ljudski hromosom From Wikipedia, the free encyclopedia
Hromosom 1 je oznaka za najveći ljudski hromosom. Ljudi imaju dvije kopije hromosoma 1, kao i svih autosoma, koji nisu spolni hromosomi. Hromosom 1 obuhvata oko 249 miliona nukleotidnih baznih parova, koji su osnovne jedinice informacija za DNK.[5] Predstavlja oko 8% ukupne DNK u ljudskim ćelijama.[6]
Hromosom 1 | |
---|---|
Karakteristike | |
Dužina (bp) | 248,956,422 bp (GRCh38)[1] |
Br. gena | 1.961 (CCDS)[2] |
Vrsta | Autosom |
Pozicija centromere | Metacentrik[3] (123.4 Mbp[4]) |
Kompletan spisak gena | |
CCDS | Spisak gena |
HGNC | Spisak gena |
UniProt | Spisak gena |
NCBI | Spisak gena |
Vanjski preglednici karata | |
Ensembl | Hromosom 1 |
Entrez | Hromosom 1 |
NCBI | Hromosom 1 |
UCSC | Hromosom 1 |
Potpune DNK sekvence | |
RefSeq | NC_000001 (FASTA) |
GenBank | CM000663 (FASTA) |
Bio je to posljednji završeni hromosom, sekvenciran dvije decenije nakon početka Projekta ljudskog genoma.
Hromosom 1 je najveći autosomni hromosom u kariotipu čovjeka koji je zajedno sa hromosomima 2 i 3 svrstan u grupu A. Prema položaju centromere pripada metacentričnim hromosomima (vidi sliku). Na dužem kraku (q krak), odmah ispod centromere hromosoma 1 nalazi se sekundarno suženje . Sastoji se od 263 miliona baznih parova (bp), što čini skoro 8% ukupne DNK genoma čovjeka.[7]
Slijede neke od procjena broja gena za ljudski hromosom 2. Budući da istraživači koriste različite pristupe genomu, njihovo predviđanje broja gena na svakom hromosomu varira. Među raznim projektima, zajednički Projekt konsenzusnog kodiranja (CCDS) zauzima izuzetno konzervativnu strategiju. Dakle, predviđanje broja gena po CCDS–u predstavlja donju granicu ukupnog broja gena koji kodiraju ljudske proteine.[8]
Baza podataka | Protein-kodirajući geni | Geni nekodirajuće RNK | Pseudogeni | Izvor | Datum objave | |
---|---|---|---|---|---|---|
1.961 | — | — | [2] | 2016-09-08 | ||
1.993 | 707 | 1.113 | [9] | 2017-05-12 | ||
2.044 | 1.924 | 1.223 | [10] | 2017-03-29 | ||
2.064 | — | — | [11] | 2018-02-28 | ||
2.093 | 1.790 | 1.426 | [12][13][14] | 2017-05-19 |
Slijedi djelimična lista gena na ljudskom hromosomu 1. Za kompletnu listu pogledajte link u infokutiji sa desne strane
Djelimična lista gena na p-kraku (kratki krak) ljudskog hromosoma 1:
Djelomična lista gena smještenih na dudgom q-kraku ljudskog hromosma 1:
Postoji 890 poznatih bolesti povezanih sa ovim hromosomom.Neke od ovih bolesti su gubitak sluha, Alzheimerova bolest, glaukom i rak dojke. Preuređenje i mutacije hromosoma 1 preovlađuju kod kancera i mnogih drugih bolesti. Obrasci varijacije sekvence otkrivaju signale nedavne selekcije u specifičnim genima koji mogu doprinijeti ljudskoj kondiciji, kao i u regijama u kojima nije vidljiva nikakva funkcija.
Potpuna monosomija (samo jedna kopija cijelog hromosoma) je uvijek smrtonosna prije rođenja.[15] Potpuna trisomija (sa tri kopije cijelog hromosoma) je smrtonosna u roku od nekoliko dana nakon začeća.[15] Neke djelimične delecije i djelimične duplikacije proizvode urođene mahane.
Sljedeće bolesti su neke od onih koje se odnose na gene na hromozomu 1 (koji sadrži najpoznatije genetičke bolesti bilo kojeg ljudskog hromosoma):
Hromosom | Krak[20] | Pruga[21] | ISCN start[22] |
ISCN stop[22] |
Bazni par start |
Bazni par stop |
Boja[23] | Gustoća |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | p | 36.33 | 0 | 100 | 1 | 2.300.000 | gneg | |
1 | p | 36.32 | 100 | 244 | 2.300.001 | 5.300.000 | gpos | 25 |
1 | p | 36.31 | 244 | 344 | 5.300.001 | 7.100.000 | gneg | |
1 | p | 36.23 | 344 | 459 | 7.100.001 | 9.100.000 | gpos | 25 |
1 | p | 36.22 | 459 | 660 | 9.100.001 | 12.500.000 | gneg | |
1 | p | 36.21 | 660 | 861 | 12.500.001 | 15.900.000 | gpos | 50 |
1 | p | 36.13 | 861 | 1206 | 15.900.001 | 20.100.000 | gneg | |
1 | p | 36.12 | 1206 | 1321 | 20.100.001 | 23.600.000 | gpos | 25 |
1 | p | 36.11 | 1321 | 1521 | 23.600.001 | 27.600.000 | gneg | |
1 | p | 35.3 | 1521 | 1651 | 27.600.001 | 29.900.000 | gpos | 25 |
1 | p | 35.2 | 1651 | 1780 | 29.900.001 | 32.300.000 | gneg | |
1 | p | 35.1 | 1780 | 1895 | 32.300.001 | 34.300.000 | gpos | 25 |
1 | p | 34.3 | 1895 | 2210 | 34.300.001 | 39.600.000 | gneg | |
1 | p | 34.2 | 2210 | 2411 | 39.600.001 | 43.700.000 | gpos | 25 |
1 | p | 34.1 | 2411 | 2770 | 43.700.001 | 46.300.000 | gneg | |
1 | p | 33 | 2770 | 2986 | 46.300.001 | 50.200.000 | gpos | 75 |
1 | p | 32.3 | 2986 | 3273 | 50.200.001 | 55.600.000 | gneg | |
1 | p | 32.2 | 3273 | 3416 | 55.600.001 | 58.500.000 | gpos | 50 |
1 | p | 32.1 | 3416 | 3732 | 58.500.001 | 60.800.000 | gneg | |
1 | p | 31.3 | 3732 | 3976 | 60.800.001 | 68.500.000 | gpos | 50 |
1 | p | 31.2 | 3976 | 4206 | 68.500.001 | 69.300.000 | gneg | |
1 | p | 31.1 | 4206 | 4852 | 69.300.001 | 84.400.000 | gpos | 100 |
1 | p | 22.3 | 4852 | 5210 | 84.400.001 | 87.900.000 | gneg | |
1 | p | 22.2 | 5210 | 5440 | 87.900.001 | 91.500.000 | gpos | 75 |
1 | p | 22.1 | 5440 | 5741 | 91.500.001 | 94.300.000 | gneg | |
1 | p | 21.3 | 5741 | 5957 | 94.300.001 | 99.300.000 | gpos | 75 |
1 | p | 21.2 | 5957 | 6029 | 99.300.001 | 101.800.000 | gneg | |
1 | p | 21.1 | 6029 | 6244 | 101.800.001 | 106.700.000 | gpos | 100 |
1 | p | 13.3 | 6244 | 6459 | 106.700.001 | 111.200.000 | gneg | |
1 | p | 13.2 | 6459 | 6660 | 111.200.001 | 115.500.000 | gpos | 50 |
1 | p | 13.1 | 6660 | 6861 | 115.500.001 | 117.200.000 | gneg | |
1 | p | 12 | 6861 | 7048 | 117.200.001 | 120.400.000 | gpos | 50 |
1 | p | 11.2 | 7048 | 7119 | 120.400.001 | 121.700.000 | gneg | |
1 | p | 11.1 | 7119 | 7335 | 121.700.001 | 123.400.000 | acen | |
1 | q | 11 | 7335 | 7579 | 123.400.001 | 125.100.000 | acen | |
1 | q | 12 | 7579 | 8483 | 125.100.001 | 143.200.000 | gvar | |
1 | q | 21.1 | 8483 | 8756 | 143.200.001 | 147.500.000 | gneg | |
1 | q | 21.2 | 8756 | 8957 | 147.500.001 | 150.600.000 | gpos | 50 |
1 | q | 21.3 | 8957 | 9244 | 150.600.001 | 155.100.000 | gneg | |
1 | q | 22 | 9244 | 9459 | 155.100.001 | 156.600.000 | gpos | 50 |
1 | q | 23.1 | 9459 | 9832 | 156.600.001 | 159.100.000 | gneg | |
1 | q | 23.2 | 9832 | 10048 | 159.100.001 | 160.500.000 | gpos | 50 |
1 | q | 23.3 | 10048 | 10349 | 160.500.001 | 165.500.000 | gneg | |
1 | q | 24.1 | 10349 | 10507 | 165.500.001 | 167.200.000 | gpos | 50 |
1 | q | 24.2 | 10507 | 10679 | 167.200.001 | 170.900.000 | gneg | |
1 | q | 24.3 | 10679 | 10894 | 170.900.001 | 173.000.000 | gpos | 75 |
1 | q | 25.1 | 10894 | 11009 | 173.000.001 | 176.100.000 | gneg | |
1 | q | 25.2 | 11009 | 11196 | 176.100.001 | 180.300.000 | gpos | 50 |
1 | q | 25.3 | 11196 | 11598 | 180.300.001 | 185.800.000 | gneg | |
1 | q | 31.1 | 11598 | 11827 | 185.800.001 | 190.800.000 | gpos | 100 |
1 | q | 31.2 | 11827 | 11942 | 190.800.001 | 193.800.000 | gneg | |
1 | q | 31.3 | 11942 | 12172 | 193.800.001 | 198.700.000 | gpos | 100 |
1 | q | 32.1 | 12172 | 12617 | 198.700.001 | 207.100.000 | gneg | |
1 | q | 32.2 | 12617 | 12803 | 207.100.001 | 211.300.000 | gpos | 25 |
1 | q | 32.3 | 12803 | 13033 | 211.300.001 | 214.400.000 | gneg | |
1 | q | 41 | 13033 | 13320 | 214.400.001 | 223.900.000 | gpos | 100 |
1 | q | 42.11 | 13320 | 13406 | 223.900.001 | 224.400.000 | gneg | |
1 | q | 42.12 | 13406 | 13607 | 224.400.001 | 226.800.000 | gpos | 25 |
1 | q | 42.13 | 13607 | 13966 | 226.800.001 | 230.500.000 | gneg | |
1 | q | 42.2 | 13966 | 14153 | 230.500.001 | 234.600.000 | gpos | 50 |
1 | q | 42.3 | 14153 | 14397 | 234.600.001 | 236.400.000 | gneg | |
1 | q | 43 | 14397 | 14756 | 236.400.001 | 243.500.000 | gpos | 75 |
1 | q | 44 | 14756 | 15100 | 243.500.001 | 248.956.422 | gneg |
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.