MYOD1 (англ. Myogenic differentiation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 320 амінокислот, а молекулярна маса — 34 501[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MELLSPPLRD | | VDLTAPDGSL | | CSFATTDDFY | | DDPCFDSPDL | | RFFEDLDPRL |
MHVGALLKPE | | EHSHFPAAVH | | PAPGAREDEH | | VRAPSGHHQA | | GRCLLWACKA |
CKRKTTNADR | | RKAATMRERR | | RLSKVNEAFE | | TLKRCTSSNP | | NQRLPKVEIL |
RNAIRYIEGL | | QALLRDQDAA | | PPGAAAAFYA | | PGPLPPGRGG | | EHYSGDSDAS |
SPRSNCSDGM | | MDYSGPPSGA | | RRRNCYEGAY | | YNEAPSEPRP | | GKSAAVSSLD |
CLSSIVERIS | | TESPAAPALL | | LADVPSESPP | | RRQEAAAPSE | | GESSGDPTQS |
PDAAPQCPAG | | ANPNPIYQVL |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
MYOD1
|
---|
|
|
Ідентифікатори |
Символи |
MYOD1, MYF3, MYOD, PUM, bHLHc1, myogenic differentiation 1, MYODRIF |
Зовнішні ІД |
OMIM: 159970 MGI: 97275 HomoloGene: 7857 GeneCards: MYOD1
|
---|
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin DNA binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • promoter-specific chromatin binding
|
Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • нуклеоплазма • міофібрила • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця
|
Біологічний процес |
• диференціація клітин • myotube differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to starvation • muscle cell fate commitment • cellular response to estradiol stimulus • skeletal muscle fiber adaptation • muscle organ development • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • myotube cell development • positive regulation of skeletal muscle fiber development • negative regulation of myoblast proliferation • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • regulation of RNA splicing • positive regulation of myoblast fusion • myoblast fate determination • cellular response to glucocorticoid stimulus • positive regulation of myoblast differentiation • skeletal muscle fiber development • histone H3 acetylation • myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration • histone H4 acetylation • skeletal muscle cell differentiation • positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration • регуляція експресії генів • striated muscle cell differentiation • cellular response to oxygen levels • myoblast fusion • myoblast differentiation • skeletal muscle tissue development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of muscle cell differentiation • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of snRNA transcription by RNA polymerase II
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 11: 17.72 – 17.72 Mb |
Хр. 7: 46.03 – 46.03 Mb |
PubMed search |
[1] |
[2]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, міогенез, ацетилювання.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Втрата контролю над цим перемикачем може стати причиною утворення рабдоміосаркоми[5][6].
- Pearson-White S.H. (1991). Human MyoD: cDNA and deduced amino acid sequence. Nucleic Acids Res. 19: 1148—1148. PMID 1850513 DOI:10.1093/nar/19.5.1148
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Breitschopf K., Bengal E., Ziv T., Admon A., Ciechanover A. (1998). A novel site for ubiquitination: the N-terminal residue, and not internal lysines of MyoD, is essential for conjugation and degradation of the protein. EMBO J. 17: 5964—5973. PMID 9774340 DOI:10.1093/emboj/17.20.5964
- McKinsey T.A., Zhang C.L., Olson E.N. (2001). Control of muscle development by dueling HATs and HDACs. Curr. Opin. Genet. Dev. 11: 497—504. PMID 11532390 DOI:10.1016/S0959-437X(00)00224-0
- Mal A.K. (2006). Histone methyltransferase Suv39h1 represses MyoD-stimulated myogenic differentiation. EMBO J. 25: 3323—3334. PMID 16858404 DOI:10.1038/sj.emboj.7601229
- Chen B., Dias P., Jenkins J.J. III, Savell V.H., Parham D.M. (1998). Methylation alterations of the MyoD1 upstream region are predictive of subclassification of human rhabdomyosarcomas. Am. J. Pathol. 152: 1071—1079. PMID 9546368