SERF2

Mali EDRK-bogati faktor 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SERF2.^[5][6]

SERF2
Identifikatori
Aliasi	SERF2
Vanjski ID-jevi	OMIM: 605054 MGI: 1337041 HomoloGene: 85994 GeneCards: SERF2
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 15 (čovjek)[1] Bend 15q15.3 Početak 43,777,087 bp[1] Kraj 43,804,427 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 2 (miš)[2] Bend 2|2 E5 Početak 121,279,676 bp[2] Kraj 121,288,794 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • molekularna funkcija Ćelijska komponenta • citosol • jedro Biološki proces • GO:0022610 biološki proces Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	10169	378702
Ensembl	ENSG00000140264	ENSMUSG00000074884
UniProt	P84101	P84102
RefSeq (mRNK)	NM_001018108 NM_001199875 NM_001199876 NM_001199877 NM_001199878 NM_005770	NM_001290837 NM_011354
RefSeq (bjelančevina)	NP_001018118 NP_001186804 NP_001186805 NP_001186806 NP_001186807	NP_001277766 NP_035484
Lokacija (UCSC)	Chr 15: 43.78 – 43.8 Mb	Chr 2: 121.28 – 121.29 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Gross (2014) mapirao je gen SERF2 na hromosomu 15q15.3, na osnovu poravnanja sekvence SERF2 (GenBank AF073298) sa genomskom sekvencom (GRCh37).^[7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 59 aminokiselina, a molekulska težina 6.900 Da.^[8].

10		20		30		40		50
MTRGNQRELA		RQKNMKKQSD		SVKGKRRDDG		LSAAARKQRD		SEIMQQKQKK
ANEKKEEPK

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

Koristeći komparativnu genomiku, sekvenciranje BAC koji sadrži Smn miša i pretraživanje baze podataka EST, praćeno PCR bibliotekom cDNK mozga miša i ljudskog skeletnih mišića, Scharf et al. (1998) izolirali su cDNK koje kodiraju H4F5 (SERF1) i H4F5REL (SERF2). Analizom sekvence utvrđeno je da SERF2 kodira izvedeni 59-aminokiselinski protein koji ima 69% aminokiselinskog identiteta sa SERF1. SERF2 je visoko nabijeni heliks-okret-heliks protein sa 33% ostataka ili lys ili arg, što sugerira ulogu u vezivanju nukleinskih kiselina.^[9]