DNA-Virus
Virus, dessen Erbmaterial aus DNA besteht Aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Als DNA-Virus (Plural DNA-Viren, synonym DNS-Virus) bezeichnet man Viren, deren Erbmaterial (Genom) aus DNA (Abkürzung für englisch desoxyribonucleic acid, „Desoxyribonukleinsäure“) besteht. DNA-Viren ist eine nicht-taxonomische Sammelbezeichnung (Klassifizierung), die keine verwandtschaftlichen Bezüge enthält. Innerhalb der DNA-Viren wurden vom Internationalen Komitee für die Taxonomie von Viren (ICTV) bisher (Stand März 2019) allerdings eine Reihe von Verwandtschaftsgruppen abgegrenzt. Vom Rang her sind dies einige Ordnungen, meist aber nur Familien. Daneben gibt es Vorschläge für weitere Verwandtschaftsgruppen (Kladen), z. h. auch höher als Ordnung (s u.).
Die Einteilung der Viren in Systematiken ist kontinuierlicher Gegenstand der Forschung. So existieren neben- und nacheinander verschiedene Virusklassifikationen sowie die offizielle Virus-Taxonomie des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Die hier behandelte Gruppe ist als Taxon durch neue Forschungen obsolet geworden oder aus anderen Gründen nicht Teil der offiziellen Virus-Taxonomie.
Eigenschaften
Zusammenfassung
Kontext
Die DNA wird bei Viren in Kapside und/oder Virushüllen verpackt, so dass Viruspartikel (Virionen) entstehen. Die DNA kann im Virus doppelsträngig oder einzelsträngig vorliegen, der Strang kann aus nur einem Stück bestehen (nicht-segmentiert) oder auf verschiedene Stücke verteilt sein (segmentiert). Ebenso kann das DNA-Genom zu einem Ring geschlossen sein (zirkulär) oder als offener Strang vorliegen (linear). Das Genom einzelsträngiger DNA-Viren (ssDNA für englisch single strand desoxyribonucleic acid) kann positive, negative oder auch beide Polaritäten besitzen.
Das Genom von DNA-Viren ist im Vergleich zu RNA-Viren meist weniger variabel und gegenüber Umwelteinflüssen oft sehr stabil. Dies liegt an der höheren chemischen Stabilität der DNA gegenüber der RNA und einer geringeren Mutationsrate, da die Enzyme, die zur Vermehrung der DNA dienen (DNA-Polymerasen), eine Korrekturlesefunktion besitzen. Wichtige Ausnahme hiervon sind die Hepadnaviridae (z. B. das Hepatitis-B-Virus), da die Genomreplikation über eine RNA-Zwischenstufe und einer reversen Transkription erfolgt.
Die DNA-Polymerase der DNA-Viren kann vom Virus selbst codiert sein (z. B. bei der Familie Herpesviridae) oder das Virus kann zelluläre Polymerasen zur Vermehrung nutzen (z. B. bei den Papillomaviridae). Letzteres ist bei RNA-Viren ausgeschlossen, diese benötigen stets eine eigene virale Polymerase zur Vermehrung.
Die Koevolution von DNA-Viren und Menschen hat im Menschen verschiedene Resistenzfaktoren hervorgebracht, z. B. TLR-2, RIG-I, MDA-5, AIM-2 und NLRP3.[1]
Die meisten Onkoviren sind DNA-Viren, z. B. manche Herpesviren, manche humane Papillomviren oder das Hepatitis-B-Virus.[2]
Baltimore-Klassifikation
Zusammenfassung
Kontext
Klassifikation nach einem Vorschlag des Nobelpreisträgers David Baltimore von 1971.
Die Klassifizierung nach den Baltimore-Kriterien identifiziert nicht immer vollständige Verwandtschaftsgruppen (Kladen). Baltimore-Gruppen umfassen oft mehrere Realms, d. h. Bereiche von Viren vermutlich unterschiedlichen Ursprungs. Umgekehrt erstrecken sich manche Virentaxa über mehrere Baltimore-Gruppen, weil etwa dsDNA-Vertreter und ssDNA-Vertreter offenbar naher verwandt sind.
Eine Übersicht über die Verwandtschaftsgruppen der Viren (insbesondere die Top-Level-Taxa), d. h. die taxonomische Systematik findet sich im Artikel Virus-Taxonomie.
Baltimore-Gruppe 1
Viren mit Doppelstrang-DNA-Genom (dsDNA: englisch double stranded DNA), der normalen Genom-Form allen Lebens.[3] Enthaltene Verwandtschaftsgruppen:
- Realm Adnaviria
- Reich Zilligvirae
- Phylum Taleaviricota
- Klasse Tokiviricetes
- Ordnung Ligamenvirales (mit Lipothrixviridae, Rudiviridae, Ungulaviridae)
- Ordnung Maximonvirales (mit Ahmunviridae)
- Ordnung Primavirales (mit Tristromaviridae[4])
- Klasse Tokiviricetes
- Phylum Taleaviricota
- Reich Zilligvirae
- Realm Duplodnaviria
- Reich Heunggongvirae[5]
- Phylum Peploviricota
- Klasse Herviviricetes
- Ordnung Herpesvirales – Ordnung der Herpesviren (im weiteren Sinn, mit Orthoherpesviridae, sowie Alloherpesviridae, Malacoherpesviridae)
- Klasse Herviviricetes
- Phylum Uroviricota
- Klasse Caudoviricetes – Bakterien- und Archaeenviren mit Kopf-Schwanz-Struktur
- Ordnung Crassvirales
- Ordnung Juravirales
- Ordnung Kirjokansivirales
- Ordnung Magrovirales
- Ordnung Methanobavirales
- Ordnung Nakonvirales
- Ordnung Thumleimavirales
- etliche weitere ohne Ordnungszuweisung
- Klasse Caudoviricetes – Bakterien- und Archaeenviren mit Kopf-Schwanz-Struktur
- Phylum Peploviricota
- Reich Heunggongvirae[5]
- Realm Varidnaviria[6] (ursprünglicher Vorschlag „Divdnaviria“)
- Reich Abadenavirae
- Phylum Produgelaviricota
- Klasse Ainoaviricetes (mit Finnlakeviridae)
- Klasse Belvinaviricetes (früher Tectiliviricetes) (mit Atroposvirales: Skuldviridae, Belfryvirales: Turriviridae, Coyopavirales: Chaacviridae, , Vinavirales: Asemoviridae, Autolykiviridae, Corticoviridae, Mestraviridae, Parnassusviridae)
- Phylum Produgelaviricota
- Reich Abadenavirae
- Reich Bamfordvirae
- Phylum Nucleocytoviricota (ursprünglicher Vorschlag „Nucleocytoplasmaviricota“, früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV)
- Klasse Megaviricetes (Riesenviren)
- Klasse Mriyaviricetes (mit Yaraviridae)
- Klasse Pokkesviricetes (mit Asfarviridae und Pockenviren)
- Phylum Preplasmiviricota
- Subphylum Polisuviricotina
- Klasse Aquintoviricetes (mit Phypoliviridae)
- Klasse Pharingeaviricetes (mit Adenoviridae)
- Klasse Polintoviricetes (mit Eupolintoviridae, früher Adintoviridae[7])
- Klasse Maveriviricetes (mit Virophagen: Maviroviridae, Sputniviroviridae, …)
- Subphylum Prepoliviricotina
- Klasse Tectiliviricetes (mit Tectiviridae)
- Subphylum Polisuviricotina
- Phylum Nucleocytoviricota (ursprünglicher Vorschlag „Nucleocytoplasmaviricota“, früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV)
- Reich Bamfordvirae
- Realm Singelaviria[8]
- Reich Helvetiavirae
- Phylum Dividoviricota
- Klasse Laserviricetes (mit Halopanivirales: Matsushitaviridae, Simuloviridae, Sphaerolipoviridae)
- Phylum Dividoviricota
- Reich Helvetiavirae
- Realm Monodnaviria
- Reich Shotokuvirae
- Phylum Cossaviricota
- Klasse Papovaviricetes (Papillomviren und Polyomaviren)[9]
- Phylum Cossaviricota
- Reich Shotokuvirae
- dsDNA-Viren ohne Realm-Zuweisung:
- Ordnung Lefavirales
- Familie Baculoviridae
- Familie Hytrosaviridae
- Familie Nudiviridae
- ?Familie Polydnaviriformidae (? – ggf. ohne Gattung Ichnoviriform, d. h. nur Gattung Bracoviriform)
- Familien ohne Ordnungs-Zuweisung
- Familie Nimaviridae
- Ordnung Lefavirales
- in keinen höheren Rang klassifizierte Familien:
- Familie Ampullaviridae[10]
- Familie Bartogtaviriformidae
- Familie Brachygtaviriformidae
- Familie Bicaudaviridae[11]
- Familie Clavaviridae[12] (mit Gattung Clavavirus[13])
- Familie Eurekaviridae
- Familie Fuselloviridae[14]
- Familie Globuloviridae[15] (mit Gattung Globulovirus[16])
- Familie Guttaviridae
- Familie Halspiviridae
- Familie Huangdiviridae
- Familie Nipumfusiviridae (dsDNA, ssDNA)
- Familie Ovaliviridae
- Familie Plasmaviridae
- Familie Portogloboviridae
- Familie Rhodogtaviriformidae
- Familie Thaspiviridae
- ?Familie Polydnaviriformidae (früher Polydnaviridae vermutet polyphyletisch[17])
- Gattung Bracoviriform (früher Bracovirus)
- Gattung Ichnoviriform (früher Ichnovirus, siehe NCLDV, möglicherweise eine gemeinsame Klade mit Ascoviridae und Iridoviridae zu Nucleocytoviricota)
- ?Familie „Adomaviridae“ (vorgeschlagen), evtl. zu Papovaviricetes, obwohl diese sonst ssDNA-Viren umfassen.[18]
- in keinen höheren Rang klassifizierte Gattungen:
- Gattung Dinodnavirus (evtl. zu Nucleocytoviricota, Ordnung Asfuvirales)
- Gattung Rhizidiovirus
Baltimore-Gruppe 2
Viren mit Einzelstrang-DNA-Genom (ssDNA: englisch single stranded DNA), die Virionen enthalten DNA positiver oder negativer Polarität.[19] Enthaltene Verwandtschaftsgruppen:
- Realm Monodnaviria (hier nur ssDNA-Vertreter)
- Reich Loebvirae
- Phylum Hofneiviricota
- Klasse Faserviricetes
- Ordnung Tubulavirales
- Klasse Faserviricetes
- Phylum Hofneiviricota
- Reich Sangervirae
- Phylum Phixviricota
- Klasse Malgrandaviricetes
- Ordnung Petitvirales: +ssDNA
- Klasse Malgrandaviricetes
- Phylum Phixviricota
- Reich Shotokuvirae
- Phylum Commensaviricota
- Klasse Cardeaviricetes
- Ordnung Sanitavirales
- Familie Anelloviridae[20]
- Ordnung Sanitavirales
- Klasse Cardeaviricetes
- Phylum Cossaviricota (ohne Papovaviricetes)
- Klasse Mouviricetes
- Ordnung Polivirales (Bidnaviridae): bipartit[21]
- Klasse Quintoviricetes
- Ordnung Piccovirales (Parvoviridae)
- Klasse Mouviricetes
- Phylum Cressdnaviricota (CRESS-DNA-Viren: manche stückweise auch dsDNA,[22])
- Klasse Arfiviricetes[20]
- Ordnung Baphyvirales (Bacilladnaviridae)
- Ordnung Cirlivirales (Circoviridae,[20] Endolinaviridae, Vilyaviridae)
- Ordnung Cremevirales (Smacoviridae)[23][20]
- Ordnung Gredzevirales (Gandrviridae, Ouroboviridae)
- Ordnung Jormunvirales (Draupnirviridae)
- Ordnung Mulpavirales (Amesuviridae, Anicreviridae, Metaxyviridae, Nanoviridae, ?Alphasatellitidae)
- Ordnung Recrevirales (Redondoviridae)
- Ordnung Ringavirales (Pecoviridae)
- Ordnung Rivendellvirales (Naryaviridae)
- Ordnung Rohanvirales (Adamaviridae – ?inkl. „Circularisvirus“,[24] Kirkoviridae, Nenyaviridae)
- Ordnung Saturnivirales (Kanorauviridae, Mahapunaviridae)
- Klasse Repensiviricetes
- Ordnung Geplafuvirales (Geminiviridae, Genomoviridae, Geplanaviridae)
- CRESS-DNA-Viren ohne nähere Zuordnung
- Familie „Cruciviridae“ (vorgeschlagen, ssDNA) – Ähnlichkeit mit den Familien der Cressdnaviricota (ssDNA) im Genom als auch der Tombusviridae (+ssRNA) im Kapsid. Offenbar aus einem oder mehreren DNA-RNA-Rekombinationsereignissen entstanden, die Monophylie wird diskutiert.
- Klade „Volvovirus“ (vorgeschlagen)[25]
- Klasse Arfiviricetes[20]
- Phylum Commensaviricota
- Reich Loebvirae
- Realm Varidnaviria (hier nur ssDNA-Vertreter)
- Reich Bamfordvirae (hier nur ssDNA-Vertreter)
- Phylum Preplasmiviricota (hier nur ssDNA-Vertreter)
- Klasse Ainoaviricetes
- Ordnung Lautamovirales (Finnlakeviridae[26])
- Klasse Ainoaviricetes
- Phylum Preplasmiviricota (hier nur ssDNA-Vertreter)
- Reich Bamfordvirae (hier nur ssDNA-Vertreter)
- ssDNA-Viren ohne Realm-Zuordnung
- Familie Nipumfusiviridae (dsDNA, ssDNA)
- Familie Obscuriviridae (ssDNA)
- Familie Spiraviridae
- Familie Tolecusatellitidae
Sonderfälle Gruppe 1/2
Gruppen mit Vertretern der Baltimore-Gruppen 1 wie auch 2 und unsichere Zuordnung
- Realm Monodnaviria
- Reich Trapavirae
- Phylum Saleviricota
- Klasse Huolimaviricetes (ssDNA+dsDNA)
- Ordnung Haloruvirales (Pleolipoviridae)
- Klasse Huolimaviricetes (ssDNA+dsDNA)
- Phylum Saleviricota
- Reich Trapavirae
Literatur
- Susanne Modrow, Dietrich Falke, Uwe Truyen: Molekulare Virologie. Eine Einführung für Biologen und Mediziner. 2. Auflage. Spektrum-Lehrbuch, Heidelberg 2002, ISBN 3-8274-1086-X. (mit Literaturangaben, englische Übersetzung, Ausgabe 2006).
- David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology. 2 Bände. 5. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7 – Standardwerk der Virologie.
- H. W. Doerr, W. H. Gerlich (Hrsg.): Medizinische Virologie. 2. Auflage, Stuttgart 2010. ISBN 978-3-13-113962-7.
Weblinks
- MeSH Viruses DNA-Virus
- Swiss Institute of Bioinformatics (SIB): Single Strand DNA Viruses – Taxonomy., Single Strand DNA Viruses – Virions. auf: viralzone.expasy.org
- SIB: Double Strand DNA Viruses – Taxonomy., Double Strand DNA Viruses – Virions. auf: viralzone.expasy.org
Einzelnachweise
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