Asun

Razdvojni proteinski homolog (Asun), znan i kao homologni regulator Mat89Bb ćelijskog ciklusa je protein koji je kod ljudi kodiran genom Asun.^[5][6]

Asun
Identifikatori
Aliasi	INTS13
Vanjski ID-jevi	OMIM: 615079 MGI: 1918427 HomoloGene: 10043 GeneCards: INTS13
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 12 (čovjek)[1] Bend 12p11.23 Početak 26,905,181 bp[1] Kraj 26,938,326 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 6 (miš)[2] Bend 6|6 G3 Početak 146,549,632 bp[2] Kraj 146,577,835 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • citoplazma • nukleoplazma • jedro Biološki proces • centrosome localization • regulation of fertilization • flagellated sperm motility • GO:0043148 mitotic spindle organization • ćelijski ciklus • protein localization to nuclear envelope • regulation of mitotic cell cycle • Ćelijska dioba • snRNA transcription by RNA polymerase II Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	55726	71177
Ensembl	ENSG00000064102	ENSMUSG00000040250
UniProt	Q9NVM9	Q8QZV7
RefSeq (mRNK)	NM_018164	NM_138757
RefSeq (bjelančevina)	NP_060634	NP_620096 NP_001349035 NP_001349036 NP_001349037
Lokacija (UCSC)	Chr 12: 26.91 – 26.94 Mb	Chr 6: 146.55 – 146.58 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Analizom genomskih sekvenci, Bourdon et al. (2002) mapirali su gen ASUN na hromosomu 12, sekvenca p12-p11. Utvrdili su da ASUN gen sadrži 17 egzona i da ima oko 32,8 kb.^[7] Koristeći kombinovanu uporednu genomsku hibridizaciju i ekspresijsku analizu sekvence EST, za identifikaciju gena u regiji hromosoma 12 pojačanog u seminomima i u ćelijskoj liniji karcinoma jajnika u poređenju sa normalnim tkivom, Bourdon et al. (2002) identificirali su ASUN, koji su označili kao GCT1. RT-PCR analiza otkrila je ekspresiju ASUN-a u svih 16 pregledanih normalnih ljudskih tkiva. Ekspresija ASUN-a bila je povišena u većini seminoma u usporedbi s normalnim sjemenicima. Pretražujući baze podataka, Anderson et al. (2009) identificirali su ASUN-ske ortologe u Drosophila i C. elegans. Kod vinskih mušica, činilo se da je ekspresija Asuna specifična za zametnu liniju.^[8]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 706 aminokiselina, a molekulska težina 80.225 Da.^[9].

10		20		30		40		50
MKIFSESHKT		VFVVDHCPYM		AESCRQHVEF		DMLVKNRTQG		IIPLAPISKS
LWTCSVESSM		EYCRIMYDIF		PFKKLVNFIV		SDSGAHVLNS		WTQEDQNLQE
LMAALAAVGP		PNPRADPECC		SILHGLVAAV		ETLCKITEYQ		HEARTLLMEN
AERVGNRGRI		ICITNAKSDS		HVRMLEDCVQ		ETIHEHNKLA		ANSDHLMQIQ
KCELVLIHTY		PVGEDSLVSD		RSKKELSPVL		TSEVHSVRAG		RHLATKLNIL
VQQHFDLAST		TITNIPMKEE		QHANTSANYD		VELLHHKDAH		VDFLKSGDSH
LGGGSREGSF		KETITLKWCT		PRTNNIELHY		CTGAYRISPV		DVNSRPSSCL
TNFLLNGRSV		LLEQPRKSGS		KVISHMLSSH		GGEIFLHVLS		SSRSILEDPP
SISEGCGGRV		TDYRITDFGE		FMRENRLTPF		LDPRYKIDGS		LEVPLERAKD
QLEKHTRYWP		MIISQTTIFN		MQAVVPLASV		IVKESLTEED		VLNCQKTIYN
LVDMERKNDP		LPISTVGTRG		KGPKRDEQYR		IMWNELETLV		RAHINNSEKH
QRVLECLMAC		RSKPPEEEER		KKRGRKREDK		EDKSEKAVKD		YEQEKSWQDS
ERLKGILERG		KEELAEAEII		KDSPDSPEPP		NKKPLVEMDE		TPQVEKSKGP
VSLLSLWSNR		INTANSRKHQ		EFAGRLNSVN		NRAELYQHLK		EENGMETTEN
GKASRQ

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

Funkcija gena

Lee et al. (2005) otkrili su da je degradacija Mat89bb poremetila brzo odvijanje prelaza S faza–M faza karakteristično za rane embrione Drosophila i Xenopus. U HeLa ćelijama, poremetila je kasniju fazu mitoze i rezultiralo višejedrnim ćelijama.^[10]

Jodoin et al. (2012) otkrili su da je razgradnja ASUN-a u ćelijskim linijama ljudi smanjila perijedarnu lokalizaciju dineina, što je bitno za pravilno vezivanje centrosoma na jedarnu ovojnicu pri G2/M. Posljedično, dovela je do mitotskih defekata, uključujući odvajanje jedro-centrosom, abnormalna vretena i višejedrne ćelije. Također rezultirala je pogrešnom lokalizacijom dineinskog adaptera LIS1 (PAFAH1B1). Analiza koimunoprecipitacije pokazala je da je ASUN direktno stupio u interakciju s LIS1, ali ne i s dineinom, te posredovao perijedarno obogaćivanje LIS1 na G2/M.^[11]

Životinjski model

Anderson et al. (2009) otkrili su da je nokautiranje Asuna u Drosophila uzrokovalo defekt u spermatogenezi, sa zaustavljanjem spermatocita tokom profaze mejoze I i defektima u sprezi jedro-centrosom. Spermatociti koji su prebrodili zadržavanje pokazali su nedostatke u sastavu mejotskog vretena, segregaciji hromosoma i citokinezi. U Asun mutantnim spermatocitima i spermatidama, kompleksi dinein-dinaktin, koji posreduju u interakcijama jedro-centrosom/bazno tijelo, nisu se uspjeli lokalizirati na površini jedra.

Jodoin et al. (2012) otkrili su da je ekspresija Asun-a zametne linije miša spasila neplodnost i pogrešnu lokalizaciju dineina u mutantnim Asun drozofilama.

Reference

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000064102 - Ensembl, maj 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040250 - Ensembl, maj 2017
3. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. Bourdon V, Naef F, Rao PH, Reuter V, Mok SC, Bosl GJ, Koul S, Murty VV, Kucherlapati RS, Chaganti RS (Nov 2002). "Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes". Cancer Res. 62 (21): 6218–23. PMID 12414650.
6. "Entrez Gene: C12orf11 chromosome 12 open reading frame 11".
7. Bourdon, V., Naef, F., Rao, P. H., Reuter, V., Mok, S. C., Bosl, G. J., Koul, S., Murty, V. V. V. S., Kucherlapati, R. S., Chaganti, R. S. K. Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes. Cancer Res. 62: 6218-6223, 2002. PubMed: 12414650
8. Anderson, M. A., Jodoin, J. N., Lee, E., Hales, K. G., Hays, T. S., Lee, L. A. Asunder is a critical regulator of dynein-dynactin localization during Drosophila spermatogenesis. Molec. Biol. Cell 20: 2709-2721, 2009. PubMed: 19357193
9. "UniProt, Q9NVM9". Pristupljeno 7. 8. 2021.
10. Lee, L. A., Lee, E., Anderson, M. A., Vardy, L., Tahinci, E., Ali, S. M., Kashevsky, H., Benasutti, M., Kirschner, M. W., Orr-Weaver, T. L. Drosophila genome-scale screen for PAN GU kinase substrates identifies Mat89Bb as a cell cycle regulator. Dev. Cell 8: 435-442, 2005. PubMed: 15737938
11. Jodoin, J. N., Shboul, M., Sitaram, P., Zein-Sabatto, H. Human Asunder promotes dynein recruitment and centrosomal tethering to the nucleus at mitotic entry. Molec. Biol. Cell 23: 4713-4724, 2012. PubMed: 23097494

Dopunska literatura

• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
• Lee SY, Obata Y, Yoshida M, et al. (2003). "Immunomic analysis of human sarcoma". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (5): 2651–6. doi:10.1073/pnas.0437972100. PMC 151395. PMID 12601173.
• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.