PSMD13

PSMD13 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 376 амінокислот, а молекулярна маса — 42 945^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKDVPGFLQQ		SQNSGPGQPA		VWHRLEELYT		KKLWHQLTLQ		VLDFVQDPCF
AQGDGLIKLY		ENFISEFEHR		VNPLSLVEII		LHVVRQMTDP		NVALTFLEKT
REKVKSSDEA		VILCKTAIGA		LKLNIGDLQV		TKETIEDVEE		MLNNLPGVTS
VHSRFYDLSS		KYYQTIGNHA		SYYKDALRFL		GCVDIKDLPV		SEQQERAFTL
GLAGLLGEGV		FNFGELLMHP		VLESLRNTDR		QWLIDTLYAF		NSGNVERFQT
LKTAWGQQPD		LAANEAQLLR		KIQLLCLMEM		TFTRPANHRQ		LTFEEIAKSA
KITVNEVELL		VMKALSVGLV		KGSIDEVDKR		VHMTWVQPRV		LDLQQIKGMK
DRLEFWCTDV		KSMEMLVEHQ		AHDILT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

PSMD13
Ідентифікатори
Символи	PSMD13, HSPC027, Rpn9, S11, p40.5, proteasome 26S subunit, non-ATPase 13
Зовнішні ІД	OMIM: 603481 MGI: 1345192 HomoloGene: 2110 GeneCards: PSMD13
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • proteasome accessory complex • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • proteasome regulatory particle, lid subcomplex • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen Біологічний процес • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • meiosis I • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome assembly • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5719	23997
Ensembl	ENSG00000185627	ENSMUSG00000025487
UniProt	Q9UNM6	Q9WVJ2
RefSeq (мРНК)	NM_002817 NM_175932	NM_011875
RefSeq (білок)	NP_002808 NP_787128	NP_036005
Локус (UCSC)	Хр. 11: 0.24 – 0.25 Mb	Хр. 7: 140.46 – 140.48 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Hoffman L., Gorbea C., Rechsteiner M. (1999). Identification, molecular cloning, and characterization of subunit 11 of the human 26S proteasome. FEBS Lett. 449: 88—92. PMID 10225435 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00403-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9558 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
4. UniProt, Q9UNM6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11