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長崎県北部の主要都市である佐世保市の中心駅であり、JR九州の佐世保線と松浦鉄道の西九州線の2路線が乗り入れている。両路線とも当駅が終点で全列車が当駅始発・終着で運転される。2009年3月14日から、松浦鉄道の列車が1往復JR線に直通運転を行っていたが、2020年3月14日のダイヤ改正で直通運転を休止した。佐世保線と西九州線の他、早岐駅を起点とするJR九州大村線の列車もほとんどが当駅を始発・終着としており、利用可能である。
西九州線はかつて日本国有鉄道(国鉄)→JR九州が松浦線として管轄していたが、1988年4月1日に松浦鉄道に経営移管されたのに合わせて西九州線に改称した。同時に当駅はJRグループ全駅中最西端の駅かつ日本最西端の終着駅となった(これはJRも松浦鉄道も当駅を終点としているため)。
※高架化前(旧駅時代)はJR九州では最後となる赤帽が配置されている駅であった。
JR・松浦鉄道の両社一体の高架駅であり、高架下は駅舎・コンコースとなっている。国道側は「東口」、佐世保港側は「みなと口」となっており、東口側から見て左がJR九州の駅、右が松浦鉄道の駅となっている。JR九州、松浦鉄道とも有人駅で自動券売機を備えている。
JR九州の窓口は高架下にありみどりの窓口を備えている[2]。なお松浦鉄道は当駅を含めて自動改札機は一切設置していないため、当駅は九州最西端の自動改札機設置駅となる。松浦鉄道の窓口は高架部(ホーム)にあり、窓口そばに自動券売機があるが、窓口の営業時間外には券売機は使用できない。なお松浦鉄道は終日車内精算で、乗車時に整理券を取り、降車時に運賃または切符と引き換えに精算証明書を運転士または車掌から受け取る。また松浦鉄道ではnimoca(SUGOCAなどの相互利用可能ICカードを含む)が利用可能であるが駅構内に対応機器はなく、車内のカードリーダーに触れることで精算を行う。
コンコース内にはKIOSKやファミリーマートをはじめとする売店、佐世保観光情報センターなどがある。東口側には佐世保バーガーの店である「ログキット」もある。
JR九州は島式ホーム3面6線、松浦鉄道は島式ホーム1面2線を有しており、いずれも東口側からみなと口側に向かって1番のりばから6番のりば(JR九州)または2番のりば(松浦鉄道)まで付番されている。JR九州のホームは改札口から続く連絡通路を介してそれぞれ結ばれており、松浦鉄道のホームにはコンコースから直接階段またはエスカレーターによって行き来する。JR九州のホームにはそれぞれエスカレーターとエレベーターが備えられている。
なお、2020年8月8日よりJR5・6番のりばは使用休止となり(それまでは早朝の佐世保線普通列車3本と、18時台の普通列車5本及び「シーサイドライナー」1本が使用していた)、立ち入りできなくなっている[10]。
JR1・2番のりばホームと松浦鉄道のホームは一体となっており、境界部に松浦鉄道管理の連絡改札がある。JR2番のりばは佐世保線と西九州線の直通が可能であるため、直通列車はこのホームを使用する。ただし2020年3月14日以降はJR線と松浦鉄道線を直通する定期列車は設定されていない。
2024年度に佐世保駅から佐賀方面、ハウステンボス駅までのSUGOCA対応予定(長崎方面には使えない)
年度 | JR九州 | 松浦鉄道 | ||
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1日平均 乗車人員 |
1日平均 乗降人員 |
1日平均 乗車人員 |
1日平均
降車人員 | |
2000年 | 3,437 | 1,177 | 589 | |
2001年 | 3,500 | 1,135 | 566 | |
2002年 | 3,605 | 1,123 | 561 | |
2003年 | 3,651 | 1,178 | 601 | |
2004年 | 3,697 | 1,174 | 554 | |
2005年 | 3,781 | 1,197 | 588 | |
2006年 | 3,762 | 1,294 | 691 | |
2007年 | 3,744 | 1,202 | 617 | |
2008年 | 3,770 | 1,264 | 650 | |
2009年 | 3,612 | 1,382 | 727 | |
2010年 | 3,635 | 1,271 | 670 | |
2011年 | 3,612 | 1,271 | 670 | |
2012年 | 3,691 | 1,280 | 675 | |
2013年 | 3,888 | 1,443 | 744 | |
2014年 | 3,946 | 1,414 | 729 | |
2015年 | 4,076 | 1,433 | 739 | |
2016年 | 3,973 | 1,498 | 782 | |
2017年 | 3,935 | 1,514 | 789 | |
2018年 | 3,838 | 1,844 | 930 | |
2019年 | 3,664 | 1,701 | 895 | 811 |
2020年 | 2,391 | 1,392 | 730 | 662 |
2023年 | 3,399 |
再開発が続いており、駅周辺では分譲マンションなどの建設ラッシュとなっている。
※元々は佐世保市営バスのバスターミナルであったが、2019年3月を以って同市交通局の閉局に伴い、路線を引き継いだ西肥バスならびにさせぼバスが使用している。
高速バスは、駅東口を出て国道35号を挟み右正面の佐世保バスセンターから発着している。
一般路線バスは、駅東口から国道35号を越えた先にバスのりば(旧・佐世保市営バスのターミナル)があり、ここから西肥バスにより市内各地へのバスが出ている。黒髪・早岐方面及び矢峰・柚木方面への便はターミナルに入らずに国道上のバス停に発着する。バス停の名称はいずれも「佐世保駅前」である。
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