GFI1 (англ. Growth factor independent 1 transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 422 амінокислот, а молекулярна маса — 45 297[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPRSFLVKSK | | KAHSYHQPRS | | PGPDYSLRLE | | NVPAPSRADS | | TSNAGGAKAE |
PRDRLSPESQ | | LTEAPDRASA | | SPDSCEGSVC | | ERSSEFEDFW | | RPPSPSASPA |
SEKSMCPSLD | | EAQPFPLPFK | | PYSWSGLAGS | | DLRHLVQSYR | | PCGALERGAG |
LGLFCEPAPE | | PGHPAALYGP | | KRAAGGAGAG | | APGSCSAGAG | | ATAGPGLGLY |
GDFGSAAAGL | | YERPTAAAGL | | LYPERGHGLH | | ADKGAGVKVE | | SELLCTRLLL |
GGGSYKCIKC | | SKVFSTPHGL | | EVHVRRSHSG | | TRPFACEMCG | | KTFGHAVSLE |
QHKAVHSQER | | SFDCKICGKS | | FKRSSTLSTH | | LLIHSDTRPY | | PCQYCGKRFH |
QKSDMKKHTF | | IHTGEKPHKC | | QVCGKAFSQS | | SNLITHSRKH | | TGFKPFGCDL |
CGKGFQRKVD | | LRRHRETQHG | | LK |
Коротка інформація Ідентифікатори, Символи ...
GFI1
|
---|
|
Ідентифікатори |
Символи |
GFI1, GFI-1, GFI1A, SCN2, ZNF163, growth factor independent 1 transcriptional repressor |
Зовнішні ІД |
OMIM: 600871 MGI: 103170 HomoloGene: 3854 GeneCards: GFI1
|
---|
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
Клітинна компонента |
• ядерні тільця • nuclear matrix • transcription repressor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
|
Біологічний процес |
• positive regulation of interleukin-6-mediated signaling pathway • negative regulation of neuron projection development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of toll-like receptor signaling pathway • regulation of histone H3-K4 methylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • transcription, DNA-templated • negative regulation of vitamin D biosynthetic process • negative regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to lipopolysaccharide • кровотворення • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/97/PBB_GE_GFI1_206589_at_fs.png/640px-PBB_GE_GFI1_206589_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 1: 92.47 – 92.49 Mb |
Хр. 5: 107.86 – 107.87 Mb |
PubMed search |
[1] |
[2]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Roberts T., Cowell J.K. (1997). Cloning of the human Gfi-1 gene and its mapping to chromosome region 1p22. Oncogene. 14: 1003—1005. PMID 9051000 DOI:10.1038/sj.onc.1200910
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zweidler-Mckay P.A., Grimes H.L., Flubacher M.M., Tsichlis P.N. (1996). Gfi-1 encodes a nuclear zinc finger protein that binds DNA and functions as a transcriptional repressor. Mol. Cell. Biol. 16: 4024—4034. PMID 8754800 DOI:10.1128/MCB.16.8.4024
- Duan Z., Zarebski A., Montoya-Durango D., Grimes H.L., Horwitz M. (2005). Gfi1 coordinates epigenetic repression of p21Cip/WAF1 by recruitment of histone lysine methyltransferase G9a and histone deacetylase 1. Mol. Cell. Biol. 25: 10338—10351. PMID 16287849 DOI:10.1128/MCB.25.23.10338-10351.2005
- Dahl R., Iyer S.R., Owens K.S., Cuylear D.D., Simon M.C. (2007). The transcriptional repressor GFI-1 antagonizes PU.1 activity through protein-protein interaction. J. Biol. Chem. 282: 6473—6483. PMID 17197705 DOI:10.1074/jbc.M607613200
- Ossovskaya V.S., Dolganov G., Basbaum A.I. (2009). Loss of function genetic screens reveal MTGR1 as an intracellular repressor of beta1 integrin-dependent neurite outgrowth. J. Neurosci. Methods. 177: 322—333. PMID 19026687 DOI:10.1016/j.jneumeth.2008.10.031