An der Technischen Universität Wien war er von 1961 bis 1968 Assistent bei Karl Schwanzer am Institut für Gebäudelehre und Entwerfen. Er veranstaltete das „Klubseminar der Architekturstudenten“, in dem es zur Zusammenarbeit mit den Experimentalgruppen Coop Himmelb(l)au, Haus-Rucker-Co und Zünd-Up kam. Des Weiteren betreute er das Entwerfen zum experimentellen Bauen, das jeweils im Sommer mit 15 Studenten stattfand. Günther Feuerstein wurde durch seine Lehrveranstaltung zum Katalysator der Weiterentwicklung der Wiener Architektur in den 1960er Jahren. Im Rahmen seiner Vorlesungen lud er Gäste ein, ohne dies zuvor im Dekanat der TU genehmigen zu lassen, unter anderem Walter Pichler. Auf Grund der Missachtung dieser Genehmigungspflicht wurde er nach dem Gastvortrag von Otto Muehl im Rahmen seiner Vorlesung entlassen.
1970–1982 veranstaltete er in seinem Atelier im 4. Bezirk die außeruniversitären Abende des „O. O. – Open Office“, ein Gesprächsforum für Studenten und Fachleute, die über den Horizont der Architektur hinausreichten. An der Universität für künstlerische und industrielle Gestaltung Linz war Günther Feuerstein von 1973 bis 1996 Professor für Umraumgestaltung.
Von 1962 bis 2000 betrieb Günther Feuerstein sein „Atelier für Entwurf, Planung, Forschung“. Er lebte und arbeitete in Wien.
Wohn- und Geschäftshaus, Wien 12., Flurschützstraße 26, Entwurf 1967
Studie Stadtmodell Wien, 1972–1975
Erforschung von Grundlagen für die „Behindertennorm“ (ÖNORM B1600 und B1601)
Spielaktionen, Spielprojekte, 1979–1985: Von der Stadt Wien wurde das Atelier Feuerstein mit der Revitalisierung der Großfeldsiedlung beauftragt. Ein integraler Bestandteil wäre das Spielplatzkonzept gewesen. Da davon nichts realisiert wurde, schritt das Büro zur Selbsthilfe und gründete die Gruppe SP.A.S.S. - Spielaktionen und Soziales Service. Gemeinsam mit Freunden, Bewohnern und Studenten organisierte man selbst Spielplätze und betreute diese auch. Die Aktionen wurden überall begeistert aufgenommen, doch gelang es nicht, die Initiative auf die Bewohner zu übertragen. Eine weitere Initiative, der „Überall Kindergarten“ mit Maria Groh, propagierte die These „Spielplatz und Kindergarten ist in der ganzen Stadt“ weiter.
Integrative Wohngruppe Hirschstetten, in Zusammenarbeit mit Rob Krier und Monika Stein, Wien, 1985–1987
Revitalisierung Augarten, in Zusammenarbeit mit Edgar Göth, Wien, 1988–1995
Sanierung und Revitalisierung Haus Favoriten, in Zusammenarbeit mit Christine Feuerstein, Stadterneuerungspreis, Wien 1994–1996
1966/67 „Urban Fiction“ Galerie St. Stefan Wien, Graz, Innsbruck, Klagenfurt, Linz, Aachen, München
1969 „Hochschule planen bauen“
1988 „Visionäre Architektur in Wien 1958–1988“ in Wien, Linz und Graz
1996 „Inhabited Bridges“ Teilnahme London
1996 „Visionary Architecture in Austria“ Biennale di Venezia mit Christine Feuerstein
1997–2000 Wanderausstellung „Visionäre Architektur“ mit Christine Feuerstein
1970–1989 „Transparent“ Von Günther Feuerstein gegründete monatliche Zeitschrift zur Chronik progressiver, reflektierender und theoretischer Architektur in Österreich
1987–1994 „Daidalos“ Günther Feuerstein war österreichischer Vertreter im Herausgeber-Team
„Thesen zur Inzidenten Architektur“ Manifest 1958
„Verkehrs-Etagen: Otto Wagner und Antonio Sant’Elia | Traffic storeys: Otto Wagner and Antonio Sant’Elia“ in: Daidalos, 1991,42 Seite 62–75
„Ornament und Beschwörung“ in: Transparent, 10–12/1987; Seite 46–55
„Wohnhausgruppe Wien 22, Hirschstettnerstraße – Pogrelzstraße“ in: Transparent, 11–12/1988; Seite 53–85
„Visionäre Architektur. Wien 1958/1988“ Buch zur gleichnamigen Wanderausstellung; Ernst & Sohn; 1988
„COOP Himmelb(l)au - Offene Architektur“ F. Werner, M. Sorkin, G. Feuerstein; Hatje Verlag; 1991
„Androgynos“ Das Mann-Weibliche in Kunst und Architektur | the Male-Female in Art and Architecture; Edition Axel Menges; 1997
„Biomorphic Architecture“ Human and Animal Forms in Architecture; Edition Axel Menges; 2001
„Expandierte Architektur – Günther Feuerstein“ Idee Konzept und Gestaltung: Verein für Architektur und Kommunikation; Herausgeber: Universität für künstlerische und industrielle Gestaltung Linz; 2000 im Schuber mit einer VHS Kassette, die den gleichnamigen Film, der für die ORF-Sendung "Kunststücke" produziert wurde, beinhaltet. Inhalt und Gestaltung des Films: Doris Fercher.
