From Wikipedia, the free encyclopedia
Član 10 poriodice acil-CoA dehidrogenaza je protein koji je kod ljudi kodiran genom ACAD10.[5]
FAM60A | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | SINHCAF | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 615027 MGI: 1929091 HomoloGene: 10494 GeneCards: SINHCAF | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 12: 31.28 – 31.33 Mb | Chr 6: 148.82 – 148.85 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Dužina polipeptidnog lanca je 1.059 aminokiselina, a molekulska težina 118.834 Da.[6].
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MCVRSCFQSP | RLQWVWRTAF | LKHTQRRHQG | SHRWTHLGGS | TYRAVIFDMG | ||||
GVLIPSPGRV | AAEWEVQNRI | PSGTILKALM | EGGENGPWMR | FMRAEITAEG | ||||
FLREFGRLCS | EMLKTSVPVD | SFFSLLTSER | VAKQFPVMTE | AITQIRAKGL | ||||
QTAVLSNNFY | LPNQKSFLPL | DRKQFDVIVE | SCMEGICKPD | PRIYKLCLEQ | ||||
LGLQPSESIF | LDDLGTNLKE | AARLGIHTIK | VNDPETAVKE | LEALLGFTLR | ||||
VGVPNTRPVK | KTMEIPKDSL | QKYLKDLLGI | QTTGPLELLQ | FDHGQSNPTY | ||||
YIRLANRDLV | LRKKPPGTLL | PSAHAIEREF | RIMKALANAG | VPVPNVLDLC | ||||
EDSSVIGTPF | YVMEYCPGLI | YKDPSLPGLE | PSHRRAIYTA | MNTVLCKIHS | ||||
VDLQAVGLED | YGKQGDYIPR | QVRTWVKQYR | ASETSTIPAM | ERLIEWLPLH | ||||
LPRQQRTTVV | HGDFRLDNLV | FHPEEPEVLA | VLDWELSTLG | DPLADVAYSC | ||||
LAHYLPSSFP | VLRGINDCDL | TQLGIPAAEE | YFRMYCLQMG | LPPTENWNFY | ||||
MAFSFFRVAA | ILQGVYKRSL | TGQASSTYAE | QTGKLTEFVS | NLAWDFAVKE | ||||
GFRVFKEMPF | TNPLTRSYHT | WARPQSQWCP | TGSRSYSSVP | EASPAHTSRG | ||||
GLVISPESLS | PPVRELYHRL | KHFMEQRVYP | AEPELQSHQA | SAARWSPSPL | ||||
IEDLKEKAKA | EGLWNLFLPL | EADPEKKYGA | GLTNVEYAHL | CELMGTSLYA | ||||
PEVCNCSAPD | TGNMELLVRY | GTEAQKARWL | IPLLEGKARS | CFAMTEPQVA | ||||
SSDATNIEAS | IREEDSFYVI | NGHKWWITGI | LDPRCQLCVF | MGKTDPHAPR | ||||
HRQQSVLLVP | MDTPGIKIIR | PLTVYGLEDA | PGGHGEVRFE | HVRVPKENMV | ||||
LGPGRGFEIA | QGRLGPGRIH | HCMRLIGFSE | RALALMKARV | KSRLAFGKPL | ||||
VEQGTVLADI | AQSRVEIEQA | RLLVLRAAHL | MDLAGNKAAA | LDIAMIKMVA | ||||
PSMASRVIDR | AIQAFGAAGL | SSDYPLAQFF | TWARALRFAD | GPDEVHRATV | ||||
AKLELKHRI |
Ovaj gen kodira člana porodice enzima acyl-CoA-dehidrogenaza (ACAD), koji učestvuju u beta-oksidaciji masnih kiselina u mitohondrijama. Kodirani enzim sadrži domen hidrolaza na N-terminalnom dijelu, katalitski domen serin/treoninske protein-kinaze u centralnoj regiji i konzerviran ACAD domen na C-kraju. Opisano je nekoliko alternativno prerađenih varijanti transkripta ovog gena, ali priroda nekih od ovih varijanti nije utvrđena cijelom dužinom.[5]
U narodu Pima, ACAD10 identificiran je kao gen povezan s dijabetesom tipa 2, rezistencijom na insulin i poremećenim metabolizmom lipida. Konkretno, dva jednonukleotidna polimorfizma, rs601663 i rs659964, značajno su povezani s ovim simptomima u velikoj populaciji ljudi Pima i američkih starosjedilaca.[7]
Korištenjem masene spektrometrije za procjenu afiniteta, zaključuje se interakcija kada je afinitet proteinske sonde dobuijen iz ekstrakata ćelija bilo poliklonskim antitijelom ili epitopskom oznakom, a pridruženi partner za interakciju je identificiran metodima masene spektrometrije. Koristeći ovaj metod, pokazalo se da ACAD10 komunicira sa P2RY8, NDUFA10, NTRK3, SLC2A12, LPAR4, PTH1R, COLEC10, APP, MAS1, CD79A, BSG, i ubikvitinom C.[8]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.