From Wikipedia, the free encyclopedia
Neuprintana regija proteina 2 u Prader-Willijev/Angelmanuv sindrom je protein koji je kod ljudi kodiran genom NIPA2.[5][6]
Chai et al. (2003) odredili su da gen NIPA2 sadrži sedam egzona i obuhvata 29 kb. Kodirajuće područje proteže se između egzona 3 i 7, a alternativna prerada stvara alternativne eongze 2 i 2b. Gen Nipa2 miša sadrži sedam egzona i obuhvata 29,8 kb.[7]
Analizom genomske sekvence, mapirali su gen NIPA2 na hromosomu 15, sekvenca q11.2, unutar u nekim slučajevima deletirane regije PWS i AS. NIPA2 nalazi se unutar klastera gena distalno tačke 1 (BP1) i proksimalno od BP2. Redoslijed gena unutar ovog klastera je cen-NIPA1–NIPA2–CYFIP1–GCP5–BP2-tel. Chai et al. (2003) mapirali su i mišji Nipa2 u regiji hromosoma 7C, koja sadrži isti genski klaster i pokazuje homologiju sinteze s ljudskim hromosomom 15q11-q13.
Dužina polipeptidnog lanca je 360 aminokiselina, a molekulska težina 39.185 Da.[8].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSQGRGKYDF | YIGLGLAMSS | SIFIGGSFIL | KKKGLLRLAR | KGSMRAGQGG | ||||
HAYLKEWLWW | AGLLSMGAGE | VANFAAYAFA | PATLVTPLGA | LSVLVSAILS | ||||
SYFLNERLNL | HGKIGCLLSI | LGSTVMVIHA | PKEEEIETLN | EMSHKLGDPG | ||||
FVVFATLVVI | VALILIFVVG | PRHGQTNILV | YITICSVIGA | FSVSCVKGLG | ||||
IAIKELFAGK | PVLRHPLAWI | LLLSLIVCVS | TQINYLNRAL | DIFNTSIVTP | ||||
IYYVFFTTSV | LTCSAILFKE | WQDMPVDDVI | GTLSGFFTII | VGIFLLHAFK | ||||
DVSFSLASLP | VSFRKDEKAM | NGNLSNMYEV | LNNNEESLTC | GIEQHTGENV | ||||
SRRNGNLTAF |
Analizom genomske sekvence za identifikaciju novih gena susjednih uprintanom domenu u Prader-Willijevom sindromu (PWS/ Angelman, delecijskom području hromosoma 15, Chai et al. (2003) identificirali NIPA2. Izvedeni protein sadrži 360 aminokiselina i ima devet transmembranskih domena. Northern blot analizom otkriven je transkript od 2,4 kb u svim ispitivanim tkivima, s najvećom ekspresijom u posteljicama. NIPA2 dijeli značajan identitet sa svim analiziranim homolozima kičmenjaka, s najviše divergencija pronađenih na C-terminalu. Također su klonirali mišji Nipa2, koji kodira izvedeni protein od 359 aminokiselina, koji je 96% identičan ljudskim NIPA2. Za razliku od ljudskog NIPA2, koji ima jedno mjesto poliadenilacije, mišji Nipa2 ima dva alternativna mjesta poliadenilacije u 3-prim neprevedenom području. Northern blot analizom mišjih tkiva otkriveni su transkripti od 1,9 i 3,2 kb koji su pokazali najveću ekspresiju u placenti.
Studijama vremena replikacije, Chai et al. (2003) utvrdili su da replikacija genomske regije miša koja se proteže preko Nipa1-Nipa2-Cyfip1 pokazuje obrazac asinhronosti, ali asinhronija nije bila posljedica uticaja roditelja. PCR mozga mišje cDNK iz transgenih modela miša PWS i AS pokazao je da geni Nipa1, Nipa2, Cyfip1 i Gcp5 nisu utisnuti. RT-PCR je detektirao ekspresiju ljudskih NIPA1, NIPA2, CYFIP1 i GCP5 gena u limfocitima normalne jedinke i kod pacijenata s mutacijom koji utiskuju PWS i AS. CYFIP1 je izražen i iz majčinog i iz očevog hromosoma 15 u hibridima somatskih ćelija, što dalje ukazuje da ova čegtiri gena nisu utisnuta (uptintasna, utiskana).
Jiang i sur. (2012) identificirali su teri različite heterozigotne varijante u genu NIPA2 kod 3 od 380 kineskih pacijenata s epilepsijom odsutnosti u djetinjstvu (CAE). Mutacije (N334_335EinsD, I178F i N244S) nisu bile prisutne u 700 kontrola, ali svaka je bila kod neočekivanih očeva. Pretpostavljali su da haploinsuficijencija za NIPA2 može biti faktor osjetljivosti na CAE kod kineskih pacijenata. Funkcionalne studije varijanti nisu izvedene.[9]
Hildebrand et al. (2014) nisu mogli ponoviti nalaze Jiang i sur. (2012) u 494 bijelca s generaliziranom epilepsijom i 130 australijskih kontrola. Identificirali su varijantu N334_335EinsD u 2,6% kontrola. Dvije dodatne varijante, A75T (rs150146701) i A171V, takođe su pronađene i u manje od 1% kontrola. Zaključili su da varijacije u genu NIPA2 nisu povezane s generaliziranom epilepsijom u kavkazoidnoj populaciji. Jiang i sur. (2014) branili su svoj raniji izvještaj, napominjući da nijedna od tri mutacije koje su identificirali nije bila prisutna u bazi podataka Projekta 1000 genoma i da mogu postojati genetičke razlike između proučavanih populacija.[10][11]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.