikroglobulin nalazi se u hromosomu 15.

Geni

Broj gena

Slijede neke od procjena broja gena za ljudski hromozom 16. Budući da istraživači koriste različite pristupe označavanjaja genoma, njihova predviđanja broja gena na svakom hromosomu variraju (za tehničke detalje pogledajte predviđanje gena). Među različitim projektima, zajednički projekat konsenzusnog kodiranja (Konsenzusni CCDS) zauzima izuzetno konzervativnu strategiju. Dakle, CCDS-ovo predviđanje broja gena predstavlja donju granicu ukupnog broja gena koji kodiraju ljudske proteine.[4]

Više informacija Baza podataka, Protein-kodirajući geni ...
Baza podatakaProtein-kodirajući geniGeni nekodirajuće RNKPseudogeniIzvorDatum objave
CCDS561 [2] 2016-09-08
HGNC559328433 [5] 2017-05-12
Ensembl605992508 [6] 2017-03-29
UniProt601 [7] 2018-02-28
NCBI629716594 [8][9][10] 2017-05-19
Zatvori

Lista gena

Slijedi djelimična lista gena na ljudskom hromosomu 15. Potpunu listu potražite u linku u informacijskom okviru s desne strane.

Hromosomske promjene

Slijedeće promjene mogu biti izazvane mutacijama na hromosomu 15:

Angelmanov sindrom

Glavne karakteristike Angelmanovog sindroma su teška mentalna retardacija: ataksija, nedostatak govora, i pretjerano euforično ponašanje. Angelmanov sindrom rezultate od gubitka aktivnosti gena u određenom dijelu hromosoma 15, regija 15q11-P15. Ova regija sadrži gen UBE3A, koji kada je mutiran ili odsutan, vjerovatno izaziva karakteristične izraze ovog stanja. Ljudi obično imaju dvije kopije gena UBE3A, po jedan od svakog roditelja. Obje kopije su aktivne u mnogim tjelesnim tkivima. U mozgu, međutim, samo majčinska kopija je aktivna. Ako se ta kopija izgubi zbog promjene hromosomskih ili genskih mutacija, ta osoba neće imati aktivnu kopiju UBE3A gena u mozgu.

U većini slučajeva (oko 70%), osobe s Angelmanovim sindromom imaju delecije u kopiji kromosoma 15. Ova delecija je na majčinskim hromosomima u regiji koja sadrži gen UBE3A. Zbog kopije gena UBE3A naslijeđenog od oca (očinskog kopije), obično je neaktivan u mozgu, a delecija u majčinskom hromosomu 15 rezultatira u neaktivnoj kopiji UBE3A gena u mozgu.

U 3 – 7% slučajeva, Angelmanov sindrom nastaje kada osoba ima dvije kopije očinskog hromosoma 15, umjesto po jedan primjerak od svakog roditelja. Ovaj fenomen se naziva očinska jednoroditeljske disomija (UPD). Osobe sa očevim UPD na hromosomu 15 imaju dvije kopije gena UBE3A, ali su obje naslijedile od oca i stoga one nisu aktivne u mozgu.

U oko 10% slučajeva, Angelmanov sindrom je uzrokovan mutacijom u UBE3A genu, a još 3% ih je rezultat neispravnosti u DNK regiji koja kontrolira aktiviranje UBE3A i drugih gena na majčinskoj kopiji hromosoma 15. Niska je učestalost Angelmanovog sindroma, koji može biti uzrokovan hromosomskim preuređenjima u vidu translokacija ili mutacija van UBE3A gena. Te genetičke promjene mogu abnormalno inaktivirati gen UBE3A.

Angelmanov sindrom može biti nasljedan, kao što se vidi po jednom slučaju u kojem je kćerka zatrudnjela sa pacijentom koji je imao isto stanje.[12]

Prader-Willijev sindrom

Glavna obilježja ovog stanja uključuju polifagiju (ekstremni, nezasit apetit), blago do umjereno zaostajanja u razvoju, hipogonadizam (koji rezultira kasnim pubertetom) i hipotoniju. Prader-Willijev sindrom je uzrokovan gubitkom aktivnih gena u određenom dijelu hromosoma 15, u regiji 15q11-P13. Takvi ljudi obično imaju dvije kopije tog hromosoma u svakoj ćeliji, po jedan primjerak od svakog roditelja. Prader-Willijev sindrom dolazi kada očinska kopija djelimično ili u potpunosti nedostaje.

U oko 70% slučajeva, Prader-Willijevog sindroma nastaje zbog delecije u regiji 15q11-P13 očinskog hromosoma 15. Geni u ovoj regiji su obično aktivni na očevoj, a neaktivni na majčinskoj kopiji. Dakle, osoba sa delecijom u očevom hromosomu 15 neće imati aktivnih gena u ovoj regiji.

U oko 25% slučajeva, osobe s Prader-Willijevim sindromom u svakoj ćeliji imaju dvije kopije majčinskog hromosoma 15 , umjesto po jedan primjerak od svakog roditelja. Ovaj fenomen se naziva materinska (maternalna) jednoroditeljska disomja. Zato što su neki geni obično aktivni samo na očevoj kopiji oveog hromosoma, osoba sa dvije kopije majčinskih hromosoma 15 neće imati aktivnu kopije tih gena.

U malom broju slučajeva, Prader-Willijev sindrom nije uzrokovan hromosomskom translokacijom. Rijetko je ovo stanje uzrokovano abnormalnostima u regiji DNK koja kontrolira aktivnost gena na očevom hromosomu 15. Osobe sa Prader-Willijevim sindromom imaju problema u reprodukciji pa on nije nasljedan.

Izodicentrični hromosom 15

Specifične hromosomske promjene zvane izodicentrični hromosom 15 (ranije pod nazivom „obrnuto“ dupliranje 15) mogu uticati na rast i razvoj. Takvi pacijent imaju jedan "ekstra" ili "marker" hromosom. Ovaj mali dodatni hromosom sastoji se od genetičkog materijala iz hromosoma 15, koji je nenormalno dupliciran (kopiran) i priključen „kraj-na-kraj“ . U nekim slučajevima, dodatni hromosom je vrlo mali i ne utiće na zdravlje osobe. Veći izodicentricčni hromosom 15 može dovesti do slabog mišićnog tonusa (hipotonija), mentalne retardacije, konvulzija i problemima u ponašanju. Znakovi i simptomi autizma (razvojni poremećaj koji utiče na komunikaciju i društvene interakcije ) su također povezani sa prisustvom isodicentričnog hromosoma 15.

Ostale hromosomske promjene

Ostale promjene u broju ili strukturi kromosoma 15 mogu dovesti do mentalne retardacije, sporog rasta i razvoja, hipotonije, i karakterističnih crta lica. Ove promjene uključuju jednu kopiju dijela hromosoma 15 u svakoj od ćelija (parcijalna trisomija 15) ili nedostaje segment hromosomu u svakoj ćeliji (parcijalna monosomija 15). U nekim slučajevima, nekoliko hromosomskih DNK blokova (nukleotida) su deletirani ili duplirani. Neke od slijedećih bolesti su u vezi sa genima hromosoma 15:

Citogenetčke pruge/ bendovi

G-prugani idiogrami ljudskog hromosoma 15
Thumb
G-prugani idiogram ljudskog hromosoma 15 u rezoluciji 850 bphs. Dužina pruga u dijagramu proporcionalna je dužini baznog para. Ovaj tip idiograma općenito se upotrebljava u preglednicima genoma (npr. Ensembl, UCSC Genome Browser).
Thumb
Obrasci G-pruganja ljudskog hromosoma 15 u tri različite rezolucija (400,[13] 550[14] i 850[15]). Dužina pruga u ovom dijagramu temelji se na ideigramima iz ISCN (2013).[16] Ovaj tip idiograma predstavlja stvarnu relativnu dužinu pruga uočenih pod mikroskopom u različitim fazama tokom procesa mitoze.[17]
Više informacija Krak, Pruga/bend/traka ...
G-pruge ljudskog kromosoma 15 urezoluciji 850 bphs[15]
Hromosom Krak[18] Pruga/bend/traka ISCN
start[19]
ISCN
stop[19]
Bazni par
start
Bazni par
stop
Boja[20] Gustoća
15p 13027014.200.000 gvar
15p 122706314.200.0019.700.000 stalk
15p 11.263111429.700.00117.500.000 gvar
15p 11.11142138217.500.00119.000.000 acen
15q 11.11382148719.000.00120.500.000 acen
15q 11.21487177320.500.00125.500.000 gneg
15q 121773196825.500.00127.800.000 gpos50
15q 13.11968216427.800.00130.000.000 gneg
15q 13.22164228430.000.00130.900.000 gpos50
15q 13.32284252430.900.00133.400.000 gneg
15q 142524276533.400.00139.800.000 gpos75
15q 15.12765297539.800.00142.500.000 gneg
15q 15.22975306542.500.00143.300.000 gpos25
15q 15.33065324543.300.00144.500.000 gneg
15q 21.13245347144.500.00149.200.000 gpos75
15q 21.23471362149.200.00152.600.000 gneg
15q 21.33621384652.600.00158.800.000 gpos75
15q 22.13846398258.800.00159.000.000 gneg
15q 22.23982408759.000.00163.400.000 gpos25
15q 22.314087425263.400.00166.900.000 gneg
15q 22.324252435766.900.00167.000.000 gpos25
15q 22.334357450767.000.00167.200.000 gneg
15q 234507461367.200.00172.400.000 gpos25
15q 24.14613474872.400.00174.900.000 gneg
15q 24.24748480874.900.00176.300.000 gpos25
15q 24.34808492876.300.00178.000.000 gneg
15q 25.14928504878.000.00181.400.000 gpos50
15q 25.25048516981.400.00184.700.000 gneg
15q 25.35169537984.700.00188.500.000 gpos50
15q 26.15379564988.500.00193.800.000 gneg
15q 26.25649586093.800.00198.000.000 gpos50
15q 26.35860607098.000.001101.991.189 gneg
Zatvori

Reference

Također pogledajte

Vanjski linkovi

Wikiwand in your browser!

Seamless Wikipedia browsing. On steroids.

Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.

Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.