FERM i PDZ sa domenom 3 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FRMPD3 sa hromosoma X.[5]
FERM | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | FRMPD3 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 301005 MGI: 3646547 HomoloGene: 52665 GeneCards: FRMPD3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr X: 107.45 – 107.61 Mb | Chr X: 140.34 – 140.44 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.810 aminokiselina, a molekulska težina 199.209 Da.[5][6]
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
METLDSQRVQ | DRLLAAPGCS | SPSGQQELFS | SHVMQEESAN | DMECEQLPAE | ||||
ILRQVTVHRD | PIYGFGFVAG | SERPVVVRSV | RPGGPSENKL | LAGDQIVAIN | ||||
EEDVSEAPRE | RLIELIRSAK | EFIVLTVLHT | HQSPKSAFIS | AAKKAKLRSN | ||||
PVKVRFSEQV | AVGETDAKMM | KKEALLLIPN | VLKVFLENGQ | IKSFTFDGRT | ||||
TVKDVMLTLQ | DRLSLRFIEH | FALVLEYAGP | EQNHKFLLLQ | DKQPLAYVVQ | ||||
RTHYHGMKCL | FRISFFPKDP | VELLRRDPAA | FEYLYIQSRN | DVIRERFGMD | ||||
PKPEMLLGLA | ALHIYITVSA | TRPSQKISLK | NVEKEWGLEP | FLPPSLLQVI | ||||
KEKNLRKSLS | QQLKAHQTHP | SCGTKGSAIQ | AKLQYLRILN | ELPTFTGVLF | ||||
NTVGLDEKQS | ATTLLVGPRH | GISHVIDLKT | NLTTVLSEFS | KISKIQLFRE | ||||
NQGVARVETS | IMDAKPLVLL | MEWPEATNFA | CLIAGYCRLL | LDSRKMVFSR | ||||
PASQPLPPPM | IKADYMHSAH | RPVTGGHLGK | KESSYVGSVG | TSPRKSSRCT | ||||
PPPADSELVS | FCYLHMREQR | KEQESRTDVN | ENLIFFEETR | PRTKSDPTSK | ||||
SSGQGYEVVP | DDFDAASLDH | EPCASRARSY | TLDNSLGAEA | LNFYCDSCKA | ||||
KLQEQLGPRK | GGKPGSSRDN | IVDLMSLPPP | GSEEEEEEED | ETTSLLPAIA | ||||
APPPGFRDNS | SDEDDPKRRA | VQSQEQGRHL | RGLLYDEIPV | TLIDSVQTRT | ||||
VRDHAQELDD | ALVSTLQALE | ALAASEDGPH | PPPPQTAGLI | VLATITPESS | ||||
LDSGHETNSS | ELTDMSEMMS | AMKQHQNTTY | FLAQHLNKDS | LLARKDLPFR | ||||
IQSCAAQAVL | TAPYSLGRPD | PNPSLQPIAT | GQSPGPPGAR | RKLPQSEGQV | ||||
QGERTYSLAV | HPALSPQLSE | QKNLSLLSPV | PEDKGPGHTR | AGLEMSLRAA | ||||
TSSLSEEQVS | ELRDNLPKEV | RLSPKLILDP | KSSVTPAIIS | AALQQVVHNK | ||||
SLVTAGGALG | NPPSRGERRL | EASMGRPEVS | MMSSSASKNL | KFKISPSAPE | ||||
TSWNSQHQLG | AEVSSSPRAP | TGSRADSLHL | SQQEDSLPVQ | NFPPKSYLLR | ||||
TSRESVGKQA | TGEVAGKGGP | VGGKPTLQKQ | GTISSQGEKA | QLESTPKRSK | ||||
LEETSLVPRA | TYPMALQSPS | CQSRSHSPSC | QPHGHSPSSQ | SRGQSPSCQP | ||||
RGQSPLRSQA | ASRQVSTMPS | RKLETTLNGA | HSTSEGPAKP | KSSRGPFRLR | ||||
NLFSATFPTR | QKKETDERQA | QLQKVKQYEL | EFLEELLKPP | SQGELPGTEY | ||||
LQPPAPGRCS | CQLRSSPVQQ | GPGMSREQRR | SCDCKRICRG | GRPQATQTPV | ||||
PSLRGRERDR | VLPSQRQPEA | GPGVSLSSPI | NVQRIRSTSL | ESRECRSDPE | ||||
SGVSCLTTCA | SGGECLGAPN | YRKLMRRYSI | SELDQGDRAS | LTSDVYPHPP | ||||
LGMLPREAKE | VEASLPIALG | PKSRSLESPT | LGDPSYVQVA | PETKGPRQMA | ||||
VFSLPEEVYR | KPAELDEDSE | SSKCCSIRYC | FYYRKCDMAD | DASDGKDELS | ||||
YSIPMKILPG | MKLDEQVVPV | VSRTLQVLDA | ATCSSSSPEA | SRTQEIDLRV | ||||
STFEGSLAKI | NALRAHAYGL | PDGFLAARLD | TNELLTVLRQ | CVASPEARAP | ||||
KPYVSQISEY | KLELALKFKE | LRASCRRVAN | VDKSPTHMLA | AITGSFQVLS | ||||
SLIETFVRLV | FIVRSEAQRQ | ELLAKVEEVV | RNYTFLLRAA | EESTARNLNQ | ||||
QQQQQQQQQQ | QQQQQQQQQQ | QQQQQQVAAA | AGAATEHPPG | SPTSATVMST | ||||
FTHSLKTLIK |
Funkcija
Nagase et al (2001) prikupili su informacije o kodirajućim sekvencama neidentifikovanih gena, u projekatu sekvenciranja klonova ljudskih cDNK koji kodiraju velike proteine. Predstavili su čitave sekvence od 100 klonova cDNK neidentificiranih ljudskih gena, nazvanih KIAA1776 i KIAA1780-KIAA1878, iz biblioteke cDNK frakcioniranih po veličini izvedene iz ljudskog fetusog mozga, cijelog mozga odrasle osobe, hipokampusa i amigdale. Većina klonova cDNK koji će biti u potpunosti sekvencionirani odabrani su kao cDNK za koje je pokazano da imaju potencijal kodiranja in vitro eksperimentima transkripcije/translacije, a neki klonovi su odabrani korištenjem kompjuterski potpomognute analize terminalnih sekvenci cDNK.
Tri od ovih klonova (fibrilin2/KIAA1776, MEGF10/KIAA1780 i MEGF11/KIAA1781) izolovana su kao geni koji kodiraju proteine sa više domena sličnih EGF-u skriningom motiv-zamka. Prosječna veličina inserata i odgovarajućih otvorenih okvira čitanja analiziranih klonova eDNK dostigla je 4,7 kb i 2,4 kb (odnosno 785 aminokiselinskih ostataka). Iz rezultata pretraživanja homologije i motiva u javnim bazama podataka određene su funkcionalne kategorije predviđenih genskih proizvoda 54 gena; 93% ovih predviđenih genskih proizvoda (50 genskih proizvoda) klasifikovano je kao proteini povezani sa ćelijskom signalizacijom/komunikacijom, upravljanjem nukleinskim kiselinama ili ćelijskom strukturom/pokretljivošću. Kako bi se prikupile dodatne informacije o ovim genima, njihovi profili ekspresije su također proučavani u 10 ljudskih tkiva, osam regija mozga, kičmene moždine, fetusnog mozga i fetusne jetre putem reverzne transkripcije spregnute lančane reakcije polimeraze, čiji su proizvodi kvantificirani enzimski povezanim imunosorbentnim esejem.[7]
Reference
Wikiwand in your browser!
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.