Familie im Reich Viren (Virus) Aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Der Begriff Iridoviridae bezeichnet eine Familie von Viren, die der KlasseMegaviricetes in dem PhylumNucleocytoviricota (veraltet Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV; frühere Vorschläge für dieses Taxon hatten auf „Nucleocytoplasmaviricota“ bzw. –im Rang einer Ordnung– „Megavirales“ gelautet) zugerechnet wird.[1]
Die Mitglieder der Familie Iridoviridae werden informell als „Iridoviriden“ bezeichnet (en. iridovirids; vgl. Familie Hominidae: Hominiden, en. hominids), im Unterschied zu den Mitgliedern der (Teil-)GattungIridovirus, die informall „Iridoviren“ genannt werden (en. iridoviruses).[2]
Seit dem Jahr 2000 unterstützen mehrere Studien die Annahme, dass die Ascoviren sich aus den Iridoviridae entwickelt haben.[14][15][16][17]
Ein Kladogramm der Asco- und Iridiviridae findet man beim ICTV,[18] und in Fenner’s Veterinary Virology (Fifth Edition)
2017[19]
Danach sind die Iridoviridae eine Schwestergruppe der Ascoviridae-Gattung Toursvirus (mit DpTV alias DpAV), während die Gattung Ascovirus eine basale Stellung in der gemeinsamen Klade einnimmt.
Nach Andreani etal. (2018) und Chinchar etal. (2020) sind umgekehrt die Ascoviridae eine Schwestergruppe der Alphairidovirinae, während hier die Betairidovirinae basal in der gemeinsamen Klade stehen.[20][21]
Diese Ansicht wird auch durch Rolland etal. (2019) unterstützt. Neben den Unterfamilien der Iridoviridae erscheinen die Ascoviridae vom Rang einer Unterfamilie innerhalb einer gemeinsamen Familie „Irido-Ascoviridae“. Die Betairidovirinae sind möglicherweise nicht monophyletisch.[22]
Schemazeichnung eines Virions der Unterfamilie Alphairidovirinae; Querschnitt ohne und mit Hülle, sowie Seitenansicht. Genom nicht maßstabsgerecht.Schemazeichnung eines Virions der Gattung Iridovirus (Unterfamilie Betairidovirinae); Ansichten wie zuvor. Man beachte die abweichende Triangulationszahl. Genom nicht maßstabsgerecht.
Die Viruspartikel (Virionen) haben eine ikosohedrale Symmetrie. Das Virion besteht aus drei Domänen, einem äußeren Kapsid, einer intermediären Lipiddoppelschicht und einem zentralen Core mit DNA-Protein-Komplexen. Gelegentlich kann bei den Viren eine äußere Virushülle identifiziert werden. Dies hängt davon ab, ob die Viren durch Knospung oder nach einer Lyse der Wirtszelle aus dieser heraus gelangen.
Für das Genom der Iridoviridae wird je nach Autor eine Länge von ca. 140–303 bzw. 150–280kbp (Alphairidovirinae: 100–170kbp, Betairidovirinae: 135–213kbp) angegeben.[23] Bei Wiseana iridescent virus beträgt die Genomlänge beispielsweise von 205.791bp mit vorausgesagt 193 kodierten Proteinen.[24]
Genexpression
Wie bei Herpesviren erfolgt die Transkription in den drei Schritten: „immediate-early“, „delayed-early“ und „late“. Bei jedem Zeitpunkt des Prozesses gibt es Regulationsmechanismen durch Induktion und Produkthemmung.
Replikation
Der Zusammenbau des Virus geschieht im Zytoplasma, ein Teil der Replikation erfolgt im Kern der Wirtszelle. Die Viren dringen in die Zelle ein und verlieren ihre Hülle. Die virale DNA gelangt dann in den Zellkern und wird durch die Pol II transkribiert. Die Synthese von Wirtszellproteinen gelangt zum Stillstand. Die Virus-DNA dient als Vorlage für die DNA-Replikation im Zytoplasma. Dabei werden große Concatamere aus viraler DNA gebildet. Sie werden von Virusproteinen verpackt und durch Knospung oder Lyse aus dem Inneren des Wirtszelle freigelassen.
Zur Pathogenese der Iridoviren ist wenig bekannt. Sie scheint aber temperaturabhängig zu sein und das Virus daher von poikilothermen Wirten abhängig zu sein.
Mitglieder der Familie der Iridoviren infizieren hauptsächlich invertebrate Wirte, befallen aber auch Fische, Amphibien und Reptilien.
„Namao-Virus“ und die Gruppe „sNCLDV“ (Stör-NCLDV) – vorgeschlagene Mitglieder der Mimiviridae. Einige Kandidaten könnten eher dorthin gehören als zu den Iridoviridae.
William H Wilson, Ilana C Gilg, Mohammad Moniruzzaman, Erin K Field, Sergey Koren, Gary R LeCleir, Joaquín Martínez Martínez, Nicole J Poulton, Brandon K Swan, Ramunas Stepanauskas, Steven W Wilhelm: Genomic exploration of individual giant ocean viruses, in: ISME Journal 11(8), August 2017, S.1736–1745, doi:10.1038/ismej.2017.61, PMC5520044 (freier Volltext), PMID 28498373 (englisch).
Julien Andreani, Jonathan Verneau, Didier Raoult, Anthony Levasseurn Bernard La Scola: Deciphering viral presences: two novel partial giant viruses detected in marine metagenome and in a mine drainage metagenome, in: Virology Journal, Band 15, Nr.66, 10. April 2018, doi:10.1186/s12985-018-0976-9
Tang KF, Redman RM, Pantoja CR, Groumellec ML, Duraisamy P, Lightner DV: Identification of an iridovirus in Acetes erythraeus (Sergestidae) and the development of in situ hybridization and PCR method for its detection, in: J Invertebr Pathol. 96(3), November 2007, S.255–260, PMID 17585932, doi:10.1016/j.jip.2007.05.006
K. Stasiak, M. V. Demattei, B. A. Federici, Y. Bigot:Phylogenetic position of the Diadromus pulchellus ascovirus DNA polymerase among viruses with large double-stranded DNA genomes. In: The Journal of General Virology. Band81, Pt 12, Dezember 2000, S.3059–3072, doi:10.1099/0022-1317-81-12-3059, PMID 11086137.
K. Stasiak, S. Renault, M. V. Demattei, Y. Bigot, B. A. Federici:Evidence for the evolution of ascoviruses from iridoviruses. In: The Journal of General Virology. Band84, Pt 11, November 2003, S.2999–3009, doi:10.1099/vir.0.19290-0, PMID 14573805.
B. A. Federici, D. K. Bideshi, Y. Tan, T. Spears, Y. Bigot:Ascoviruses: superb manipulators of apoptosis for viral replication and transmission. In: Current Topics in Microbiology and Immunology. Band328, 2009, ISBN 978-3-540-68617-0, S.171–196, doi:10.1007/978-3-540-68618-7_5, PMID 19216438.
B. Piégu, S. Asgari, D. Bideshi, B. A. Federici, Y. Bigot:Evolutionary relationships of iridoviruses and divergence of ascoviruses from invertebrate iridoviruses in the superfamily Megavirales. In: Molecular Phylogenetics and Evolution. Band84, März 2015, S.44–52, doi:10.1016/j.ympev.2014.12.013, PMID 25562178.
Julien Andreani, Jacques Y. B. Khalil, Emeline Baptiste, Issam Hasni, Caroline Michelle, Didier Raoult, Anthony Levasseur, Bernard La Scola: Orpheovirus IHUMI-LCC2: A New Virus among the Giant Viruses, in: Front. Microbiol., 22. Januar 2018, doi:10.3389/fmicb.2017.02643
V.G. Chinchar, T. Waltzek, K. Subramaniam, V.G. Faria, D. Ebert, J. Jancovich, P. Hick, Q.-Y. Zhang, R. Marschang, R. Whittington, T. Williams, I.A. Ince, H. Jie: 2020.018D.R.Betairidovirinae_1ngen_1nsp.zip (docx, xlsx), ICTV Proposal 2020.018D.R.Betairidovirinae_1ngen_1nsp (accepted). Hier: Fig.2 im Word-Docx
Clara Rolland, Julien Andreani, Amina Cherif Louazani, Sarah Aherfi, Rania Francis, Rodrigo Rodrigues, Ludmila Santos Silva, Dehia Sahmi, Said Mougari, Nisrine Chelkha, Meriem Bekliz, Lorena Silva, Felipe Assis, Fábio Dornas, Jacques Yaacoub Bou Khalil, Isabelle Pagnier, Christelle Desnues, Anthony Levasseur, Philippe Colson, Jônatas Abrahão, Bernard La Scola: Discovery and Further Studies on Giant Viruses at the IHU Mediterranee Infection That Modified the Perception of the Virosphere. In: Viruses, 11(4), März/April 2019, pii: E312, doi:10.3390/v11040312, PMC6520786 (freier Volltext), PMID 30935049, Fig. 2
Disa Bäckström, Natalya Yutin, Steffen L. Jørgensen, Jennah Dharamshi, Felix Homa, Katarzyna Zaremba-Niedwiedzka, Anja Spang, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Thijs J. G. Ettema; Richard P. Novick (Hrsg.): Virus Genomes from Deep Sea Sediments Expand the Ocean Megavirome and Support Independent Origins of Viral Gigantism. In: mBio, Vol.10, Nr.2, März–April 2019, S.e02497-18; mbio.asm.org (Mementodes Originals vom 29. Juni 2019 im Internet Archive)Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/mbio.asm.org (PDF); doi:10.1128/mBio.02497-18, PMC6401483 (freier Volltext), PMID 30837339, ResearchGate
