SPI1 (англ. Spi-1 proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 31 083[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLQACKMEGF | | PLVPPPSEDL | | VPYDTDLYQR | | QTHEYYPYLS | | SDGESHSDHY |
WDFHPHHVHS | | EFESFAENNF | | TELQSVQPPQ | | LQQLYRHMEL | | EQMHVLDTPM |
VPPHPSLGHQ | | VSYLPRMCLQ | | YPSLSPAQPS | | SDEEEGERQS | | PPLEVSDGEA |
DGLEPGPGLL | | PGETGSKKKI | | RLYQFLLDLL | | RSGDMKDSIW | | WVDKDKGTFQ |
FSSKHKEALA | | HRWGIQKGNR | | KKMTYQKMAR | | ALRNYGKTGE | | VKKVKKKLTY |
QFSGEVLGRG | | GLAERRHPPH |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
SPI1
|
---|
|
|
Ідентифікатори |
Символи |
SPI1, OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, Spi-1 proto-oncogene, AGM10 |
Зовнішні ІД |
OMIM: 165170 MGI: 98282 HomoloGene: 2346 GeneCards: SPI1
|
---|
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • NFAT protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding
|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription regulator complex
|
Біологічний процес |
• myeloid leukocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to ethanol • somatic stem cell population maintenance • lymphocyte differentiation • regulation of erythrocyte differentiation • myeloid dendritic cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of MHC class II biosynthetic process • lymphoid progenitor cell differentiation • transcription, DNA-templated • macrophage differentiation • anatomical structure regression • negative regulation of histone H4 acetylation • negative regulation of gene expression, epigenetic • vasculature development • granulocyte differentiation • apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis • histone H3 acetylation • erythrocyte differentiation • hypermethylation of CpG island • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • interleukin-6-mediated signaling pathway
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 11: 47.35 – 47.38 Mb |
Хр. 2: 90.91 – 90.95 Mb |
PubMed search |
[1] |
[2]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК.
Локалізований у ядрі.
- Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. (1999). SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1. J. Biol. Chem. 274: 11115—11124. PMID 10196196 DOI:10.1074/jbc.274.16.11115
- Mao S., Frank R.C., Zhang J., Miyazaki Y., Nimer S.D. (1999). Functional and physical interactions between AML1 proteins and an ETS protein, MEF: implications for the pathogenesis of t(8;21)-positive leukemias. Mol. Cell. Biol. 19: 3635—3644. PMID 10207087 DOI:10.1128/MCB.19.5.3635
- Dahl R., Iyer S.R., Owens K.S., Cuylear D.D., Simon M.C. (2007). The transcriptional repressor GFI-1 antagonizes PU.1 activity through protein-protein interaction. J. Biol. Chem. 282: 6473—6483. PMID 17197705 DOI:10.1074/jbc.M607613200
- Ray D., Culine S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. (1990). The human homologue of the putative proto-oncogene Spi-1: characterization and expression in tumors. Oncogene. 5: 663—668. PMID 1693183
- Ray D., Culine S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. (1990). Oncogene. 5: 1611—1612.