Familie der Ordnung Cirlivirales Aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Die Familie Circoviridae (von lateinischcirculus‚Kreis‘) umfasst derzeit (Stand September 2023) zwei offizielle Gattungen und eine vorgeschlagene Gattung von Viren mit einzelsträngiger, zirkulärer DNA mit negativer oder ambisense Polarität als Genom. Die Mitglieder der Circoviridae sind Erreger von Krankheiten bei Vögeln und Schweinen (Gattung Circovirus); auch Menschen können sich anstecken, wie Forschende vom Institut Pasteur im Februar 2023[2] berichten.
Die unbehülltenKapside der Circoviridae sind (sehr variabel nach Spezies) 15–30nm im Durchmesser groß und besitzen eine ikosaedrische Symmetrie. Das Kapsid besteht meist aus nur einem Kapsidprotein (CP) mit einer Molekülmasse zwischen 30 (PCV-1/2) und 50kDa (CAV). Bisher gibt es nur beim Beak and feather disease virus (BFDV) Hinweise auf drei verschiedene Kapsidproteine.
Genom
Genomkarte von „Capybara associated cyclovirus“, vorgeschlagenes Mitglied der Gattung Cyclovirus.[3] Ganz oben die Haarnadelstruktur (stem-loop).
Das einzelsträngige DNA-Genom besitzt ambisense-Polarität (Circovirus), das heißt, dass entgegengesetzte Leserichtungen auf einem identischen DNA-Strang vorliegen. Das virale Genom ist zwischen 1,8 und 2,3kb groß und codiert für 2–4 Gene. Circoviridae besitzen keine eigene DNA-Polymerase, nutzen jedoch zur Synthese eines doppelsträngigen DNA-Stranges als Zwischenschritt bei der Virusvermehrung die zellulären DNA-Polymerasen.
Circoviridae besitzen ein sehr enges Wirtsspektrum. Bei den aviären Spezies wird eine fäkal-orale Übertragung angenommen, eine angeborene Infektion über das Ei (vertikale Transmission) konnte nachgewiesen werden. Innerhalb einer Population sind die Circoviridae weit verbreitet (TTV beim Menschen zu 95%) und zeigen meist eine hohe Variabilität und geographisch unterschiedliche Subtypen bzw. Gruppen.
Veterinärmedizinisch bedeutsame Infektionen durch Circoviridae sind:
die Infektiöse Anämie der Hühner (Hühneranämievirus, CAV)
Porcine Dermatitis und Nephropathie Syndrom (PDNS) bei Schweinen (Porcines Circovirus-2, PCV-2)
Phylogenetischer Baum der Circoviridae
Die Familie hat mit Stand 30. April 2024 nach ICTV Master Species List #39v1 folgende Zusammensetzung (von den Spezies ist nur eine Auswahl angegeben):[4][5]
Familie Circoviridae (provisorisch Circovirus-like viruses)
Spezies Cyclovirus aasiak mit Spider associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus adie mit Chicken associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus anyidiwo mit Army ant associated cyclovirus 2 P8A-4.2_2
Spezies Cyclovirus babka mit Dragonfly associated cyclovirus 6 (DfCyV6)[14]
Spezies Cyclovirus bakri mit Goat associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus bashri mit Human associated cyclovirus 4, dazu Cyclovirus TN18, Cyclovirus TN25
Spezies Cyclovirus bastao mit Bat associated cyclovirus 10 (BatACyV10)
Spezies Cyclovirus bohloa mit [Army] Ant associated cyclovirus 5 (AaCyV-5)
Spezies Cyclovirus caballo mit Horse associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus cervienka mit Robinz virus RP_736
Spezies Cyclovirus doi mit Bat associated cyclovirus 12 (BatACyV12)
Spezies Cyclovirus enseenene mit Army ant associated cyclovirus 8 P1A-reste_2
Spezies Cyclovirus ezzike mit Chimpanzee associated cyclovirus 2
Spezies Cyclovirus flagermus mit Bat associated cyclovirus 5 (BatACyV5)
Spezies Cyclovirus fledermoyz mit Chifec virus UA13_1880 (ChimpACyV2)
Spezies Cyclovirus foca mit Werosea cyclovirus
Spezies Cyclovirus fourmi mit Army ant associated cyclovirus 6 P16-reste_1
Spezies Cyclovirus gaaye mit Bovine associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus gato mit Feline associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus homa mit Human associated cyclovirus 5, dazu Cyclovirus PK5034
Spezies Cyclovirus humana mit Human associated cyclovirus 10
Spezies Cyclovirus ibimonyo mit Army ant associated cyclovirus 3 P1A-reste_4
Spezies Cyclovirus insaan mit Human associated cyclovirus 2, dazu Cyclovirus PK5006
Spezies Cyclovirus jaaabani mit Bat associated cyclovirus 1 (BatACyV1)
Spezies Cyclovirus jemage mit Bat associated cyclovirus 2 (BatACyV2)
Spezies Cyclovirus kacsa mit Duck associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus kemirgen mit Dipodfec virus UA23Rod_1805
Spezies Cyclovirus khangkhaw mit Bat associated cyclovirus 9 (BatACyV9)
Spezies Cyclovirus kiroptero mit Bat associated cyclovirus 3 (BatACyV3)
Spezies Cyclovirus kisikisi mit Dragonfly associated cyclovirus 1 (DfCyV1)[14]
Spezies Cyclovirus kokoro mit [Army] Ant associated cyclovirus 1 (AaCyV-1)
Spezies Cyclovirus libelula mit Dragonfly associated cyclovirus 5 (DfCyV5)[14]
Spezies Cyclovirus liepsnele mit Robinz virus RP_1170
Spezies Cyclovirus liliac mit Bat associated cyclovirus 7 (BatACyV7)
Spezies Cyclovirus liljak mit Chifec virus UA15_2320
Spezies Cyclovirus maanav mit Human associated cyclovirus 1, dazu Cyclovirus PK5510
Spezies Cyclovirus manitan mit Human associated cyclovirus 11, dazu Cyclovirus SL-108277
Spezies Cyclovirus manukha mit Human associated cyclovirus 3, dazu Cyclovirus PK5222
Spezies Cyclovirus manusyan mit Human associated cyclovirus 12, dazu Indian encephalitis associated cyclovirus
Spezies Cyclovirus mchwa mit Arboreal ant associated circular virus 1 alias Ant associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus mier mit Army ant associated cyclovirus 4 P8A-3.2_1
Spezies Cyclovirus misi mit Calfel virus LSF31_cyc420
Spezies Cyclovirus mmadu mit Human associated cyclovirus 6, dazu Cyclovirus NG12
Spezies Cyclovirus moosa mit Calfel virus LSF31_cyc880
Spezies Cyclovirus munthu mit Human associated cyclovirus 9, dazu Human cyclovirus VS5700009
Spezies Cyclovirus murcielago mit Bat associated cyclovirus 17 (BatACyV17)
Spezies Cyclovirus muricec mit Eumops bonariensis associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus mutum mit Human associated cyclovirus 7, dazu Cyclovirus NG14
Spezies Cyclovirus mweyba mit Mongoose-associated cyclovirus Mon-20
Spezies Cyclovirus naahoohai mit Chicken associated cyclovirus 2
Spezies Cyclovirus naastsosi mit Mouse associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus nahkhiir mit Bat associated cyclovirus 8 (BatACyV8)
Spezies Cyclovirus namu mit Dragonfly associated cyclovirus 7 (DfCyV7)[14]
Spezies Cyclovirus ndanda mit Army ant associated cyclovirus 9 183_1
Spezies Cyclovirus netopyr mit Bat associated cyclovirus Vr1 (BatACyVVr7)
Spezies Cyclovirus newla mit Mongoose-associated cyclovirus Mon-32
Spezies Cyclovirus nhanloai mit Human associated cyclovirus 8 (ehem. Typus), dazu Cyclovirus VN
Spezies Cyclovirus nietoperz mit Bat associated cyclovirus 13 (BatACyV13)
Spezies Cyclovirus pauferro mit Caesalpinia ferrea associated virus
Spezies Cyclovirus pea mit Bat associated cyclovirus 15 (BatACyV15)
Spezies Cyclovirus peka mit Bat associated cyclovirus 14 (BatACyV14)
Spezies Cyclovirus pekapeka mit Bat associated cyclovirus 16 (BatACyV16)
Spezies Cyclovirus pettirosso mit Robinz virus RP_493
Spezies Cyclovirus podgana mit Rodent associated cyclovirus 2
Spezies Cyclovirus popo mit Bat associated cyclovirus 6 (BatACyV6)
Spezies Cyclovirus popoki mit Calfel virus LSF17_cyc102
Spezies Cyclovirus prihor mit Robinz virus RP_620
Spezies Cyclovirus prilep mit Chifec virus UA15_35
Spezies Cyclovirus punarinta mit Robinz virus RP_526
Spezies Cyclovirus rata mit Rodent associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus risi mit Squirrel associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus roach mit Cockroach associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus roedor mit Capybara associated cyclovirus[15][3]
Spezies Cyclovirus rotte mit Dipodfec virus UA04Rod_5913
Spezies Cyclovirus rudzik mit Robinz virus RP_584
Spezies Cyclovirus saguza mit Chifec virus UA13_1727
Spezies Cyclovirus sawya mit Chifec virus UA13_1817
Spezies Cyclovirus sismis mit Bat associated cyclovirus 4 alias Bat faeces associated cyclovirus 4 (BatACyV4)
Spezies Cyclovirus sokwe mit Chimpanzee associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus svosve mit Army ant associated cyclovirus 7 P4A-reste_1
Spezies Cyclovirus taniilai mit Dragonfly [associated] cyclovirus 2 (DfCyV2)[14]
Spezies Cyclovirus tarako mit Dragonfly associated cyclovirus 8 (DfCyV8)[14]
Spezies Cyclovirus tonbo mit Dragonfly associated cyclovirus 3 (DfCyV3)[14]
Spezies Cyclovirus totoi mit Robinz virus RP_259
Spezies Cyclovirus vauval mit Bat associated cyclovirus Cg1 (BatACyVCg1)
Spezies Cyclovirus vazka mit Dragonfly associated cyclovirus 4 (DfCyV4)[14]
Spezies Cyclovirus vespertilio mit Tadarida brasiliensis associated cyclovirus 1
Spezies Cyclovirus vleermuis mit Chifec virus UA13_1887
Spezies Cyclovirus yarasa mit Bat associated cyclovirus 11 (BatACyV11)
Spezies Cyclovirus ystlum mit Chifec virus UA13_1800
Klade von „Hudisavirus-ähnliche Viren“ (informell)
Spezies Porcine stool-associated circular DNA virus 4 (PoSCV-4, nach NCBI zu Circoviridae)[16][17]
Spezies „Hudisavirus sp. …“ (darunter Hudisavirus sp. isolate P22, Hudisavirus sp. isolate ETH_P25_2016, etc.)[18] (manchmal verschrieben als „Hudsavirus“) – entdeckt in Stuhlprobenperuanischer Patienten mit Diarrhoe und zeigt Ähnlichkeiten (ca. 78% Übereinstimmung) mit Porcine stool-associated circular DNA virus 4: ein Ambisense-Genom, das ein mutmaßliches Kapsidprotein Cap auf der Normal- und ein Replikations-Initiationsprotein Rep auf der Komplementär-Seite kodiert.[17] Referenzstamm ist Hudisavirus sp. isolate P22.[19]Hudisavirus-DNA wurde auch bei Patienten in Afrika (Äthiopien) und in den Fäkalien von Makaken gefunden.[20]
Weitere Vorschläge ohne Gattungszuordnung (Auswahl nach NCBI, Stand 19. Juni 2021):[21]
Spezies „Circoviridae LDMD-2013a“ mit Circoviridae 20 LDMD-2013, Circoviridae 5 LDMD-2013
Spezies „Circoviridae LDMD-2013b“ mit Circoviridae 12 LDMD-2013, Circoviridae 18 LDMD-2013
In die Familie Anelloviridae (bis dato Gattung Anellovirus) ausgelagert wurden Viren mit negativer Polarität (Gattung Gyrovirus, frühere Gattung Anellovirus), darunter die Gattungen Alphatorquevirus, Betatorquevirus, Gammatorquevirus, Deltatorquevirus, Epsilontorquevirus, Zetatorquevirus, Etatorquevirus, Thetatorquevirus, Iotatorquevirus, Kappatorquevirus, Lambdatorquevirus, Mutorquevirus, Nutorquevirus und Gyrovirus.
C. M. Fauquet, M.A. Mayo etal.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier Academic Press, London / San Diego 2005, ISBN 0-12-249951-4.
David M. Knipe, Peter M. Howleyetal. (Hrsg.): Fields’ Virology. 4. Auflage. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2001, ISBN 0-7817-1832-5.
Tristan P.W. Dennis, Peter J. Flynn, William Marciel de Souza, Joshua B. Singer, Corrie S. Moreau, Sam J. Wilson, Robert J. Gifford: Insights into Circovirus Host Range from the Genomic Fossil Record. In: ASM Journal of Virology, Band 92, Nr.16, 31. Juli 2018, e00145-18; doi:10.1128/JVI.00145-18, PMID 29875243 (englisch).
Caroline Tochetto, Ana Paula Muterle Varela, Diane Alves de Lima, Márcia Regina Loiko, Camila Mengue Scheffer, Willian Pinto Paim, Cristine Cerva, Candice Schmidt, Samuel Paulo Cibulski, Lucía Cano Ortiz, Sidia Maria Callegari Jacques, Ana Cláudia Franco, Fabiana Quoos Mayer, Paulo Michel Roehe: Viral DNA genomes in sera of farrowing sows with or without stillbirths, in: PLoS ONE 15(3), e0230714, 26. März 2020, doi:10.1371/journal.pone.0230714. In Fig.5 ist Hudsavirus als Hudisavirus zu lesen
Eda Altan, Kristen Aiemjoy, Tung G. Phan, Xutao Deng, Solomon Aragie, Zerihun Tadesse, Kelly E. Callahan, Jeremy Keenan, Eric Delwart: Enteric virome of Ethiopian children participating in a clean water intervention trial. In: Plos One, Band 13, Nr.8, 16. August 2018; doi:10.1371/journal.pone.0202054, PMID 30114205, PMC6095524 (freier Volltext) (englisch).
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