Remove ads
taxonomische Einteilungen nach verschiedenen Merkmalen Aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Die Klassifikation von Viren beruht auf verschiedenen morphologischen, epidemiologischen oder biologischen Merkmalen. Von der rein funktionellen Klassifikation ist jedoch die offiziell gültige Taxonomie von Viren zu unterscheiden, nach der Viren beispielsweise in Familien, Gattungen und Arten nach dem Grad ihrer Verwandtschaft (ermittelt insbesondere durch Genomvergleich) eingeteilt werden. Alle anderen Klassifikationen sind noch zum Teil aus historischen oder praktischen Gründen üblich. Die Entscheidung über Kriterien der Taxonomie und Einteilung von Viren trifft ein internationales Gremium mit dem Namen International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).
Im Jahre 1962 wurde von André Lwoff, Robert W. Horne und Paul Tournier entsprechend der von Carl von Linné begründeten binären Klassifikation der Lebewesen eine Taxonomie der Viren („LHT-System“) eingeführt. In ihr werden analog zur Taxonomie anderer Lebewesen, die folgenden Taxa unterteilt:
Eine historische Einteilung der Viren nach dem LHT-System findet sich bei Francesco Fiume.[1] Die entscheidenden Charakteristika für diese Klassifikation waren:
Die drei morphologischen Kriterien (2–4) bestimmen den Morphotyp (Morphovar).
Frühe Klassifizierungssysteme berücksichtigten anstelle der noch nicht allgemein verfügbaren Genomsequenz folgende Kriterien:
In der modernen Taxonomie bleiben diese Kriterien unberücksichtigt, auch wenn sie weiter für die Zusammenfassung unterschiedlicher Viren mit gemeinsamen medizinischen oder epidemiologischen Merkmalen wichtig sind.
Die moderne Virus-Taxonomie nach ICTV orientiert sich ebenfalls nach Linné. Sie umfasst seit 2018 auch die höheren Rangstufen oberhalb der Ordnung, mit Namensendungen, die teilweise vom LHT-System abweichen.[2][3]
Mit Ende Juni 2022 gibt es sechs vom ICTV anerkannte Realms, die sich wie folgt unterteilen:[4]
Auf Grundlage des Wissens um die Molekularbiologie der Viren hatte sich seit 1971 eine weitere Klassifikation etabliert, welche auf einen Vorschlag des Nobelpreisträgers David Baltimore zurückgeht.[5][6]
Wichtige Kriterien dieser Klassifizierung sind:
Die verschiedenen Möglichkeiten ergeben sich dadurch, dass ein Strang der doppelsträngigen DNA, so wie sie in allen zellulären Organismen vorliegt, redundant ist und bei Viren daher entfallen kann. Ebenso kann das Virusgenom auch in verschiedenen Formen der RNA vorliegen, die in Zellen als Zwischenstufe bei der Proteinsynthese (mRNA) auftritt. Bei einzelsträngiger DNA oder RNA kommen beide möglichen Kodierungsrichtungen vor: die normale Richtung 5'→3', die als (+) Polarität bezeichnet wird, wie sie in der mRNA vorliegt, und die entgegengesetzte (komplementäre) Richtung (-), in der die RNA quasi als Negativ vorliegt.[7]
Diese Baltimore-Klassifikation nach der Replikationsstrategie wird heute zunehmend ungebräuchlich, denn
DNA-Viren bilden keine taxonomische Verwandtschaftsgruppe (Klade), stattdessen ist dieser Begriff lediglich eine Sammelbezeichnung der Virusklassifikation. Unter den DNA-Viren konnten jedoch eine Reihe von Taxa (Ordnungen und höher) als Verwandtschaftsgruppen ausgemacht und vom ICTV bestätigt werden.
Doppelstrang-DNA – dsDNA (englisch double strand), normale Genom-Form allen Lebens.[9]
Einzelstrang-DNA – ssDNA (englisch single strand). Virionen enthalten DNA positiver oder negativer Polarität.[31] Die Virusgruppe „CRESS“ (circular Rep-encoding single-strand DNA viruses) (im weiteren Sinne) ist keine Verwandtschaftsgruppe (Taxon), sondern polyphyletisch.[32][33][34][35][36] Das neue Phylum Cressdnaviricota fasst jedoch die hauptsächlichen Vertreter dieser in einer Verwandtschaftsgruppe zusammen.
Die Familie Pleolipoviridae war (mit der Ordnung Ortervirales) eines der ersten vom ICTV anerkannten Taxa (Verwandtschaftsgruppe, ermittelt nach der Genom-Sequenz), dessen Mitglieder in verschiedenen Baltimore-Gruppen (nämlich 1 und 2) fallen.
Im Wesentlichen identisch mit dem Realm Riboviria. Dazu gehören auch die vorgeschlagenen Supergruppen
nach Koonin et al. (2015), die Kladen verschiedener Baltimore-Gruppen zusammenfassen.
Doppelstrang-RNA – dsRNA[49]
Positive Einzelstrang-RNA – ss(+)RNA. Sie wirkt direkt als mRNA.[57]
Negative Einzelstrang-RNA – ss(-)RNA. Sie wirkt als Matrize zur mRNA Synthese.[63]
Dazu gehören Viren mit positiver Einzelstrang-RNA, die per Reverse Transkriptase (RT) in DNA zurückgeschrieben und ins Zellgenom eingebaut wird (Retroviren ssRNA-RT, Baltimore-Gruppe 6), sowie Viren mit Doppelstrang-DNA, die umgekehrt zur Replikation einen RNA-Zwischenschritt benutzen und daher ebenfalls revers transkribieren (Pararetroviren dsDNA-RT, Baltimore-Gruppe 7). Die meisten dieser Vertreter gehören unabhängig davon der Ordnung Ortervirales an.[64]
Positive Einzelstrang-RNA, die per Reverse Transkriptase (RT) in DNA zurückgeschrieben und ins Zellgenom eingebaut wird (Retroviren).
Doppelstrang-DNA, die zur Replikation einen RNA-Zwischenschritt benutzt (revers transkribierende DNA-Viren dsDNA-RT, Pararetroviren).
Nukleinsäure | Kapsidsymmetrie | Hülle | Genom | Baltimore-Klasse | Familie | Genus | Arten |
---|---|---|---|---|---|---|---|
DNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+/-) | II | Parvoviridae | Erythroparvovirus | Parvovirus B19 |
DNA | ikosaedrisch | nackt | ds zirkulär | I | Polyomaviridae | Betapapillomavirus | Humanes Papillomvirus 1 und 2 |
DNA | ikosaedrisch | nackt | ds zirkulär | I | Polyomaviridae | Polyomavirus | SV40, BK-Virus, JC-Virus |
DNA | ikosaedrisch | nackt | ds | I | Adenoviridae | Mastadenovirus | Humanes AdV A–F |
DNA | ikosaedrisch | umhüllt | ds | VII | Hepadnaviridae | Orthohepadnavirus | Hepatitis-B-Virus |
DNA | ikosaedrisch | umhüllt | ds | I | Herpesviridae | Simplexvirus | Herpes-simplex-Virus 1 und 2 |
DNA | ikosaedrisch | umhüllt | ds | I | Herpesviridae | Varicellovirus | Varizella-Zoster-Virus |
DNA | ikosaedrisch | umhüllt | ds | I | Herpesviridae | Cytomegalovirus | Cytomegalievirus |
DNA | ikosaedrisch | umhüllt | ds | I | Herpesviridae | Roseolovirus | Humanes Herpesvirus 6A, 6B und 7 |
DNA | ikosaedrisch | umhüllt | ds | I | Herpesviridae | Lymphocryptovirus | Epstein-Barr-Virus |
DNA | komplex | umhüllt | ds | I | Poxviridae | Orthopoxvirus | Variolavirus, Vacciniavirus |
DNA | komplex | umhüllt | ds | I | Poxviridae | Parapoxvirus | Orf-Virus |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+) | IV | Picornaviridae | Enterovirus | Poliovirus 1–3, Rhinovirus A–C, Coxsackievirus, Echovirus |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+) | IV | Picornaviridae | Parechovirus | Parechovirus A |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+) | IV | Picornaviridae | Hepatovirus | Hepatitis-A-Virus |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+) | IV | Picornaviridae | Cardiovirus | Cardiovirus A (Mengovirus, EMC-Virus) |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+) | IV | Astroviridae | Mamastrovirus | Mamastrovirus 1, 6, 8, 9 |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+) | IV | Caliciviridae | Norovirus | Norwalk-Virus |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ss(+) | IV | Hepeviridae | Orthohepevirus | Hepatitis-E-Virus |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ds(10–18 Segmente) | III | Reoviridae | Coltivirus | Colorado-Zeckenfieber-Virus |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ds(10–18 Segmente) | III | Reoviridae | Orthoreovirus | Mammalian orthoreovirus |
RNA | ikosaedrisch | nackt | ds(10–18 Segmente) | III | Reoviridae | Rotavirus | Rotavirus |
RNA | ikosaedrisch | umhüllt | ss(+) | IV | Togaviridae | Alphavirus | Sindbisvirus |
RNA | ikosaedrisch | umhüllt | ss(+) | IV | Togaviridae | Rubivirus | Rötelnvirus |
RNA | ikosaedrisch | umhüllt | ss(+) | IV | Flaviviridae | Flavivirus | Gelbfieber-Virus, Hepatitis-C-Virus |
RNA | komplex | umhüllt | ss(+) | VI | Retroviridae | Deltaretrovirus | HTLV-1 HTLV-2 |
RNA | komplex | umhüllt | ss(+) | VI | Retroviridae | Spumavirus | Spumavirus |
RNA | komplex | umhüllt | ss(+) | VI | Retroviridae | Lentivirus | HIV-1,-2, SIV |
RNA | helikal | umhüllt | ss(+) | IV | Coronaviridae | Alphacoronavirus | Felines CoV |
RNA | helikal | umhüllt | ss(+) | IV | Coronaviridae | Betacoronavirus | SARS-CoV, MERS-CoV |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Orthomyxoviridae | Alphainfluenzavirus | Influenzavirus A |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Orthomyxoviridae | Betainfluenzavirus | Influenzavirus B |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Orthomyxoviridae | Gammainfluenzavirus | Influenzavirus C |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Orthomyxoviridae | Deltainfluenzavirus | Influenzavirus D |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Paramyxoviridae | Pneumovirus | Respiratorisches Synzytialvirus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Paramyxoviridae | Respirovirus | Parainfluenzavirus HPIV-1, HPIV-3 |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Paramyxoviridae | Rubulavirus | Parainfluenzavirus HPIV-2, HPIV-4 |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Paramyxoviridae | Rubulavirus | Mumpsvirus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Paramyxoviridae | Morbillivirus | Masernvirus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Rhabdoviridae | Lyssavirus | Tollwutvirus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Filoviridae | Filovirus | Marburgvirus, Ebolavirus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Peribunyaviridae | Orthobunyavirus | Bunyamweravirus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Nairoviridae | Orthonairovirus | Krim-Kongo-Virus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Phenuiviridae | Phlebovirus | Phlebotomus-Fieber-Virus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Hantaviridae | Orthohantavirus | Hantaan-Virus |
RNA | helikal | umhüllt | ss(-) | V | Arenaviridae | Mammarenavirus | LCM-Virus, Lassa-Virus |
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.