KAT2B (англ. Lysine acetyltransferase 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 832 амінокислот, а молекулярна маса — 93 013[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSEAGGAGPG | | GCGAGAGAGA | | GPGALPPQPA | | ALPPAPPQGS | | PCAAAAGGSG |
ACGPATAVAA | | AGTAEGPGGG | | GSARIAVKKA | | QLRSAPRAKK | | LEKLGVYSAC |
KAEESCKCNG | | WKNPNPSPTP | | PRADLQQIIV | | SLTESCRSCS | | HALAAHVSHL |
ENVSEEEMNR | | LLGIVLDVEY | | LFTCVHKEED | | ADTKQVYFYL | | FKLLRKSILQ |
RGKPVVEGSL | | EKKPPFEKPS | | IEQGVNNFVQ | | YKFSHLPAKE | | RQTIVELAKM |
FLNRINYWHL | | EAPSQRRLRS | | PNDDISGYKE | | NYTRWLCYCN | | VPQFCDSLPR |
YETTQVFGRT | | LLRSVFTVMR | | RQLLEQARQE | | KDKLPLEKRT | | LILTHFPKFL |
SMLEEEVYSQ | | NSPIWDQDFL | | SASSRTSQLG | | IQTVINPPPV | | AGTISYNSTS |
SSLEQPNAGS | | SSPACKASSG | | LEANPGEKRK | | MTDSHVLEEA | | KKPRVMGDIP |
MELINEVMST | | ITDPAAMLGP | | ETNFLSAHSA | | RDEAARLEER | | RGVIEFHVVG |
NSLNQKPNKK | | ILMWLVGLQN | | VFSHQLPRMP | | KEYITRLVFD | | PKHKTLALIK |
DGRVIGGICF | | RMFPSQGFTE | | IVFCAVTSNE | | QVKGYGTHLM | | NHLKEYHIKH |
DILNFLTYAD | | EYAIGYFKKQ | | GFSKEIKIPK | | TKYVGYIKDY | | EGATLMGCEL |
NPRIPYTEFS | | VIIKKQKEII | | KKLIERKQAQ | | IRKVYPGLSC | | FKDGVRQIPI |
ESIPGIRETG | | WKPSGKEKSK | | EPRDPDQLYS | | TLKSILQQVK | | SHQSAWPFME |
PVKRTEAPGY | | YEVIRFPMDL | | KTMSERLKNR | | YYVSKKLFMA | | DLQRVFTNCK |
EYNPPESEYY | | KCANILEKFF | | FSKIKEAGLI | | DK |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
KAT2B
|
---|
|
Наявні структури |
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
Список кодів PDB |
1CM0, 1JM4, 1N72, 1WUG, 1WUM, 1ZS5, 2RNW, 2RNX, 3GG3, 4NSQ, 5FE2, 5FE4, 5FDZ, 5FE8, 5FE5, 5FE1, 5FE7, 5FE9, 5FE3, 5FE0, 5FE6
| | |
Ідентифікатори |
Символи |
KAT2B, CAF, P/CAF, PCAF, lysine acetyltransferase 2B |
Зовнішні ІД |
OMIM: 602303 MGI: 1343094 HomoloGene: 20834 GeneCards: KAT2B
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
посттравматичний стресовий розлад[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Ґаллат епіґаллокатехіну, plumbagin[2] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• transferase activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • acyltransferase activity • histone acetyltransferase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity • protein kinase binding • chromatin binding • lysine N-acetyltransferase activity, acting on acetyl phosphate as donor • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • histone deacetylase binding • acetyltransferase activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • peptide-lysine-N-acetyltransferase activity • diamine N-acetyltransferase activity
|
Клітинна компонента |
• I band • нуклеоплазма • histone acetyltransferase complex • A band • actomyosin • кінетохор • клітинне ядро • цитоплазма • центросома • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • GO:0009327 protein-containing complex
|
Біологічний процес |
• Сигнальний шлях Notch • regulation of protein ADP-ribosylation • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • ритмічний процес • N-terminal peptidyl-lysine acetylation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • histone acetylation • histone H3 acetylation • cellular response to insulin stimulus • histone H3-K9 acetylation • клітинний цикл • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0022415 viral process • peptidyl-lysine acetylation • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • internal peptidyl-lysine acetylation • regulation of megakaryocyte differentiation • protein acetylation • positive regulation of transcription of Notch receptor target • heart development • positive regulation of Notch signaling pathway • negative regulation of centriole replication • limb development • protein deubiquitination
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 3: 20.04 – 20.15 Mb |
Хр. 17: 53.87 – 53.98 Mb |
PubMed search |
[3] |
[4]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, ацилтрансфераз.
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, поліморфізм.
Локалізований у ядрі.
- Yang X.-J., Ogryzko V.V., Nishikawa J., Howard B.H., Nakatani Y. (1996). A p300/CBP-associated factor that competes with the adenoviral oncoprotein E1A. Nature. 382: 319—324. PMID 8684459 DOI:10.1038/382319a0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ogryzko V.V., Schiltz R.L., Russanova V., Howard B.H., Nakatani Y. (1996). The transcriptional coactivators p300 and CBP are histone acetyltransferases. Cell. 87: 953—959. PMID 8945521 DOI:10.1016/S0092-8674(00)82001-2
- Takeshita A., Cardona G.R., Koibuchi N., Suen C.-S., Chin W.W. (1997). TRAM-1, a novel 160-kDa thyroid hormone receptor activator molecule, exhibits distinct properties from steroid receptor coactivator-1. J. Biol. Chem. 272: 27629—27634. PMID 9346901 DOI:10.1074/jbc.272.44.27629
- Zhang W., Bieker J.J. (1998). Acetylation and modulation of erythroid Krueppel-like factor (EKLF) activity by interaction with histone acetyltransferases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 9855—9860. PMID 9707565 DOI:10.1073/pnas.95.17.9855
- Martinez-Balbas M.A., Bauer U.M., Nielsen S.J., Brehm A., Kouzarides T. (2000). Regulation of E2F1 activity by acetylation. EMBO J. 19: 662—671. PMID 10675335 DOI:10.1093/emboj/19.4.662