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雙邊關係 来自维基百科，自由的百科全书
中华民国—日本关系（日语：日本と中華民国の関係），是指中华民国与日本国之间的各种双边关系，中华民国政府迁台后又称台日关系。
两国在1972年9月29日前有官方外交关系。在日本与中华人民共和国建交，与中华民国断交后，双方虽受制于一个中国政策，但因历史上的密切关系以及地缘政治上的相依，除了非正式的政治互动外，更在经济、贸易、文化等各层面维持紧密的交流。目前双方政府均在对方首都与重要城市互设代表机构及分处。
1972年12月1日，中华民国成立亚东关系协会与日本以民间团体名义设立的财团法人交流协会[注 2]共同签署《互设驻外办事处协议书》。根据此协议，中华民国于日本东京设立具大使馆功能的台北驻日经济文化代表处（日文：台北駐日経済文化代表処。原亚东关系协会驻日本代表处，于1992年5月20日更名），并于大阪、横滨、札幌、福冈、那霸设立具领事馆功能的办事处；日本则于台北、高雄设立类似功能的事务所。此协议承诺相互保护各自的权益，发给签证、推动经贸、学术、科技、文化及体育交流等业务。为发展观光，台湾观光协会也在东京与大阪设立事务所。[6][2][7][8][9]
2012年4月1日，财团法人交流协会更名为公益财团法人交流协会。
2017年1月1日，再更名为公益财团法人日本台湾交流协会（日文：公益財団法人日本台湾交流協会）。1月3日，举行揭牌仪式，由日本驻台代表沼田干夫、亚东关系协会会长邱义仁、中华民国外交部常务次长李澄然共同主持。沼田指出这是台日关系新的出航日，盼日后与亚东关系协会一起为日台目前最佳关系“再上一层楼”。沼田也介绍协会名称上出现的两朵花标志，在“日”字样上出现的是中华民国国花“梅花”，在“台”字样上出现则是日本国花“樱花”。[注 3][11]
2017年3月，中华民国行政院核定亚东关系协会改名为台湾日本关系协会（日文：台湾日本関係協会）。[12]5月17日，举行揭牌仪式，由立法院副院长蔡其昌、外交部长李大维、台湾日本关系协会会长邱义仁、日本驻台代表沼田干夫共同主持。邱义仁表示，有些人不清楚“亚东关系协会”的职掌范围，例如“夏威夷的事情能否帮忙？”今日改名后，让“台湾日本关系协会”的工作性质更清楚；沼田干夫则强调，希望此次更名作为契机，日台团结一心，共同建立起世界少见的友情。[13]
2018年3月7日，中华统一促进党因不满台湾渔船3日在台日重叠专属经济海域遭到日本海上保安厅船舰以水柱驱赶，党部主委陈清峰率众从彰化县北上前往台北市的日本台湾交流协会抗议，并在大楼前的石碑上泼红漆，随即遭警方依违反《社会秩序维护法》逮捕裁罚。[14][15]
2018年9月6日，日本“慰安妇之真相国民运动”等16个民间团体要求撤除位于台南市的台湾首座慰安妇铜像，团体代表藤井实彦疑似偷踹铜像，并于8日离境，中国国民党台南市党部主委谢龙介与中华统一促进党10日分别前往日本台湾交流协会表达谴责并要求道歉。统促党成员李承龙等人在日本台湾交流协会大门前泼漆，警方依数项罪名将其侦办。[16][17]
2018年9月14日，于该年7月上任的台北驻大阪经济文化办事处长苏启诚在住处上吊轻生，遗书里表示，燕子台风侵袭日本造成关西国际机场关闭时，对于台湾旅客滞留机场的处理遭受批评一事让他感到痛苦。[18]
1973年1月，日本自由民主党国会议员成立“日华关系议员恳谈会”。1997年2月5日，与新进党在1995年成立的“日华议员连盟”合并，扩大成立“日华议员恳谈会”，简称“日华恳”。2006年4月26日，自民党青壮派国会议员成立“促进日本台湾经济文化交流年轻议员之会”（日文：日台経済文化交流を促進する若手議員の会），简称“日台年轻议连”。[19]
1997年5月28日，日本民主党成立“民主党日华友好议员连盟”，后于2000年5月4日改组为“日台友好议员恳谈会”，简称“日台恳”；[19]2004年5月，民主党另成立“日本台湾安保经济研究会”。[20]
2008年5月15日，中华民国立法院成立“台日交流联谊会”。[19]2012年4月20日，另成立“台湾与日本国会议员友好协会”。[20]
1972年，美国宣布将包含钓鱼岛及其附属岛屿（日本称尖阁诸岛）在内的琉球群岛还给日本，中华民国政府发表声明表示对钓鱼岛拥有主权，不承认此举。“钓鱼岛归属问题”由是产生。
虽然中华民国与日本关系基本友好，但在钓鱼岛归属问题上有着相当大的歧见。该岛现由日本实际管辖，但台湾渔民认为当地海域属台湾传统渔场，导致台湾渔民、海巡署与日本海上保安厅时有冲突事件传出，最近的一次是发生于2008年6月的联合号海钓船事件[21]，台北方面召回当时的驻日代表许世楷以示严正抗议[22]，最后日本政府同意道歉并赔偿相关损失。[23]
2012年9月25日，为抗议日本将钓鱼岛国有化和争取渔业权，宜兰县苏澳镇50多艘渔船前往钓鱼岛附近海域陈情抗议，并在海巡署舰艇护卫下和日本海上保安厅船只对峙。事后在外相玄叶光一郎呼吁下，同年11月双方重启中断三年的渔业权问题谈判。
2013年4月10日，台日双方在台北宾馆正式签署《台日渔业协议》，就双方重叠专属经济海域的渔权与渔船作业安排达成共识，共享钓鱼岛及其附属岛屿12海里外海域的渔业资源。[24][25]日本内阁总理大臣安倍晋三于12日表示：台湾是重要伙伴，台日签署渔业协议对双方都很好。[26]
2015年7月23日，前中华民国总统李登辉到东京的日本外国特派员协会演讲，被记者问到钓鱼岛主权问题，答道：“我讲过好几次了，尖阁诸岛是日本的，不是台湾的。”值得注意的是，记者当时提问是用日本的名称“尖阁诸岛”和中国大陆的名称“钓鱼岛”并用，李登辉回答从头到尾都是用“尖阁诸岛”，一次也没提到“钓鱼岛”。[27]
2020年6月6日，对于日本冲绳县石垣市有意将钓鱼岛及其附属岛屿的地籍名称从登野城更名为“登野城尖阁”，中华民国外交部表示“钓鱼岛及其附属岛屿是我国固有领土，毋庸置疑，我国拥有钓鱼岛及其附属岛屿主权的事实，不会因为任何国家将该列屿改名而有任何改变，我方已向日方表达关切，并呼吁日方秉持和平理性态度、审慎处理。”[28]10日，中华民国总统蔡英文对于宜兰县长林姿妙邀请一同“登岛”挂门牌[注 4]、护主权表示，钓鱼岛是中华民国领土，呼吁各方搁置争议、共同开发，以和平方式解决钓鱼岛争议，中央政府一定会依情势审慎处理，一方面确保主权立场，一方面也能维持区域的和平稳定。[29]11日，宜兰县议会通过将钓鱼岛及其附属岛屿改名为“头城钓鱼岛”，宜兰县政府表示将依法研议办理。[30]对于驻那霸办事处两度致电石垣市长中山义隆吁请审慎自制，中山义隆回应指出，该案起因是中国海警船近期频繁进出该海域引发民众强烈反弹，故旧案重提，据以反制。[31]22日，石垣市议会通过更名议案，自10月1日起生效。中华民国外交部则表示概不承认。[32]
日本认定冲之鸟为岛屿，并以此划定专属经济区，但此主张并未完全获得联合国的认可[33]。日本2008年起向联合国大陆架界限委员会（Commission on the Limits of the Continental Shelf，CLCS）提出“认可日本拥有冲之鸟岛海域等周边7个海域的74万平方公里的外大陆架”之申请，但是委员会将冲之鸟视为岩礁而不是岛屿，根据《联合国海洋法公约》，岩礁不能算做大陆架的定点，因此联合国大陆架委员会最终（2012年）只认可了日本不含冲之鸟岛的太平洋4个海域、总面积约31万平方公里的外大陆架[34][35]。
2016年4月25日，日本公务船在冲之鸟附近公海海域扣押台湾渔船“东圣吉16号”，日本保安厅限26日中午以前收到保证金170万新台币，才放船及船上10人。否则将以直升机将船长带往附近小岛，再转机至日本，渔船也将同时拖往日本。一旦人船扣进日本，将判决渔船侵入日本领海，到时就必须付更高额的罚金。[36]行政院院长张善政痛批，日本这种作风非常不好，不只是外交部抗议，不管他是院长或卸任后民众的角度，“一个9平方米，3个榻榻米大的一块地，怎么可以叫做岛？”他说，用9平方米就去延伸两百海里的经济海域，“各位你们用膝盖想有这种事情吗？日本一个国际上堂堂大国可以干这种事吗？非常不合理！”[37]张善政并呼吁，日本不应再强辩冲之鸟是岛，不然“他们请那设籍的100多名议员上去，过一个礼拜看看。”[38]
2020年3月24日，日本公务船在重叠经济海域驱赶两艘台湾渔船。5月4日，中华民国国家安全局局长邱国正在立法院证实，日本近期曾两度示警，要求台湾渔船不可再前往冲之鸟水域捕鱼，“我方当然不接受”。国防部长严德发则表示，海军在冲之鸟水域的台湾“东北角、东南角”海域护渔区都有舰艇支援海巡执法。[39]
2015年4至5月间，中华民国政府为加强食安把关，禁止福岛、栃木、茨城、千叶及群马受核灾影响的五县之所有食品输入。另要求其余都府道县的食品须附产地证明，部分地区生产的茶叶、婴儿食品、乳制品、水产品等则要附辐射检测证明。引起安倍内阁关切，认为规范太严格，希望撤除。并先后派出农林水产省官员及岸信夫、萩生田光一等国会议员抵台沟通。[40][41][42][43]
2016年11月29日，在台北举行的第41届台日经贸会议开幕，日本交流协会会长大桥光夫致辞时说，关于核灾食品，台湾部分“无依据发言”造成日本人民“大大伤害”，盼尽速解禁，让此议题成为瞩目焦点。亚东关系协会副秘书长蔡伟淦则以“外交部长李大维曾在立法院表示，不会在经贸会议中讨论本议题”回应，并强调食安在台湾备受关注、仍有歧见，盼日方了解，“这个话题就此打住”。经济部长李世光也说，食品未列入此次讨论议题。[44]而日方农医组代表在小组会议上表示关切，盼台方早日放宽进口管制。[45]
2017年3月25日，日本总务副大臣赤间二郎来台宣传日本观光活动，于受访时表示目前福岛灾区已经重建完备，灾区生产的产品也通过周全检查，并在日本销售，希望台湾民众有一天也可以吃到，不过重要的还是台湾民意。[46]
2018年11月24日，由中国国民党副主席郝龙斌领衔提出的“维持禁止进口日本核灾地区食物”公民投票[注 5]，以779万票赞成、223万票反对，顺利过关，公投效力将维持两年。25日，日本台湾交流协会台北事务所代表沼田干夫发表声明深感遗憾，并表示为了避免此问题被当作工具伤害日台友好，将继续努力让台湾朋友理解日本食品的安全性。[47]29日，日本外务大臣河野太郎在参议院外交国防委员会答询时亦表示极为遗憾，不排除透过世界贸易组织（WTO）提告。[48]12月7日，河野太郎再表示台湾可能因此无法加入《全面且先进的跨太平洋伙伴关系协定》（CPTPP）。[49]
2020年11月24日，“维持禁止进口日本核灾地区食物”公民投票结果的约束效力到期。2021年9月22日，中华民国正式递件申请加入《全面且先进的跨太平洋伙伴关系协定》（CPTPP成员国均对日本食品输入完全解除区域管制），同年12月18日中华民国举办四项公民投票，其中“反美国莱猪”一案不通过后，两国政府遂开始重新商讨解禁食品问题。2022年2月8日，行政院协同相关部会召开“日本食品输入管制措施”记者会，宣布日本福岛、茨城、枥木、群马、千叶5县食品将正式解禁，未来管制将从禁止特定地区改为禁止特定风险品项，例如菇类仍禁止、乳制品须附辐射检验证明与产地证明。[50][51]
中华民国对外贸易发展协会（外贸协会）于日本首都东京，以及大阪与福冈设立台湾贸易中心。[52]经济部国际贸易署也在东京设立驻日本代表处经济组，以及在大阪设立驻大阪办事处经济组。[53]
根据日本《输出贸易管理令》，出口管制将贸易对象国家、区域依各自内部贸易管理体制完备性、风险管控与实务需求等角度，分类为A、B、C、D四级[注 6]，台湾被分类为C类：于部分出口项目可申请综合输出许可。[54]
| 年分 | 贸易总额 | 年增减 | 排名 | 出口至日本 | 年增减 | 排名 | 自日本进口 | 年增减 | 排名 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2018 | 66,955,858,381 | ▲7.101% | 3 | 22,801,850,812 | ▲10.825% | 4 | 44,154,007,569 | ▲5.274% | 2 |
| 2019 | 67,333,728,398 | ▲0.564% | 3 | 23,279,055,992 | ▲2.093% | 4 | 44,054,672,406 | ▼0.225% | 2 |
| 2020 | 69,302,039,738 | ▲2.923% | 3 | 23,398,695,184 | ▲0.514% | 4 | 45,903,344,554 | ▲4.196% | 2 |
| 2021 | 85,326,073,120 | ▲23.122% | 3 | 29,206,954,934 | ▲24.823% | 4 | 56,119,118,186 | ▲22.255% | 2 |
| 2022 | 88,237,541,133 | ▲3.412% | 3 | 33,609,278,847 | ▲15.073% | 4 | 54,628,262,286 | ▼2.656% | 2 |
| 2023 | 75,769,510,068 | ▼14.130% | 3 | 31,436,674,026 | ▼6.464% | 4 | 44,332,836,042 | ▼18.846% | 2 |
2023年的两国贸易项目如下：
出口至日本的前10大项目为：集成电路；聚缩醛、环氧树脂、醇酸树脂、聚碳酸酯、聚丙烯酯与其他聚酯、聚醚；自动资料处理机、磁性或光学阅读机；光纤或光纤传输缆、偏光性材料所制之片与板、光学透镜、棱镜、反射镜与其他光学元件；热轧之铁或非合金钢扁轧制品；碟片、磁带、固态非易失性存储器、智能卡与其他录音或录制之媒体；冷冻鱼；电话机（包括智能手机），以及其他传输或接收声音、图像之有线或无线网络通讯器具；特定用途机器之零件与附件；制造半导体、集成电路与平面显示器用之机器与器具、零件与附件等。[56]
自日本进口的前10大项目为：集成电路；制造半导体、集成电路与平面显示器用之机器与器具；小客车与其他主要设计供载客之机动车辆；电子工业用已掺杂之化学元素或化学化合物；未经塑性加工精炼铜与铜合金；未锻造、半制品或粉状黄金；塑料板、片、箔、薄膜与扁条；印制电路；环烃；示波器、频谱分析仪与其他供计量或检查电量之仪器与器具，供计量或侦测X光、阿尔法、贝他、伽马放射线、宇宙或其他离子辐射线用之仪器与器具等。[57]
两国于2011年9月签署《投资自由化、促进及保护合作协议》（《台日投资协定》），除保障企业投资权益外，并促进投资往来更加自由化、便捷化以及保障双方企业投资权益。为扩大产业合作，2012年1月起继而推动“台日产业合作搭桥方案”，3月在台北成立“台日产业合作推动办公室（TJPO）”，并在东京设立“Japan Window”负责推动第一线业务。11月签署《强化产业合作搭桥计划之合作备忘录》，透过此计划，连结双边具产业合作潜在案例，在技术、资金、Know-how与人员等全面合作，强化双边产业结盟，创造双赢。[58]
根据中华民国经济部投资审议司统计，截至2023年，台商赴日本总投资金额约121.12亿美元，计有969件。2022年约0.73亿美元，计有29件；日本赴台湾总投资金额约265.19亿美元，计有11,870件。[59][58]另根据日本银行统计，截至2021年，台湾对日本直接投资累积金额约77.95亿美元，占比2.22%，在亚洲地区次于香港、新加坡、韩国。[58]
台商主要投资项目以电子机械设备、通讯、金融保险、批发与零售、不动产与服务业等。[58]
对日本大规模投资案件，包括1998年联华电子并购新日铁半导体、2001年奇美电子并购日本IBM辖下液晶面板厂、2014年中国信托商业银行并购东京之星银行（外资银行并购日本的银行首例）、2016年鸿海科技集团并购SHARP（外商收购日本电子企业首例）、2017年正新橡胶在日本成立事务所、2018年台湾声宝在大阪成立“SAMPO JAPAN”、2018年联华电子收购三重富士通半导体公司（2019年更名为日本联合半导体，成为全资子公司）、[60]2021年台积电与索尼半导体制造合资设立特殊制程晶圆厂等。[61]
许多台湾服务业、外食产业受到访台的日本观光客喜爱后，赴日设立据点渐多，例如夏姿（服装）、日出茶太（珍珠奶茶）、春水堂（珍珠奶茶）、微热山丘（凤梨酥）、芒果恰恰（芒果冰）、三商巧福（餐饮）、胡须张（餐饮）、点水楼（餐饮）、郭元益（食品）、欧莱德（保养品）等品牌，将台湾饮食、生活文化介绍至日本。[58]
日本贸易振兴机构（JETRO）经由设在台湾等29处全球加速器中心（JETRO Global Acceleration Hub, JGAH），协助日本初创企业进军国际市场与招揽国外初创企业赴日本扩展业务。[58]
2012年3月，鸿海精密与夏普（SHARP）达成资本合作协议，由鸿海出资670亿日圆（约占总资本的9.9%）入股夏普，后因夏普股价大跌及双方经营阶层意见之差异，媒体戏称的“鸿夏恋”最终导致破局。但双方各出资46.5%投资的面板厂“堺显示产品公司”（通称堺工厂），已于2012年7月顺利完成出资。[58]
原本进展停滞的鸿海投资夏普案，最终于2016年4月2日，鸿海以3,888亿日圆投资夏普，是鸿海成立42年的最大海外投资，也是台湾企业首次收购日本面板大厂，签约地就在大阪堺市。由鸿海集团董事长郭台銘、副总裁戴正吴、与夏普社长高桥兴三共同签署。[62]
另一起鸿海竞标东芝记忆体案，外电在2017年6月中披露恐将出局，但郭台銘在6月22日的鸿海股东会上撕毁当日的《工商时报》并批评日本官方，强调他还有5成机会，会让报纸总编辑后悔。[63]东芝在9月13日发布声明时仍保留但书与弹性，不排除与其他阵营议约。外传东芝发布声明后，东京当地就谣传郭台銘将大阵仗在当地召开记者会。日本媒体盛传，郭台銘因不满竞标过程，将炮火再次直指日本官方，批评日本官僚涉足竞标。尽管鸿海否认相关谣言，但仍挑起日本官方对鸿海竞标的负面印象，促使官方出重手，让东芝在7日内作成优先与贝恩资本（Bain Capital）为主的“美日韩联盟”议约的决议，售价为2兆日圆，预定2018年3月31日完成交易。[64][63]
重要的会议有：台日经贸会议（2023年第47届），以及东亚经济会议（2023年第50届）、台日钢铁对话会议（2023年第23届）、台日出口管制会谈（2023年第11届）、台日能源合作研讨会（2022年第18届）、台日产业合作搭桥方案意见交流会议（每年两次于台日轮流，2022年第24次）、台日海洋事务合作对话（2023年第5届）、台日水产科技合作会议、台日水产研究研讨会（2023年第9届）、台日渔业民间协议会议、台日渔业委员会（2023年第9次）、鳗鱼国际资源保护管理非正式会议（2023年第14次）、[59][65]日本・台湾初创高峰会（2023年第2届）等。[66]
2001年9月11日，由170家赴日本投资的台湾企业组成“在日台商联谊会”。[67]目前运作的有：日本台湾商会联合总会、东京台湾商会、日本横滨台湾商会、日本关西台商协会、千叶台湾商工会、九州台湾商工会、琉球台湾工商协会等，以及留日台湾同乡会。[68]
目前已在日本设立的台资银行有：台湾银行东京支店、彰化银行东京支店、第一商业银行东京支店、玉山商业银行东京支店、兆丰国际商业银行东京支店、中国信托商业银行东京支店、台新国际商业银行东京支店、台湾中小企业银行东京支店等。[68]
2016年5月，日本海上保安厅在冲绳查获并逮捕6名台湾人涉嫌走私600公斤安非他命。黑市价约420亿日圆，约121亿新台币（当时汇率）。创下日本缉毒史上最高纪录，相当于日本2年的平均查获量。[69]
2017年1月，日本媒体披露福冈县警方破获台湾电信诈骗集团，逮捕超过30名持观光签证入境的台湾人。4日，中华民国外交部表示，经查相关人士已遭强制遣送出境返台。[70]
| 日期 | 签署 | 备注 |
|---|---|---|
| 1915年1月18日 | 《二十一条》 | |
| 1915年5月25日 | 《中日民四条约》 | |
| 1918年5月16日 | 《中日共同防敌军事协定》 | |
| 1930年5月6日 | 《中日协定》 | |
| 1932年5月5日 | 《中日上海停战及日方撤军协定》 | |
| 1934年5月31日 | 《中日塘沽协定》 | |
| 1935年6月27日 | 《秦土协定》 | |
| 1935年7月6日 | 《何梅协定》 | |
| 1936年11月5日 | 《中日外交官领事官等用品相互免税办法换文》 | |
| 1940年11月30日 | 《日满华共同宣言》 | |
| 1952年4月28日 | 《中华民国与日本国间和平条约》 | |
| 1953年6月13日 | 《中日贸易及付款办法》 | |
| 1955年3月15日 | 《中日空运临时协定》 | |
| 1969年12月5日 | 《中日为金属制造工业设立职业训练中心之协定》 | |
| 1975年7月9日 | 《台日航空协定》 | 以下简称台日 |
| 1980年6月9日 | 《台日关于双方国际空运事业互免税捐协定》 | |
| 1990年6月11日 | 《中华民国商务仲裁协会与日本国际商务仲裁协会间协定》 | |
| 1990年9月4日 | 《台日国际运输业互免所得税协定》 | [注 7] |
| 1991年6月20日 | 《（中华民国）经济部商品检验局与日本电气用品试验所相互代理电气产品检验之协议备忘录》 | |
| 1995年3月30日 | 《核能研究所（中华民国的非营利机构）、芝加哥大学及日本中央电力产业研究所三方合作交换计划协议书》 | |
| 1995年4月24日 | 《台日期货交易资讯协定》 | |
| 1995年10月20日 | 《经济部商品检验局与日本品质保证机构间有关日本品质保证产品安全认证系统执行备忘录》 | |
| 2001年5月21日 | 《台日货品暂准通关证协定》 | |
| 2003年11月12日 | 《台日关于严重急性呼吸综合征（SARS）共同研究了解备忘录》 | |
| 2005年4月7日 | 《中华邮政股份有限公司与日本邮政公社国际快捷邮件绩效付款计划协议备忘录》 | |
| 2005年12月1日 | 《台日关于控制有害废弃物越境转移及其处置协定》 | [注 8] |
| 2007年8月8日 | 《台日关于驾照相互承认之协定》 | [注 9] |
| 2007年10月1日 | 《台日关于双方在对方机场实施入境事先确认之备忘录》 | [注 10] |
| 2008年1月22日 | 《台日关于台北市日侨学校租用台湾银行及财政部国有财产局经管土地租金计收之了解备忘录》 | [注 11] |
| 2008年5月5日 | 《台日有关飞航安全协议书》 | |
| 2008年6月30日 | 《台湾中华电信股份有限公司电信研究所与日本独立行政法人情报通信研究机构间科技合作了解备忘录》 | |
| 2009年4月3日 | 《台日打工度假签证换函》 | [注 12] |
| 2009年12月11日 | 《台日关于维持民间航空业务之协议》 | |
| 2010年4月30日 | 《强化台日交流合作备忘录》 | [74] |
| 2010年12月10日 | 《台日地震、台风等发生时，有关防止土石灾害及防砂进行技术交流之协议书》 | [74] |
| 2010年 | 《横须贺研究园区与中部科学园区合作协定》 《新潟大学与中原大学校际合作协定》 《明治大学与中原大学校际合作协定》 |
[74] |
| 2011年7月14日 | 《支援东日本大震灾复兴、促进观光－台日厚重情谊倡议》 | [75] |
| 2011年9月22日 | 《台日有关投资自由化、促进及保护合作协议》 | |
| 2011年11月10日 | 《台日航约（开放天空）协议》 | [注 13] |
| 2012年4月11日 | 《台日专利审查高速公路备忘录》 《台日洗钱及资助恐怖分子金融情资交换备忘录》 |
[76][注 14] |
| 2012年11月27日 | 《台日电器产品检验相互认证协议》 | |
| 2012年11月29日 | 《台日为强化产业合作搭桥计划之合作备忘录》 | |
| 2013年4月10日 | 《台日渔业协议》 | |
| 2013年11月5日 | 《台日优先权证明文件电子交换合作备忘录》 《台日电子商务合作协议》 《台日药物法规合作框架协议》 《台日加强铁路业务交流及合作了解备忘录》 《台日关于海上航机搜索救难合作之协议书》 |
[注 15] [注 16] |
| 2013年11月28日 | 《台日金融监理合作备忘录》 | |
| 2014年3月20日 | 《台日海上事故与救难民间协议》 | |
| 2014年11月19日 | 《台日专利程序上微生物寄存相互暸解备忘录》 《台日有关入出境管理事务及情资交换暨合作了解备忘录》 《台日核能管制资讯交流备忘录》 《台日观光事业发展加强合作备忘录》 |
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| 2015年11月26日 | 《台日避免所得税双重课税及防杜逃税协定》 《台日竞争法适用了解备忘录》 《台日强化灾害防救业务交流合作备忘录》 |
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| 2016年11月30日 | 《台日语文教育交流与合作备忘录》 《台日强化产品安全领域之交流与合作备忘录》 |
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| 2017年8月1日 | 《583系卧铺电车车厢捐赠台湾仪式合作备忘录》 | [注 17] |
| 2017年11月22日 | 《台日关务合作及互助协定》 《台日文化交流合作了解备忘录》 |
[77] |
| 2017年12月19日 | 《台日海上急难救助合作备忘录》 | [78] |
| 2018年11月30日 | 《台日优质企业相互承认协议》 《台日医疗器材品质管理系统合作备忘录》 《台日档案资讯交换相互合作备忘录》 《台日中小企业支援及促进中小企业合作备忘录》 《台日年轻研究者共同研究事业实施备忘录》 |
[79] |
| 2018年12月27日 | 《台日走私及非法入出国应处合作备忘录》 《台日海洋科学研究合作备忘录》 |
[80] |
| 2019年10月30日 | 《台日促进进出口有机食品合作备忘录》 《台日环境保护交流与合作了解备忘录》 |
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| 2022年2月18日 | 《台日强化青少年交流备忘录》 《台日海关分支单位合作备忘录》 |
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| 2022年3月4日 | 《台日食品安全合作及促进食品进出口备忘录》 | |
| 2023年1月13日 | 《台日海洋废弃物应处合作备忘录》 | |
| 2023年3月16日 | 《台日法务及司法领域之交流与合作备忘录》 |
持有中华民国护照的中华民国国民（且在台湾有户籍）可以免签证的方式入境日本，停留最多90天。若入出境日本频繁或单次停留时间过久，可能被拒绝入境，因此停留较长时日或从事观光以外目的，宜先向日本台湾交流协会台北或高雄事务所询问申办符合该目的之签证。过境转机无需签证。[81][82]由于两国已无正式外交关系，持中华民国护照在日本台湾交流协会或日本台湾交流协会高雄事务所申请日本国签证，实际核发签证之外交馆处为日本驻泰国大使馆，因此申请地为曼谷（BANGKOK）。
根据中华民国交通部观光署资料，2019年日本赴台有216万7,952人次；台湾赴日则有491万1,681人次。合计人次创下历史新高。[86]
台湾日治时期，台湾和日本内地间就有航空路线。[87]战后一度中断，直到1959年，日本航空开辟东京（羽田）↔台北（松山）的航线。中华民国与日本断交后，因中华航空飞机上的中华民国国旗，以至于1974年5月至1975年8月间，两国断航。复航后中华航空与新成立的长荣航空飞东京的班机被安排降落于羽田机场，以回避中国大陆的航空公司，成为该机场仅有的两家外国籍航空公司，直到2002年4月18日起才改至成田机场起降，并大幅增加班次。[88]1998年4月1日，复航台北（桃园）↔大阪（关西）航线。[89]2010年10月31日，复航台北松山↔东京羽田航线。[74]
目前双边有定期航班来往的城市如下（截至2023年6月16日）：
 中华民国 |
 日本（按照都会区人口排列）斜体 表示因2019冠状病毒疾病疫情影响而暂停台湾航点 |
|---|---|
| 台北松山 | 东京羽田（中华航空、长荣航空、日本航空、全日本航空） |
| 台北桃园 | 东京羽田（台湾虎航、乐桃航空） 东京成田（中华航空、长荣航空、台湾虎航、星宇航空、日本航空、乐桃航空、捷星日本航空、酷航、国泰航空） 大阪关西（中华航空、长荣航空、台湾虎航、星宇航空、日本航空、乐桃航空、捷星亚洲航空、全亚洲航空、国泰航空、马来西亚峇迪航空） 名古屋（中华航空、长荣航空、台湾虎航、日本航空、乐桃航空、星悦航空、马来西亚峇迪航空）（国泰航空于2023年10月29日复航） 札幌（中华航空、长荣航空、台湾虎航、星宇航空、乐桃航空、酷航） 福冈（中华航空、长荣航空、台湾虎航、星宇航空、乐桃航空） 广岛（中华航空） 仙台（长荣航空、台湾虎航、星宇航空、乐桃航空） 北九州（星悦航空） 新潟（台湾虎航） 熊本（中华航空于2023年9月18日开航、星宇航空于2023年9月1日开航） 冈山（台湾虎航） 静冈（中华航空） 鹿儿岛（中华航空） 松山（长荣航空） 高松（中华航空） 富山（中华航空） 宫崎（中华航空） 旭川（台湾虎航）（长荣航空季节性） 那霸（中华航空、长荣航空、台湾虎航、星宇航空、乐桃航空、全亚洲航空）（马来西亚峇迪航空于2023年8月15日开航） 青森（长荣航空） 函馆（长荣航空、台湾虎航） 佐贺（台湾虎航） 小松（长荣航空、台湾虎航） 花卷（台湾虎航） 茨城（台湾虎航） 石垣岛（中华航空季节性） 山形（中华航空包机） |
| 台中 | 东京成田（华信航空） 那霸（华信航空） |
| 台南 | 大阪关西（中华航空） |
| 高雄 | 东京成田（中华航空、长荣航空、台湾虎航、乐桃航空） 大阪关西（中华航空、长荣航空、台湾虎航、酷航）（乐桃航空于2023年8月1日复航） 名古屋（台湾虎航） 札幌（中华航空） 福冈（长荣航空、台湾虎航） 熊本（中华航空） 那霸（中华航空、台湾虎航、乐桃航空） 茨城（台湾虎航包机） |
1972年9月24日，陆军第一特种兵陆有京，疑因军中不当管教而逃出化学兵学校，由台北松山机场潜入一架国泰航空飞往日本东京羽田机场的客机鼻轮架，因高空缺氧低温冻死，其遗体归属问题曾引发中日台外交争议，总统蒋中正亲自介入调查，惟真相至今仍未明。[90][91]
1994年4月26日，中华航空一架由台湾中正国际机场飞往日本名古屋机场的客机，在降落时坠毁，造成264名机组员与乘客死亡，包括153名日本籍乘客，仅有7人生还。
持有中华民国汽车驾驶执照可以免路考及笔试申请换发日本驾驶执照，反之亦同。[92]
2019年5月，日本琉球朝日放送电视台报导，在冲绳岛有1名穿越人行道的8岁男童被1名台湾男子驾驶的租车撞上重伤，有目击者表示，事发时人行道的灯号是绿灯。[93]《日本经济新闻》也公布图表，其中针对台湾、韩国、香港旅客在日本的驾车事故与日本人做比较，统计发现台湾旅客在酒后驾驶、无照驾驶都排名第1，韩国旅客则是超速最多。[94]
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