XPO1

XPO1 (англ. Exportin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 071 амінокислот, а молекулярна маса — 123 386^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAIMTMLAD		HAARQLLDFS		QKLDINLLDN		VVNCLYHGEG		AQQRMAQEVL
THLKEHPDAW		TRVDTILEFS		QNMNTKYYGL		QILENVIKTR		WKILPRNQCE
GIKKYVVGLI		IKTSSDPTCV		EKEKVYIGKL		NMILVQILKQ		EWPKHWPTFI
SDIVGASRTS		ESLCQNNMVI		LKLLSEEVFD		FSSGQITQVK		SKHLKDSMCN
EFSQIFQLCQ		FVMENSQNAP		LVHATLETLL		RFLNWIPLGY		IFETKLISTL
IYKFLNVPMF		RNVSLKCLTE		IAGVSVSQYE		EQFVTLFTLT		MMQLKQMLPL
NTNIRLAYSN		GKDDEQNFIQ		NLSLFLCTFL		KEHDQLIEKR		LNLRETLMEA
LHYMLLVSEV		EETEIFKICL		EYWNHLAAEL		YRESPFSTSA		SPLLSGSQHF
DVPPRRQLYL		PMLFKVRLLM		VSRMAKPEEV		LVVENDQGEV		VREFMKDTDS
INLYKNMRET		LVYLTHLDYV		DTERIMTEKL		HNQVNGTEWS		WKNLNTLCWA
IGSISGAMHE		EDEKRFLVTV		IKDLLGLCEQ		KRGKDNKAII		ASNIMYIVGQ
YPRFLRAHWK		FLKTVVNKLF		EFMHETHDGV		QDMACDTFIK		IAQKCRRHFV
QVQVGEVMPF		IDEILNNINT		IICDLQPQQV		HTFYEAVGYM		IGAQTDQTVQ
EHLIEKYMLL		PNQVWDSIIQ		QATKNVDILK		DPETVKQLGS		ILKTNVRACK
AVGHPFVIQL		GRIYLDMLNV		YKCLSENISA		AIQANGEMVT		KQPLIRSMRT
VKRETLKLIS		GWVSRSNDPQ		MVAENFVPPL		LDAVLIDYQR		NVPAAREPEV
LSTMAIIVNK		LGGHITAEIP		QIFDAVFECT		LNMINKDFEE		YPEHRTNFFL
LLQAVNSHCF		PAFLAIPPTQ		FKLVLDSIIW		AFKHTMRNVA		DTGLQILFTL
LQNVAQEEAA		AQSFYQTYFC		DILQHIFSVV		TDTSHTAGLT		MHASILAYMF
NLVEEGKIST		SLNPGNPVNN		QIFLQEYVAN		LLKSAFPHLQ		DAQVKLFVTG
LFSLNQDIPA		FKEHLRDFLV		QIKEFAGEDT		SDLFLEEREI		ALRQADEEKH
KRQMSVPGIF		NPHEIPEEMC		D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

XPO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: C9JV99 PDBe C9JV99 RCSB Список кодів PDB 1W9C, 2L1L, 3GB8, 4BSM, 4BSN, 5DIS
Ідентифікатори
Символи	XPO1, CRM1, emb, exp1, exportin 1, CRM-1
Зовнішні ІД	OMIM: 602559 MGI: 2144013 HomoloGene: 2554 GeneCards: XPO1
Пов'язані генетичні захворювання
хронічний лімфолейкоз[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • transporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • nuclear export signal receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • Тільце Кахаля • ядерна мембрана • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • nuclear envelope • нуклеоплазма • lamellae anulatae • клітинне ядро • кінетохор • ядерце • гіалоплазма • host cell • GO:0009327 protein-containing complex • Рибонуклеопротеїни • внутрішньоклітинний Біологічний процес • ribosomal small subunit export from nucleus • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of centrosome duplication • mRNA transport • regulation of mRNA stability • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • protein export from nucleus • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • protein localization to nucleus • protein transport • ribosomal large subunit export from nucleus • intracellular protein transport • GO:0022415 viral process • sister chromatid cohesion • ribosomal subunit export from nucleus • regulation of protein export from nucleus • ribosome biogenesis • GO:0015915 транспорт • nucleocytoplasmic transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7514	103573
Ensembl	ENSG00000082898	ENSMUSG00000020290
UniProt	O14980	Q6P5F9
RefSeq (мРНК)	NM_003400	NM_001035226 NM_134014
RefSeq (білок)	NP_003391	NP_001030303 NP_598775
Локус (UCSC)	Хр. 2: 61.48 – 61.54 Mb	Хр. 11: 23.21 – 23.25 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fornerod M., Ohno M., Yoshida M., Mattaj I.W. (1997). CRM1 is an export receptor for leucine-rich nuclear export signals. Cell. 90: 1051—1060. PMID 9323133 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80371-2
• Ossareh-Nazari B., Bachelerie F., Dargemont C. (1997). Evidence for a role of CRM1 in signal-mediated nuclear protein export. Science. 278: 141—144. PMID 9311922 DOI:10.1126/science.278.5335.141
• Askjaer P., Jensen T.H., Nilsson J., Englmeier L., Kjems J. (1998). The specificity of the CRM1-Rev nuclear export signal interaction is mediated by RanGTP. J. Biol. Chem. 273: 33414—33422. PMID 9837918 DOI:10.1074/jbc.273.50.33414
• Farjot G., Sergeant A., Mikaelian I. (1999). A new nucleoporin-like protein interacts with both HIV-1 Rev nuclear export signal and CRM-1. J. Biol. Chem. 274: 17309—17317. PMID 10358091 DOI:10.1074/jbc.274.24.17309
• Lindsay M.E., Holaska J.M., Welch K., Paschal B.M., Macara I.G. (2001). Ran-binding protein 3 is a cofactor for Crm1-mediated nuclear protein export. J. Cell Biol. 153: 1391—1402. PMID 11425870 DOI:10.1083/jcb.153.7.1391

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з XPO1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12825 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
5. UniProt, O14980 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2