Przedsiębiorstwo rozpoczęło działalność jako Navimor-Invest Sp. z o.o. w 1991 wskutek przekształceń własnościowych Przedsiębiorstwa Handlu Zagranicznego „Navimor” z Gdańska, istniejącego od 1971[4]. Wśród założycieli i pracowników znalazły się osoby mające wieloletnie doświadczenie w branży hydrotechnicznej oraz budowlanej, dzięki czemu już w początkowym okresie przystąpiono do realizacji dużych i skomplikowanych przedsięwzięć. Specjalnością przedsiębiorstwa jest budownictwo hydrotechniczne, przez szereg lat przeszło 80% rocznych obrotów firmy pochodziło z eksportu, głównie były to realizacje w Czechach, gdzie filia Navimor-Invest z siedzibą w Pradze zyskała znaczącą pozycję, skutecznie konkurując z przedsiębiorstwami czeskimi i zagranicznymi. W ostatnich latach, w wyniku wzmożonego napływu do Polski środków z dotacji unijnych, nastąpiło ożywienie w budownictwie wodnym (liczne rozbudowy i modernizacje zarówno w infrastrukturze portowej, stoczniowej, jak i dla celów żeglarstwa sportowego i turystycznego), wskutek czego udział przychodów z prac prowadzonych w Polsce osiąga obecnie ok. 50%.
Od 1991 Navimor-Invest zrealizował (głównie jako generalny wykonawca) liczne inwestycje, których jednostkowa wartość często przekraczała 10 mln zł, a w niektórych przypadkach wynosiła przeszło 50 mln zł. Po serii powodzi w latach 90. przedsiębiorstwo wyspecjalizowało się w usuwaniu szkód oraz w modernizacjach i budowie skutecznych zabezpieczeń przeciwpowodziowych. Współpraca Navimoru z placówkami naukowo-badawczymi, które zajmują się poszukiwaniem nowych rozwiązań i technologii owocuje rozwiązaniami podnoszącymi poziom bezpieczeństwa powodziowego. Firma realizuje także szereg inwestycji zmierzających do budowy nowoczesnej infrastruktury turystycznej. Uczestniczy też w modernizacji i rozbudowie portów morskich i innych obiektów na całym polskim wybrzeżu.
W 2010 przedsiębiorstwo zostało przekształcone w spółkę akcyjną i 29 czerwca 2011 weszło na GPW na rynek NewConnect[5]. W 2017 akcje wycofano z obrotu w związku z ogłoszoną w tymże roku upadłością spółki[3].
Stopień Wodny Janowice – remont wykonany w latach 2009–2011, wartość kontraktu wyniosła prawie 18 mln zł[7].
Przebudowa Nabrzeża w Porcie Darłowo – (2011-2012)
Przebudowa Szczecińskich Bulwarów – Bulwar Piastowski (2013) – Inwestycja została zrealizowana w ramach projektu „Promenada z widokiem na Odrę – Przebudowa szczecińskich bulwarów”, wartość robót przekroczyła 14 mln zł, przebudowano odcinek nabrzeża o długości ponad 900 m, wyposażono w media i oświetlenie, wybudowano infrastrukturę do obsługi jednostek pływających – pachoły, oczepy, koła ratunkowe, wykonano roboty kafarowe (palowanie i wykonanie ścianek Larsena). Całość zwieńczyły prace konserwatorskie kamiennych elewacji i elementów dekoracyjnych[8].
Port jachtowy w Charzykowach (2006-2007) – wykonano m.in.: falochrony zewnętrzne, pomosty stałe i pływające, nabrzeże czołowe i pochylnię dla jachtów. Port może pomieścić około 100 jachtów[11] W Charzykowach znajduje się siedziba najstarszego w Polsce klubu jachtowego – Chojnickiego Klubu Żeglarskiego[12]
Budowa przystani w Nowej Pasłęce (2011-2012) – wybudowano przystań żeglarską oraz most zwodzony nad kanałem portowym[13]
Budowa morskiej Bazy Zwalczania Zanieczyszczeń w Świnoujściu (2007-2008) – w ramach tej inwestycji wybudowano m.in. Bazę Ratownictwa Morskiego, Bazę Zwalczania Rozlewów oraz Graniczny Punkt Przyjęcia Rozbitków[14].
Przebudowa kanału żeglownego i śluzy České Kopisty na Łabie (2003-2004)[18] oraz śluzy Przebudowa śluzy na stopniu wodnym Štětí na Łabie (2000-2003)[19]
Przystań dla barek Lovosice (1998)[23] i poszerzenie koryta Łaby (1999)[24]
Budowa jazu i elektrowni wodnej Veselí nad Moravou (2000-2002)[25] oraz elektrowni MVE Doksany[26], budowa rozmaitych urządzeń hydrotechnicznych w małych elektrowniach wodnych w Karkonoszach: Svarov, Ponikla, Benesov i Semily (1999-2000)[27]
Modernizacje w wielkich elektrowniach wodnych (VE) na Wełtawie (Vrane, Kamyk, Orlik, Lipno, Hněvkovice, Slapy i Štechovice, 1998-2000)[28]
Budowa nabrzeża w porcie Decin Łaba (1997-1998)[29]
Budowa przystani dla dużych statków rzecznych w porcie Praha-Smíchov (2002-2003)[30]
Przebudowa wejść do śluz na Dolnej Łabie: Roudnice, Štětí, České Kopisty, remont urządzeń małej śluzy (MPK) České Kopisty
Zabezpieczenie przeciwpowodziowe portu Praha Liben
Budowa śluzy przeciwpowodziowej i remont śluz stopnia (VD) na kanale Vraňany – Hořín, naprawa umocnień brzegowych zbiornika wodnego Vrane, pod zaporą Slapy (Wełtawa)
Budowa małej elektrowni MVE Libocany na Ochrza
Regulacja koryt rzek: Panenský potok w Mimoni, Dubská Bystřice
Budowa szybu-awaryjnego wyjścia z tunelu kolejowego Brezno
Regulacja koryta, Lomnicky potok, LGS Pila rejon Karlovy Vary.
Inwestycje na Łabie: naprawa ubezpieczeń brzegowych i pogłębienie koryta Brandýs, Prosečné, Špindlerův Mlýn, port ochronny Nymburk, budowa nabrzeża kontenerowego w porcie Mielnik, budowa przystani dla barek i przebudowa małej śluzy (MPK) Štětí
Przedsiębiorstwo kilkakrotnie zostało laureatem nagród „Gazele Biznesu”
2009 – Certyfikat „Przejrzysta firma” (Dun and Bradstreet Poland)
2009 – Certyfikat „Budowa roku” – Litavka
2011 – Czeski certyfikat jakości ISO 9001, ISO 14001 oraz ISO 18001
2011 – Certyfikat „Budowa roku” – České Vrbné
2011 – Certyfikat „Budowa roku” – Turnov
2012 – Nagroda Czeskiej Izby Inżynierów i Techników
2013 – Nagroda w kategorii „Gospodarka wodna i budownictwo ekologiczne” (Czechy)[31]
W latach 90. Navimor-Invest realizował na zlecenie rządu polskiego kontrakty w Czechach, będąc tym samym istotnym uczestnikiem spłaty polskiego zadłużenia wobec Republiki Czeskiej.