Picornavirales ist eine Ordnung von Viren, die im Jahr 2009 zur taxonomischen Klassifizierung von dem offiziellen Gremium für Virustaxonomie (ICTV) angenommen wurde. Bis dahin sprach man von einer Picornavirus-Supergruppe, um die enge Verwandtschaft aufzuzeigen. Die Picornavirales fassen verschiedene Familien und Gattungen zusammen, die unbehüllte Viren mit einer einzelsträngigen RNA mit positiver Polarität enthalten und bei denen die Anordnung der Gene und phylogenetische Analysen der viralen RNA-Polymerase und Helikase eine nahe Verwandtschaft aufzeigen. Alle Vertreter der Ordnung besitzen nur einen Offenen Leserahmen, der für ein Polyprotein codiert. Innerhalb der Ordnung besitzen die Viruspartikel (Virionen) der verschiedenen Virusgruppen auch einen gleichförmigen Aufbau des Kapsids mit einer Pseudo-(T=3)-Symmetrie.
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Innere Systematik
Die Ordnung Picornavirales umfasst die folgende Virusfamilien (Stand 1. April 2024):[4][5]
- Gattung Bacillarnavirus
- Gattung Kusarnavirus
- Gattung Labyrnavirus
- Gattung Locarnavirus
- Spezies Jericarnavirus B (ehem. Typus) mit Marine RNA virus JP-B[8][9]
- Spezies Sanfarnavirus 1
- Spezies Sanfarnavirus 2
- Spezies Sanfarnavirus 3
- Spezies Heterosigma akashiwo RNA virus (HaRNAV, Typus)[10] – wohl zu unterscheiden von der Spezies Heterosigma akashiwo virus 01 (HaV01/HaV-1) mit ihrem Subtyp Hav53
- Gattung Salisharnavirus
- Gattung Sogarnavirus
- Gattung Chipolycivirus
- Gattung Hupolycivirus
- Gattung Sopolycivirus
- Unterfamilie Comovirinae (frühere Familie Comoviridae)
-
- Spezies Comovirus raphani mit Rettichmosaikvirus (englisch Radish mosaic virus)
- Spezies Comovirus severum mit englisch Cowpea severe mosaic virus
- Spezies Comovirus vignae mit Kuhbohnen-Mosaikvirus (englisch Cowpea mosaic virus, CPMV)[12]
- …
- Gattung Fabavirus[13]
- Gattung Nepovirus[14]
- Spezies: Nepovirus arabis mit Arabis-Mosaikvirus (englisch Arabis mosaic virus)
- …
- ohne zugewiesene Unterfamilie:
- Gattung Cheravirus[16]
- Gattung Sadwavirus[17]
- Gattung Sequivirus
- Gattung Torradovirus
- Gattung Waikavirus
- Gattung Invictavirus
- Gattung Nyfulvavirus
- ohne zugewiesene Familie:
- Gattung „Fesavirus“ (alias „Feline stool-associated RNA virus“)
- Spezies „Fesavirus 1“
- Spezies „Fesavirus 3“
- Spezies „Fesavirus 4“
- Gattung „Fisavirus“ (alias „Fish stool-associated RNA virus“)
- Gattung „Husavirus“ (alias „Human stool-associated RNA viruses“)[18][19]
- Spezies „Husa-like virus KS-2016a“
- Spezies „Husavirus ACS160“
- Spezies „Husavirus ACS178“
- Spezies „Husavirus ACS200“
- Spezies „Husavirus VSAD“
- Spezies „Husavirus XZ110_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ111_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ112_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ114_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ115_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ93_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ97_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ98_XZ_CHN_2017“
- Spezies „Husavirus XZ99_XZ_CHN_2017“
- Gattung „Posavirus“ (alias „Porcine stool-associated RNA virus“)[20][19]
- Spezies „Posavirus 1“
- Spezies „Posavirus 2“
- Spezies „Posavirus 3“
- Spezies „Posavirus 4“
- Spezies „Posavirus 12“
- (etliche weitere Stämme)…
- Spezies „Picornavirales Tottori-HG1“
- Spezies „Picornavirales Tottori-HG2“
- Spezies „Picornavirales Tottori-HG3“
- Spezies „Picornavirales Tottori-HG4“
- ohne Gattungszuweisung (inkl. weiterer möglicher Kladen)
Äußere Systematik
Koonin et al haben 2015 die Picornavirales taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) zusammen mit einer Reihe weiterer Virusfamilien der von ihnen postulierten Supergruppe „Picornavirus-like superfamily“ zugeordnet.[22] Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[23]
| „Picornavirus-like superfamily“ |
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?Picobirnaviridae[28] (dsRNA) |
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Amalgaviridae[29] (dsRNA) |
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Partitiviridae[30] (dsRNA) |
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Megabirnaviridae[31] (dsRNA) |
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Chrysoviridae[32] (dsRNA) |
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Vorlage:Klade/Wartung/3 |
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Caliciviridae |
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Vorlage:Klade/Wartung/Style |
Die Mitglieder dieser mutmaßlichen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Totiviridae und Hypoviridae – viele doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.
ICTV Master Species List #35
Mit der neuen Master species List des ICTV, ratifiziert im März 2020, ergibt sich abweichend folgendes Bild:[2]
Von den Kitrinoviricota sind nur die oben bereits genannten Luteoviridae gelistet, weitere Phyla des Reichs Orthornavirae sind hier nicht berücksichtigt. Die „Picornavirus-like superfamily“ deckt sich im Wesentlichen mit den beiden Phyla Pisuviricota und Duplornaviricota der Orthornavirae (zu denen aber noch andere Phyla gehören).
- P. Christian, C. M. Fauquet et al.: Taxonomic Proposal to the ICTV Executive Committee, 17. Oktober 2007 (Volltextzugang)
- O. Le Gall, P. Christian et al.: Picornavirales, a proposed order of positive-sense single-stranded RNA viruses with a pseudo-T = 3 virion architecture. Arch Virol. (2008) 153(4): S. 715–727 PMID 18293057
- H. Sanfaçon, J. Wellink et al.: Secoviridae: a proposed family of plant viruses within the order Picornavirales that combines the families Sequiviridae and Comoviridae, the unassigned genera Cheravirus and Sadwavirus, and the proposed genus Torradovirus. Arch Virol. (2009) 154(5): S. 899–907 PMID 19350366
- A. N. Lukashev: Role of recombination in evolution of enteroviruses. Rev Med Virol. (2005) 15(3): S. 157–167 (Review) PMID 15578739
Alexander L. Greninger, Joseph L. DeRisi: Draft Genome Sequences of Marine RNA Viruses SF-1, SF-2, and SF-3 Recovered from San Francisco Wastewater, in: Genome Announc. 3(3), Mai-Juni 2015, Epub 18. Juni 2015, e00653-15 doi:10.1128/genomeA.00653-15, PMC 4472900 (freier Volltext), PMID 26089423. Young Hun Chung, Zhongchao Zhao, Eunkyeong Jung, Anthony O. Omole, Hanyang Wang, Lucas Sutorus, Nicole F. Steinmetz: Systemic Administration of Cowpea Mosaic Virus Demonstrates Broad Protection Against Metastatic Cancers. In: Advanced Science, Band 11, Nr. 18, 15. Mai 2024, S. 2308237; doi:10.1002/advs.202308237, Epub 2. März 2024 (englisch). Dazu:
Eda Altan, Kristen Aiemjoy, Tung G. Phan, Xutao Deng, Solomon Aragie, Zerihun Tadesse, Kelly E. Callahan, Jeremy Keenan, Eric Delwart: Enteric virome of Ethiopian children participating in a clean water intervention trial, in: Plos One, 16. August 2018, doi:10.1371/journal.pone.0202054 Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Picornavirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology Mai 2015; 479–480. 2–25. PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806.
