From Wikipedia, the free encyclopedia
Transmembranski protein 241 (aka C18orf45, hVVT) je sveprisutni proteinski transporter šećera koji je kod ljudi kodiran genom TMEM241.[5]
TMEM241 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | TMEM241 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 615430 MGI: 2442435 HomoloGene: 87267 GeneCards: TMEM241 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 18: 23.2 – 23.44 Mb | Chr 18: 12.1 – 12.25 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Gen
U ljudi gen TMEM241 sadrži 142.188 bp, na 1poziciji 8q11.2, sa 24 egzona.
Nalazi u blizini gena CABLES1, RIOK3 i NPC1, na hromosomu 18.[6]
Primarna iRNK za ljudski TMEM241, izoformu 1, sadrži petlju UTR ukosničku petlju koja je kod primata konzervirana. Primarna iRNK za ljudsu izoformu 1 TMEM241 sadrži mjesta vezanja u svom 3 'UTR za miRNK 520f-5p, 378a-5p i 6866-5p.[7]
Dužina polipeptidnog lanca je 296 aminokiselina, sa molekulskom težinom od 32.647[8].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MCVRRSLVGL | TFCTCYLASY | LTNKYVLSVL | KFTYPTLFQG | WQTLIGGLLL | ||||
HVSWKLGWVE | INSSSRSHVL | VWLPASVLFV | GIIYAGSRAL | SRLAIPVFLT | ||||
LHNVAEVIIC | GYQKCFQKEK | TSPAKICSAL | LLLAAAGCLP | FNDSQFNPDG | ||||
YFWAIIHLLC | VGAYKILQKS | QKPSALSDID | QQYLNYIFSV | VLLAFASHPT | ||||
GDLFSVLDFP | FLYFYRFHGS | CCASGFLGFF | LMFSTVKLKN | LLAPGQCAAW | ||||
IFFAKIITAG | LSILLFDAIL | TSATTGCLLL | GALGEALLVF | SERKSS |
Postoji više od 10 varijanti transkripta predviđenih za ljudski gen TMEM241 pronađen na BLAST-u. Izoform 1 je mase oko 31 kDa. Protein ima izoelektričnu tačku 8,7, a posebno je bogat aminokiselinom fenilalaninom, koja sadrži dvostruko veći udio od ove aminokiseline.[9]
TMEM241 sastavljen je od devet transmembranskih domena, tvoreći hidrofobnu integralnu komponentu membrane[10] sastavljen prvenstveno od alfa-heliksnih[11][12][13] TMEM241 sadrži VRG4 (glikozilacija otporna na vandate)[14]) domen sa homologijom domena transportera šećera VRG4 iz Saccharomyces cerevisiae (kvasac).[15]
Predviđa se da će TMEM241 biti podvrgnut raznim fosforilacijama,[16] glikolizaciji, palmitoilaciji.[17] Naprimjer, izoforma 1TMEM241[18] ima mjesta fosforilacije na S6, 64, 170, 177, 291, 295 i 296, mjestima glikacije na K125, 169 i 172; mjesta palmitoilacije na C13, 15, 221.
Postoje neki dokazi da ovaj protein može stupiti u interakciju s keratinskim filamentom, zasnovanom na dva hibridna mjesta s keratinskim proteinom KRT40.[19]
TMEM241 će se vjerovatno eksprimiratii u svim tkivima na različitim nivoima od bazne do umjerene ekspresije.[20] Neke studije su pronašle promjene u ekspresiji TMEM241. Naprimjer, u slučajevima akutne megakarioblastne leukemije, utvrđeno je da je TMEM241 jedan od najnadguliranijih gena.[21] U drugom slučaju je utvrđeno da je TMEM241 povišen u regulaciji tokom nerazvijenog proteinskog odgovora nakon prekomerne ekspresije Ero1α (endoplasmatskog retikulumskog oksidoreduklin 1α).[15]
TMEM241 je konzerviran širom eukariota.
TMEM241 je konzerviran kod svih životinja, a homolozi se nalaze u svim eukariotima. TMEM241 ima 19% globalnog identiteta i 60% identiteta prema BDP-transporteru manoze sa S. cerevisiae, koja sadrži VRG4 domen. Vjerovatno je da je TMEM241 transporter bruto-manoze zbog ove sličnosti. Grafikon s desne strane prikazuje relativni nivo konzerviranosti TMEM241 u mnogim vrstama organizama, koristeći princip molekulskog sata.
Naučno ime | Uobičajeno ime | Divergencija od H. sapiens (milioni godina)[22] | Dućina proteina (aminookiselina) | Identitet (%) sa H. sapiens[23][24] | Pristupni broj |
---|---|---|---|---|---|
Homo sapiens | Čovjek | 0 | 296 | 100 | NP_116322 |
Mus musculus | Miš | 90,1 | 297 | 84 | NP_001276595 |
Calidris pugnax | Ruf (ptica) | 320,5 | 296 | 80 | XP_003219697 |
Python bivittatus | Piton | 320,5 | 296 | 74 | XP_014793906 |
Xenopus laevis | Kandžata žaba | 354,4 | 293 | 69 | NP_001091222 |
Salmo salar | Losos | 4368 | 296 | 63 | XP_014036453 |
Octopus bimaculoides | Oktopus | 903 | 291 | 35 | XP_014776992 |
Halyomorpha halys | Smrdibuba | 903 | 257 | 32 | XP_014284006 |
Saccharomyces cerevisiae | Kvasac | 1335,5 | 216 | 25 | AJS02580 |
Coccomyxa subellipsoidea | Zelene alge | 1570,5 | 296 | 28 | XP_005651133 |
TMEM241 ma dva paraloga kod ljudi koji imaju homologe u svim eukariotima, UGTREL8[25] i UGTREL7.[26] TMEM241, UGTREL8 i UGTREL7 su porodica proteina za transport šećera s bliskim identitetom sa BDP-transporterom manoze identificiranim u S. cerevisiae.
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.