Baza podataka klasifikacije transportera (ili TCDB) je odobreni sistem Međunarodne unije za biohemiju i molekulsku biologiju (IUBMB), za membranske transportne proteine, uključujući ionski kanal.[1][2][3]
Klasifikacija
Gornji nivo klasifikacije i nekoliko primjera proteina sa poznatom 3D strukturom:
1. Kanali i pore
1.A kanali tipa α
- 1.A.1 Natporodica naponski vođenih ionskih kanala
- 1.A.2 Porodica unutrašnjih ispravljača K+ kanala
- 1.A.3 Porodica rijanodin-inozitol-1,4,5-trisfosfatnih receptora Ca2+kanala
- 1.A.4 Porodica prolaznog potencijala receptora Ca2+kanala
- 1.A.5 Porodica policistinskih kationskih kanala
- 1.A.6 Porodica epitelnih Na+kanala
- 1.A.7 Porodica kationskih kanala P2X receptora sa ATP-om
- 1.A.8 Natporodica glavnih unutrašnjih proteina
- 1.A.9 Receptor neurotransmitera, Cys petlja, porodica ionskih kanala vođenih ligandom
- 1.A.10 Porodica ionskih kanala zatvorenih glutamatom neurotransmiterskih receptora
- 1.A.11 Porodica transportera amonijačnih kanala
- 1.A.12 Porodica unutarćelijskih hloridnih kanala
- 1.A.13 Porodica epitelnih hloridnih kanala
- 1.A.14 Porodica transfer gena poboljšanih testisima
- 1.A.15 Porodica neselektivnih kationskih kanala-2
- 1.A.16 Porodica transportera format-nitrita
- 1.A.17 Kalcij-ovisni hloridni kanali
- 1.A.18 Porodica Tic110 hloroplastne ovojnice koja formira anionske kanale
- 1.A.19 Porodica tipa A matriks-2 kanala virusa gripe
- 1.A.20 Porodica BCL2/adenovirus E1B-interagirajućeg proteina 3
- 1.A.21 Porodica Bcl-2
- 1.A.22 Mehanosenzitivni ionski kanal velike provodljivosti
- 1.A.23 Mehanosenzitivni ionski kanal male provodljivosti
- 1.A.24 Porodica koneksina koji formiraju spojeve
- 1.A.25 Porodica ineksina koji formiraju spojeve
- 1.A.26 E-porodica transportera Mg2+
- 1.A.27 Porodica fosfolemana
- 1.A.28 Porodica transportera ureje
- 1.A.29 Porodica kanala ureje/amida
- 1.A.30 Natporodica H+- ili Na+-translocirajućeg flagelskog motora/ExbBD bakterijskog MotAB transportnog energizatora vanjske membrane
- 1.A.31 Porodica aneksina
- 1.A.32 NB kanal virusa gripe tipa B
- 1.A.33 Protein toplotnog šoka 70 koji formira kationski kanal
- 1.A.34 Porodica kompleksa za formiranje kanala u obliku procjepa kod Bacillus"
- 1.A.35 Porodica CorA metalnih ionskih transportera
- 1.A.36 Porodica unutarćelijskih hloridnih kanala
- 1.A.37 Porodica CD20 Ca2+kanala
- 1.A.38 Porodica Golgijevih regulatora pH
- 1.A.39 Porodica kanala CM2 virusa gripe tipa C
- 1.A.40 Porodica virusne ljudske imunodeficijencije tip I Vpu kanala
- 1.A.41 Porodica ptičjeg reovirusa p10 Vvroporin
- 1.A.42 Porodica HIV virusnih proteina R
- 1.A.43 Otpornost kamfora ili porodica fluoridnog eksportera
- 1.A.44 Pb2 protein vrha repa koji stvara pore porodice T5
- 1.A.45 Porodica injekcija faga P22
- 1.A.46 Porodica bestrofin-formirajućih anionskih kanala
- 1.A.47 ICln porodica nukleotidno-osjetljivog anion-selektivnog kanala
- 1.A.48 Anionski kanal porodice Tweety
- 1.A.49 Porodica viroporina ljudskog koronavirusa ns12.9
- 1.A.50 Porodica fosfolambana (Ca2+-kanal i regulator Ca2+-ATPaza)
- 1.A.51 Porodica naponski-vođenih protonskih kanala (VPC).
- 1.A.52 Porodicaa Ca2+ Ca2+ (CRAC) kanala (CRAC-C) aktiviranog oslobađanjem
- 1.A.53 Porodica virusa hepatitisa C P7 viroporin kation-selektivni kanal (HCV-P7)
- 1.A.54 Porodica kanala za curenje presenilin ER Ca2+ (presenilin)
- 1.A.55 [[kalcijski kanal|Kanal Ca2+ povezan sa sinapsnim vezikulama, porodica flower
- 1.A.56 Porodica bakrenih transportera (Ctr).
- 1.A.57 Ljudski SARS koronavirus, virusni viroporin (SARS-VP)
- 1.A.58 Porodica matriksa proteina 2 (BM2-C) virus gripe tipa B
- 1.A.59 Peptid koji stvara pore virusa Bursne bolesti, porodica Pep46 (Pep46)
- 1.A.60 Peptid koji preformira reovirus sisara, porodica Mu-1 (Mu-1)
- 1.A.61 Porodica lanca F (gama-peptida) koji formira nodavirusni kanal insekata
- 1.A.62 Porodica homotrimernih kationskih kanala (TRIC).
- 1.A.63 Ignicoccus-na vanjska membrana α-spiralni porin (porodica I-OMP)
- 1.A.64 Porodica plazmolipina (plazmolipina).
- 1.A.65 Porodica proteina virusa koronavirusa E (Viroporin E).
- 1.A.66 Porodica pardaksina (pardaksin).
- 1.A.67 Porodica membranskih transportera Mg2+ (MMgT)
- 1.A.68 Porodica virusnih malih hidrofobnih viroporina (V-SH).
- 1.A.69 Porodica heteromernih kanala receptora mirisa (HORC).
- 1.A.70 Porodica antimikrobnih molekula A (MamA)
- 1.A.71 Porodica kanala za proteine rastvorljive u moždanoj kiselini (BASP1 kanal)
- 1.A.72 Natporodica Mer
- 1.A.52 Porodica Ca2+ Ca2+ (CRAC) kanala (CRAC-C) aktiviranog oslobađanjem
- 1.A.53 Porodica virusa hepatitisa C P7 viroporinski kation-selektivni kanal (HCV-P7)
- 1.A.54 Porodica kanala za curenje presenilina ER Ca2+ (presenilin)
- 1.A.55 Vrpca Ca2+ povezana sa sinapsnim vezikulama, porodica cvijeta
- 1.A.56 Porodica bakrenih transportera (Ctr).
- 1.A.57 Ljudski SARS virus koronavirus viroporin (SARS-VP)
- 1.A.58 Porodica matriksa proteina 2 (BM2-C) virusa gripe tipa B
- 1.A.59 Peptid koji stvara pore virusa Bursne bolesti, porodica Pep46 (Pep46)
- 1.A.60 Peptid koji preformira reovirus sisara, porodica Mu-1 (Mu-1)
- 1.A.61 Porodica lanca F (gama-peptida) koji formira kanal nodavirusa insekata
- 1.A.62 Porodica homotrimernih kationskih kanala (TRIC).
- 1.A.63 Porodica Ignicoccusne vanjske membrane α-spiralni porin (porodica I-OMP)
- 1.A.64 Porodica plazmolipina (plazmolipina).
- 1.A.65 Porodica proteina virusa korona virusa E (Viroporin E).
- 1.A.66 Porodica pardaksina (pardaksin).
- 1.A.67 Porodica membranskih transportera Mg2+ (MMgT)
- 1.A.68 Porodica virusnih malih hidrofobnih viroporina (V-SH).
- 1.A.69 Porodica heteromernih kanala receptora mirisa (HORC).
- 1.A.70 Porodica antimikrobnih molekula A (MamA)
- 1.A.71 Porodica kanala za proteine rastvorljive u moždanoj kiselini (BASP1 kanal)
- 1.A.72 Natporodica Mer
- 1.A.73 Porodica kolicinske lize proteina (CLP).
- 1.A.74 Porodica mitsugumin 23 (MG23).
- 1.A.75 Mehanički nociceptor, porodica Piezo (Piezo).
- 1.A.76 Porodica magnezijskih transportera 1 (MagT1).
- 1.A.77 Porodica Mg2+/Ca2+ uniportera (MCU)
- 1.A.78 K+-selektivni kanal porodice endosoma i lizosoma (KEL)
- 1.A.79 Protein za unos holesterola (ChUP) ili porodica za unos dvolančane RNK
- 1.A.80 Porodica NS4a viroporina (NS4a).
- 1.A.81 Porodica Ca2+ kanala niskog afiniteta (LACC)
- 1.A.82 Porodica mehanotransdukcionog kanala dlakinih ćelija (HCMC).
- 1.A.83 Porodica SV40 virusa viroporin VP2 (SV40 VP2)
1.A.84 Porodica modulatora homeostaze kalcija Ca2+ (CALHM-C)
- 1.A.85 Porodica poliovirusa 2B viroporina (2B viroporin).
- 1.A.86 Porodica ljudskog papiloma virusa tip 16 (HPV16) L2 viroporin (L2 viroporin)
- 1.A.87 Porodica mehanosenzitivnih kalcijskih kanala (MCA).
- 1.A.88 Porodica gljivičnih kalijskih kanala (F-Kch).
- 1.A.89 Porodica ljudskih koronavirusa 229E ivroporin (229E viroporin)
- 1.A.90 Porodica virusa ljudskog metapneumovirusa (HMPV) (HMPV-viroporin)
- 1.A.91 Aseksualni protein 3.2 povezan s citoadherencijom iz porodice Plasmodium falciparum (Clag3)
- 1.A.92 Porodica reovirusnog viroporina VP10 (RVP10).
- 1.A.93 Nestrukturni protein 3 virusa plavog jezika porodice Viroporin (NS3)
- 1.A.94 Rotavirus nestrukturni glikoprotein 4 Viroporin (NSP4) Porodica
- 1.A.95 Porodica virusa efemerovirusa (EVVP).
- 1.A.96 Porodica virusa ljudskog polioma virusa (PVVP).
- 1.A.97 Porodica virusa lkudskog papiloma virusa tipa 16 E5 (HPV-E5)
- 1.A.98 Porodica ljudskog T-limfotropni virus 1 P13 proteina (HTLV1-P13)
- 1.A.99 Porodica proteina E (IBV-E) omotnice male membrane virusa infektivnog bronhitisa
- 1.A.100 Porodica Rhabdoviridae putativni viroporin, U5 (RV-U5)
- 1.A.101 Porodica Pex11 (Pex11) koji stvaraju peroksisomske pore
- 1.A.102 Porodica virusa gripe A PB1-F2 (PB1-F2)
- 1.A.103 Porodica majmunskog virusa 5 (Virus parainfluence 5) SH (SV5-SH)
- 1.A.104 Predložena porodica flagelumske biosinteze Na+ kanala, FlaH (FlaH)
- 1.A.105 Porodica mješovite kinzne domenolike loze (MLKL).
- 1.A.106 Porodica kalcijskih kanala aktiviranih punjenjem kalcija (CLAC)
- 1.A.107 Porodica globina koja stvara pore
- 1.A.85 Porodica poliovirusa 2B viroporina (2B viroporin).
- 1.A.86 Porodica ljudsogk papiloma virusa tip 16 (HPV16) L2 viroporin (L2 viroporin)
- 1.A.87 Porodica mehanosenzitivnih kalcijskih kanala (MCA).
- 1.A.88 Porodica gljivičnih kalijkih kanala (F-Kch).
- 1.A.89 Porodica ljudskog koronavirusa 229E viroporina (229E viroporin)
- 1.A.90 Porodica ljudskog virusa metapneumovirusa (HMPV) (HMPV-viroporin)
- 1.A.91 Aseksualni protein 3.2 povezan s citoadherencijom iz porodice Plasmodium falciparum (Clag3)
- 1.A.92 Porodica reovirusa viroporina VP10 (RVP10).
- 1.A.93 Nestrukturni protein 3 virusa plavog jezika porodice viroporin (NS3)
- 1.A.94 Porodica rotavirusa nestrukturnog glikoproteina 4 viroporina (NSP4)
- 1.A.95 Porodica virusa efemerovirusa (EVVP).
- 1.A.96 Porodica ljudskog virusa poliomih virusa (PVVP).
- 1.A.97 Porodica virusa humanog papiloma virusa tipa 16 E5 (HPV-E5)
- 1.A.98 Porodica ljudskog T-limfotropnog virusa 1 P13 protein (HTLV1-P13)
- 1.A.99 Porodica proteina E (IBV-E) omotnice male membrane virusa infektivnog bronhitisa
- 1.A.100 Porodica Rhabdoviridae pretpostavljenog viroporina, U5 (RV-U5)
- 1.A.101 Porodica Pex11 (Pex11) koja stvara peroksisomske pore
- 1.A.102 Porodica virusa gripe A PB1-F2 (PB1-F2)
- 1.A.103 Porodica majmunskog virusa 5 (virus parainfluence 5) SH (SV5-SH)
- 1.A.104 Porodica predložene flagelumske biosinteze kanala Na+, FlaH (Fla
- 1.A.105 Porodica mješovite kinazne domenolike loze (MLKL).
- 1.A.106 Porodica kalcijumskih kanala aktiviranih punjenjem kalcija (CLAC)
- 1.A.107 Porodica globina koji stvaraju pore
1.B. β-barelski porini i drugi proteini vanjske membrane
- 1.B.1 Opća porodica bakterijskih porina
- 1.B.2 Porodica hlamidijskih porina (CP)
- 1.B.3 Porodica šećernih pobrina (SP)
- 1.B.4 Porodica Brucella-Rhizobium porina (BRP)
- 1.B.5 Porodica Pseudomonaskih OprP porina (POP).
- 1.B.6 Porodica Porodica OmpA-OmpF porina (OOP)
- 1.B.7 Porodica Rhodobacter PorCa porina (RPP).
- 1.B.8 Porodica mitohondrijskihih i plastidnih porina (MPP)
- 1.B.9 Porodica proteina vanjske membrane FadL (FadL)
- 1.B.10 Nukleozidni-specifični kanali koji formiraju vanjske membrane porina (Tsx)
- 1.B.11 Porodica fimbrijske usher porin (FUP) vanjske membrane
- 1.B.12 Porodica autotransportera-1 (AT-1)
- 1.B.13 Porodica alginatnih eksportnih porina (AEP)
- 1.B.14 Porodica receptora vanjske membrane (OMR)
- 1.B.15 Porodica rafinoza porina (RafY)
- 1.B.16 Porodica kratkih lanaca amida i porinska ureja (SAP).
- 1.B.17 Porodica faktora vanjske membrane (OMF)
- 1.B.18 Porodica pomoćnih proteina vanjske membrane (OMA)
- 1.B.19 Porodica OprB porina (OprB) selektivna za glukozu
- 1.B.20 Porodica sekrecije sa dva partnera (TPS).
- 1.B.21 Porodica OmpG porina (OmpG) proteina vanjske membrane
- 1.B.22 Porodica sekretina (sekretina) vanjske bakterijske membrane
- 1.B.23 Porodica cijanobakterijskih porina (CBP).
- 1.B.24 Mikobakterijski porin
- 1.B.25 Porodica porina vanjske membrane (Opr)
- 1.B.26 Porodica ciklodekstrinskih porina (CDP).
- 1.B.31 Porodica porina Campylobacter jejuni glavne vanjske membrane (MomP)
- 1.B.32 Porodica porina fuzobakterijske vanjske membrane (FomP).
- 1.B.33 Porodica porinske insercije proteina vanjske membrane (Bam kompleks) (OmpIP)
- 1.B.34 Korinebakterijski porini
- 1.B.35 Porodica porina specifičnih za oligogalakturonat (KdgM)
- 1.B.39 Porodica bakterijskih porina OmpW (OmpW)
- 1.B.42 Porodica eksportnih porina lipopolisaharida vanjske membrane (LPS-EP)
- 1.B.43 Porodica Coxiella porina P1 (CPP1)
- 1.B.44 Porodica vjerovatno translociranih proteina porphyromonas gingivalis porina (PorT)
- 1.B.49 Porodica anaplazmatskih P44 (A-P44) porina
- 1.B.48 Kovrdžoliki transporteri
- 1.B.54 Porodica Intimin/Invasin (Int/Inv) ili autotransportera-3
- 1.B.55 Porodica poli-acetil-D-glukozamin porina (PgaA)
- 1.B.57 Porodica proteina legionelske glavne vanjske membrane (LM-OMP).
- 1.B.60 Porodica Omp50 porina (Omp50 Porin)
- 1.B.61 Porodica delta-proteobakterijskih porina (Delta-porin)
- 1.B.62 Pretpostavljena porodica bakterijskih porina (PBP).
- 1.B.66 Pretpostavljena porodica beta-barelskog porina-2 (BBP2).
- 1.B.67 Pretpostavljena porodica beta-barelskog porina-4 (BBP4)
- 1.B.68 Pretpostavljena natporodica beta-barelskog porina-5 (BBP5)
- 1.B.70 Porodica vanjskih membranskih kanala (OMC).
- 1.B.71 Porodica proteobakterijskih/verukomikrobnih porina (PVP)
- 1.B.72 Porodica protohlamidijskih porina vanjske membrane (PomS/T)
- 1.B.73 Porodica biogeneze/sastavljanja kapsule (CBA).
- 1.B.78 Porodica DUF3374 porina povezanih s transportom elektrona (ETPorin)
1.C Toksin koji stvara pores (proteini i peptidi)
- 1.C.3 Porodica α-hemolizina (αHL)
- 1.C.4 Porodica aerolizina
- 1.C.5 Porodica ε-toksin
- 1.C.11 Natporodica RTX-toksina
- 1.C.12 Natporodica Kompleks napada na membranu/perforin
- 1.C.13 Porodica leukocidina
- 1.C.14 Porodica citohemolizina (CHL)
- 1.C.39 Porodica citolizina ovisnih od holesterolu aktivirana tiolom
- 1.C.43 Porodica lizenina
- 1.C.56 Porodica kationskih kanala Pseudomonas syringae HrpZ
- 1.C.57 Porodica klostridijskih citototoksina
- 1.C.58 Porodica mikrocina E492/C24 (mikrocin E492)
- 1.C.74 Porodica zmijskih citotoksina (SCT)
- 1.C.97 Porodica pleurotolizinskog formiranja pora
1.D Neribosomski sintetizirani kanali
- 1.D.1 Porodica kanala gramicidin A.
- 1.D.2 Porodica koja formira kanale siringomicina
- 1.D.3 Porodica siringopeptina koji formira kanale
- 1.D.4 Porodica koja formira kanal tolaasin
[* 1.D.5 Porodica koja formira alameticinske ili peptaibolne kanale antibiotika
- 1.D.6 Porodica kompleksnih poli 3-hidroksibutiratnih Ca2+ kanala (cPHB-CC)
- 1.D.7 Porodica betaholina
- 1.D.8 Porodica saponina
- 1.D.9 Porodica poliglutaminskih ionskih kanala (PG-IC)
- 1.D.10 Porodica kanala koja formira keramid
- 1.D.11 Porodica surfaktina
- 1.D.12 Porodica beauvericina (Beauvericin)
- 1.D.13 Amfipatski peptidni antibiotici za isporuku DNK (DAPA)
- 1.D.14 Porodica sintetskih Leu/Ser amfipatskih peptida koji formiraju kanale (l/S-SCP)
- 1.D.15 Porodica daptomicina (daptomicina)
- 1.D.16 Porodica sintetskih amfipatskih heptapeptida koji formiraju pore (SAPH)
- 1.D.17 Porodica kombinatornog dizajniranja peptida β-listova koja stvara pore
- 1.D.18 Porodica konjugata guanozin-žučne kiseline koja stvara pore
- 1.D.19 PorodicaCa2+ liijeka koji formira kanale digitoksina
- 1.D.20 Porodica polienskih makrolidnih antibiotika/gljivičnih agenasa (PMAA) koji stvaraju pore
- 1.D.21 Porodica lipidnih nanopora (LipNP).
- 1.D.22 Porodina karotenoidnih pigmenta koji translociraju protonske zeaksantine
- 1.D.23 Porodica fenilen - etinilen antimikrobnih tvari koje stvaraju pore (PEPA)
- 1.D.24 Porodica politeonamida B (pTB) morskog sunđera
- 1.D.25 Porodica arilaminskog foldamera (AAF).
- 1.D.26 Porodica dihidrodehidrodikoniferil alkohola 9'-O-β-D-glukozida (DDDC9G)
- 1.D.27 Porodica tiourejinih izostera
- 1.D.28 Porodica lipopeptaibola
- 1.D.29 Porodica makrocikličnih oligoholata
- 1.D.30 Porodica [5]arenskih kanala (HAPA-C) sa dodatkom vještačkog hidrazida
- 1.D.31 Porodica amfotericina B.
- 1.D.32 Porodica novicidina koja stvara pore
- 1.D.33 Porodica koja formira kanale politeonamida B.
- 1.D.34 Oligoester bolaamphiphiles koji formira kanal
- 1.D.35 Ciklična porodica Lipodepsipeptidae koja stvara pore
- 1.D.36 Porodica oligobornenskih ionskih kanala
- 1.D.37 Porodica Hibicuslide C.
- 1.D.38 Porodica ciklične peptidne nanotubule (cPepNT).
- 1.D.39 Porodica amfifilnih molekulskih ionskih kanala (AAM-IC) na bazi azobenzena
- 1.D.40 Porodica lipidnih toroidnih pora izazvanih proteinima
- 1.D.41 Porodica ionofora (spiroheksanolida) tipa sprotetonat
- 1.D.42 Porodica Phe-Arg tripeptidnog stuba[5] arenskog kanala (TPPA-C)
- 1.D.43 Porodica guanozin-dinukleozidnog kanala (TT-GDN-C) skrojena za triazole
- 1.D.44 Porodica sintetskih ionskih kanala s redoks-aktivnim ferocenom (ICRF)
- 1.D.45 Porodica sonoporacije i elektroporacije membranskih pora (SEMP)
- 1.D.46 Porodica DNK nanopora (DnkNP).
- 1.D.47 Porodica sintetskih cikličnih peptida koji stvaraju pore (PSCP)
- 1.D.48 Porodica koja stvara pore siringomicina E.
- 1.D.49 Porodica transmembranskih karotenoidnih radikalnih kanala (CRC).
- 1.D.50 Porodica amfifilnskih bis-kateholskih anionskih transportera (AC-AT)
- 1.D.51 Porodica proteinskih nanopora (ProNP).
- 1.D.52 Porodica aromatsknih oligoamida makrocikličnih nanopora (OmnNP)
- 1.D.53 Porodica alfa, gama-peptidnih nanocijevi (a,gPepNT)
- 1.D.54 Porodica heksil-benzoureido-15-kruna-5-eterskih ionskih kanala (HBEC) selektivna na kalij
- 1.D.55 Porodica porfirin-baziranih nanopora (PorNP)
- 1.D.56 Porodica alfa-aminoizobutirata (Aib) oligomernih nanopora (AibNP)
- 1.D.57 Porodica lipidnih elektropora (LEP).
- 1.D.58 Porodica anionskih transportrajućih prodigiosena (prodigiosen)
- 1.D.59 Porodica perenozina koji prenosi anion (perenozin).
- 1.D.60 Porodica alfa, gama-cikličnih peptida (AGCP)
- 1.D.61 Porodica anionofornih Šablon:Chem name (ABBP)
- 1.D.62 Porodica za formiranje kanala (TDG) derivata bis-triazolil diguanozina
- 1.D.63 Porodica nanopora na bazi peptida (PepNP).
- 1.D.64 Porodica ugljičnih nanocijevi (CarNT).
- 1.D.65 Porodica amfidinol (amfidinol) koji stvara pore
- 1.D.66 Porodica heliksnih makromolekulskih nanopora (HmmNP).
- 1.D.67 Porodica spiralnih peptidnih ionskih kanala (CEHP) modificiranih krunskim eterom
- 1.D.68 Porodica pleuronskog blok-polimera koji formira pore (PPBP)
- 1.D.69 Porodica konusnih nanopora (ConNP).
- 1.D.70 Porodica metalnih (Au/Ag/Pt/grafenskih) nanopora (MetNP)
- 1.D.71 Porodica sintetskih TP359 peptida (TP359)
- 1.D.72 Porodica tripodalnih receptora na bazi triazinskih (CCTTR) nosača hlorida
- 1.D.73 Porodica mezoporoznih silicijskih nanopora (SilNP).
- 1.D.74 Porodica sintetskih krutih p-oktifenilnih pora (SSROP) koja reagira na stimulans
1.E Holini
1.F Vezikulskofuzijske pore
- 1.F.1 Porodica fuzijskih pora sinaptosomnih vezikula (SVF-pore)
- 1.F.2 Porodica oktamermih egzocista (egzocista)
1.G Virusnofuzijska pora
- 1.G.1 Porodica virusnih membranskih fuzijskih proteina-1 (VMFP1)
- 1.G.2 Porodica virusnih membranskih fuzijsih proteina-2 (VMFP2)
- 1.G.3 Porodica virusnih membranskih fuzijskih proteina-3 (VMFP3)
- 1.G.4 Porodica virusnih membranskih fuzijskih proteina-4 (VMFP4)
- 1.G.5 Porodica virusnih membranskih fuzijskih proteina-5 (VMFP5)
- 1.G.6 Porodica hepadnkvirusnog S fuzijskog proteina (HBV-S proteina)
- 1.G.7 Porodica reovirusnih FAST fuzijskih proteina (R-FAST).
- 1.G.8 Porodica arenavirusnih fuzijskig proteina (AV-FP).
- 1.G.9 Porodica sincitina (sincitin)
- 1.G.10 Porodica membranskog fuzijskog kompleksa virusa herpes simplex (HSV-MFC)
- 1.G.11 Porodica proksvirusa kopleksa proteina ćelijskog ulaza (PEP-C)
- 1.G.12 Porodica virusa ptičje leukoze gp95 fuzijskog proteina (ALV-gp95)
- 1.G.13 Porodica malih transmembrana (FAST) povezana sa fuzijom ortoreovirusa
- 1.G.14 Porodica hemaglutinina virusa gripe/proteina koji stvara fuziju (Influenca-H/FPP)
- 1.G.15 Porodica virusa jedarne poliedroze utografa kalifornika glavnog omotača glikoproteina GP64 (GP64)
- 1.G.16 Porodica fuzijskih peptida tipa 1 (HIV-1) virusa ljudske imunodeficijencije (HIV-FP)
- 1.G.17 Porodica glikoproteinskog omotača virusa goveđe leukemije (BLV-Env)
- 1.G.18 SARS-CoV fuzijski peptid u porodici prekursora glikoproteina šiljaka (SARS-FP)
- 1.G.19 Porodica membranskog fuzijskog kompleksa koji stvara pore (rotavirus MFC)
- 1.G.20 Porodica hantavirusa Gc omotačkog fuzijskog glikoproteina (Gc-EFG)
- 1.G.21 Porodica Epstein Barrovih virusa (ljujdski herpes virus 4) Gp42 (Gp42)
- 1.G.22 Porodica glikoproteina gO (gO) citomegalovirusa (ljudski herpesvirus 5)
1.H Paraćelijski kanali
- 1.H.1 Porodica klaudinskih čvrstih veza (klaudin1)
- 1.H.2 Porodica beskičmenjačkih PMP22-klaudina (klaudin2)
1.I Membranski vezani kanali
- 1.I.1 Porodica kompleksa jedarnih pora, uključujući karioferine
- 1.I.2 Porodica biljaka s plazmodezmama
2. Elektrohemijski potencijalni transporteri
2.A Porteri (uniporteri, simporteri, antiporteri)
- 2.A.1 Natporodica glavnih fascilitatora (MFS), vidi također Laktozna permeaza, Fosfatna permeaza i Transporter glukoze
- 2.A.2 Glikozid-pentozid-heksuronid (GPH):Porodica kationskih simportera
- 2.A.3 APC porodica aminokiselina-poliamin-organokacija (APC)
- 2.A.4 Porodica fascilitator kationske difuzije (CDF)
- 2.A.5 Porodica Cink (Zn2+)-gvožđe (Fe2+) permeaza
- 2.A.6 Natporodica rezistencija-nodulacija-ćelijska dioba, vidi također SecDF protein-eksportni membranski protein
- 2.A.7 Natporodica transportera lijeka/metabolita (DMT)
- 2.A.8 Porodica glukonat:H+ simporter (GntP)
- 2.A.9 Porodica membranskih proteinskih insertaza (YidC/Alb3/Oxa1)
- 2.A.10 Porodica transportera 2-keto-3-deoksiglukonata (KdgT)
- 2.A.11 Porodica citrat-Mg2+:H+ (CitM) citrat-Ca2+:H+ (CitH) simporter (CitMHS)
- 2.A.12 Porodica ATP:ADP antiporter
- 2.A.13 Porodica preuzimanja C4-dikarboksilata (Dcu).
- 2.A.14 Porodica laktatne permeaze
- 2.A.15 Porodica netain/karnitin/holin transportera (BCCT)
- 2.A.16 Porodica Porodica telurit-otpornost/dikarboksilat transportera
- 2.A.17 Porodica proton-ovisnih oligopeptidnih transportera
- 2.A.18 Porodica aminokiselina/auksinskih permeaza (AAAP).
- 2.A.19 Porodica Ca2+:kationskih antiportera (CaCA)
- 2.A.20 Porodica transportera anorganskog fosfata (PiT).
- 2.A.21 Porodica natrijskih simportera
- 2.A.22 Porodica neurotransmitera:natrijevih simportera
- 2.A.23 Porodica dikarboksilata/aminokiselina: kation (Na+ ili H+) simportera (DAACS)
- 2.A.24 Porodica transportera 2-hidroksikarboksilata (2-HCT)
- 2.A.25 Porodica alaninskih ili glicinskih kationskih sumportera (AGCS)
- 2.A.26 Porodica aminokiselina razgranatog lanca:kationski simporter (LIVCS)
- 2.A.27 Porodica Glutamat:Na+ simportera (ESS)
- 2.A.28 Porodica simportera žučne kiseline:Na+
- 2.A.29 Porodica mitohondrijskih nosača
- 2.A.30 Porodica kation-hloridnih kotransportera (CCC)
- 2.A.31 Porodica anionskih izmjenjivača
- 2.A.32 Porodica silikonskih transportera (Sit).
- 2.A.33 Porodivca NhaA Na+:H+ antiportera (NhaA)
- 2.A.34 Porodica NhaB Na+:H+ antiportera (NhaB)
- 2.A.35 Porodica NhaC Na+:H+ antiportera (NhaC)
- 2.A.36 Porodica monovalentnih kationa:Protonskog antiportera-1 (CPA1)
- 2.A.37 Porodica monovalentnih kationa:protonskih antiportera-2 (CPA2)
- 2.A.38 Porodica K+ transportera (Trk)
- 2.A.39 Porodica nukleobaza:kation simporter-1 (NCS1)
- 2.A.40 Porodica nukleobaznih:kationskih simmportera-2 (NCS2)
- 2.A.41 Porodica koncentrisanih nukleozidnih transportera (CNT).
- 2.A.42 Porodica hidroksi/aromatske aminokiselinske permeaze (HAAAP)
- 2.A.43 Porodica lizosomnih cistinskih transportera (LCT).
- 2.A.45 Porodica arsenit-antimonitskih efluksa
- 2.A.46 Porodica benzoata:H+ simportera (BenE)
- 2.A.47 Porodica divalentnih aniona:Na+simportera (DASS)
- 2.A.48 Porodica redukovanog nosača folata (RFC).
- 2.A.49 Porodica hloridnih nosača/kanala (ClC)
- 2.A.50 Porodica preuzimanja glicerola (GUP).
- 2.A.51 Porodica transportera hromatnih iona (CHR).
- 2.A.52 Porodica transportera Ni2+-Co2+ (NiCoT)
- 2.A.53 Porfodica sulfatnih permeata (SulP)
- 2.A.54 Porodica mitohondrijskih trikarboksilatnih nosača (MTC).
- 2.A.55 Porodica transportera metalnih iona (Mn2+-gvožđe) (Nramp)
- 2.A.56 Porodica tripartitnih ATP-nezavisnih periplazmatskih transportera (TRAP-T)
- 2.A.57 Porodica ekvilibrativnih nukleozidnih transportera (ENT).
- 2.A.58 Porodica fosfatnih:Na+ simportera (PNaS)
- 2.A.59 Porodica otpornosti na arsen-3 (ACR3).
- 2.A.60 Porodica transportera organskog aniona (OAT)
- 2.A.61 Porodica C4-dikarboksilata preuzimanja C (DcuC).
- 2.A.62 Porodica NhaD Na+:H+ antiportera (NhaD)
- 2.A.63 Porodica protonskih antiporter-3 (CPA3): monovalentnih kationa (K+ ili Na+):
- 2.A.64 Porodica ciljanja blizanaca arginina (Tat)
- 2.A.65 Porodica transportera bilirubina (BRT).
- 2.A.66 Natporodica flipaza za više lijekova/oligosaharidil-lipida/polisaharida (MOP)
- 2.A.67 Porodica oligopeptidnih transportera (OPT).
- 2.A.68 Porodica transportera p-Aminobenzoil-glutamata (AbgT)
- 2.A.69 Porodica nosača efluksa auksina (AEC).
- 2.A.70 Porodica malonata:Na+ simporter (MSS)
- 2.A.71 Porodica transportera folata i biopterina (FBT).
- 2.A.72 Porodica K+ preuzimanja permeaza (KUP)
- 2.A.73 Porodica preuzimanja masnih kiselina kratkog lanca (AtoE).
- 2.A.74 Porodica 4 TMS višestrukih endosomnih transportera (MET).
- 2.A.75 Porodica L-Lizinskih eksportera (LysE).
- 2.A.76 Porodica otpornost na homoserin/treonin (RhtB)
- 2.A.77 Porodica otpornosti na kadmij (CadD).
- 2.A.78 Porodica eksportera aminokiselina razgranatog lanca (LIV-E).
- 2.A.79 Porodica eksportera treonina/serina (ThrE).
- 2.A.80 Porodica trikarboksilatnih transportera (TTT).
- 2.A.81 Porodica izmjenjivača aspartata:alanina (AAEx).
- 2.A.82 Porodica transportera organskih rastvora (OST).
- 2.A.83 Porodica transportera bikarbonata (SBT) zavisna od Na+
- 2.A.84 Porodica eksportera hloroplastnih maltoza (MEX).
- 2.A.85 Porodica eksporteraa aromatske kiseline (ArAE).
- 2.A.86 Porodica sutoinduktora-2 eksportera (AI-2E) (ranije porodica PerM, TC #9.B.22)
- 2.A.87 Porodica prokariotskih transportera riboflavina (P-RFT).
- 2.A.88 Porodica transportera za unos vitamina (VUT ili ECF).
- 2.A.89 Porodica vakuolskog transportera gvožđa (VIT).
- 2.A.90 Porodica receptora/transportera vitamina A (STRA6)
- 2.A.91 Importni kompleks mitohondrijske tRNK (M-RIC) (ranije 9.C.8)
- 2.A.92 Porodica sličnih transporteru holina (CTL).
- 2.A.94 Porodica fosfatne permeaze (Pho1).
- 2.A.95 Porodica 6TMS neutralnih aminokiselinskih transportera (NAAT).
- 2.A.96 Porodica transportera za unos acetata (AceTr).
- 2.A.97 Porodica izmjenjivača unutrašnje mitohondrijske membrane K+/H+ i Ca2+/H+ (LetM1).
- 2.A.98 Porodica pretpostavljenih eksportera sulfata (PSE).
- 2.A.99 Porodica transportera 6TMS Ni2+ (HupE-UreJ)
- 2.A.100 Porodica feroportina (Fpn).
- 2.A.101 Porodica preuzimanja malonata (MatC) (ranije UIT1)
- 2.A.102 Porodica preuzimanja 4-toluen sulfonat-permeaza (TSUP)
- 2.A.103 Porodica eksportera bakterijskih prekursora mureina (MPE).
- 2.A.104 Porodica eksportera L-alanina (AlaE).
- 2.A.105 Porodica nosača mitohondrijskog piruvata (MPC).
- 2.A.106 Porodica Ca2+:H+ antiportera-2 (CaCA2)
- 2.A.107 Porodica eksportera-importeraa MntP Mn2+ (MntP)
- 2.A.108 Porodica transportera željeza/olova (ILT).
- 2.A.109 Porodica otpornosti na ione telura (TerC).
- 2.A.110 Porodica genskih proteina koji reaguju na hem: hemski transporter (HRG)
- 2.A.111 Porodica Na+/H+ antiportera-E (NhaE)
- 2.A.112 Porodica antigena krvne grupe KX (KXA).
- 2.A.113 Porodica transportera nikla/kobalta (NicO).
- 2.A.114 Porodica pretpostavljenih transportera peptida CstA (CstA) gladovanja ugljika
- 2.A.115 Porodica eksportera novobiocina (NbcE).
- 2.A.116 Porodica peptidoglikolipidnog adresirajućeg proteina (GAP)
- 2.A.117 Porodica eksportera hlorheksadina (CHX).
- 2.A.118 Porodica antiportera osnovnih aminokiselina (ArcD).
- 2.A.119 Porodica eksporteraa organskog arsena (ArsP).
- 2.A.120 Porodica pretpostavljenih aminokiselinskih permeaza (PAAP).
- 2.A.121 Porodica transportera sulfata (CysZ).
- 2.A.122 Porodica pomoćnih proteina sličnih LrgB/CidB holinu (LrgB/CidB)
- 2.A.123 Porodica slatkuih: PQ-petlja, pljuvačka MtN3 (slatka)
- 2.A.124 Porodica eksportera lizina (LysO).
- 2.A.125 Porodica eukariotskih transportera riboflavina (E-RFT).
- 2.A.126 Porodica eksportera masnih kiselina (FAX).
- 2.A.127 Porodica enterobakterijskih kardiolipinskih transportera (CLT).
2.B Neribosomski sintetizirani porteri
- 2.B.1 Porodica nosača valinomicina
- 2.B.2 Porodica monensina
- 2.B.3 Porodica nigericina
- 2.B.4 Porodica makrotetrolidnih antibiotika (MA).
- 2.B.5 Porodica makrocikličkog polietera (MP).
- 2.B.6 Porodica ionomicina
- 2.B.7 Porodica transmembranske α-heliksne translokacije fosfolipidnih peptida (TMP-PLT)
- 2.B.8 Porodica bafilomicinskih A1 (Bafilomycin).
- 2.B.9 Porodica peptida koji prodiru u ćelije (CPP) funkcionalna porodica
- 2.B.10 Porodica sintetskih CPP transportana
- 2.B.11 Porodica kalcimicinskih ili A23187 ionofora tipa nosioca
- 2.B.12 Porodica salinomicina
- 2.B.13 Porodica tetrapirolnih makrocikličkih anionskih antiportera (TPMC-AA)
- 2.B.14 Porodica lazalocidda A ili X-537A ionofora (Lasalocid)
- 2.B.15 Porodica nosača hlorida na bazi tris-tioureje (TTT-CC)
- 2.B.16 Porodica spojenih anionskih nosača (HCAC) koja sadrži halogenu vezu
- 2.B.17 Porodica derivata izoftalamina H+:Cl−kotransportera (IDC)
- 2.B.18 Porodica kotransporterskih derivata piridin-2,6-dikarboksamina (PDCA) H+:Cl−
- 2.B.19 Porodica derivata pirola Calix(4) (C4P)
- 2.B.20 Porodica izmjenjivača prodigiosina (prodigiosin) hlorid/bikarbonat
- 2.B.21 Porodica anionskih transportera (oPDA-U) derivata orto-fenilendiamin-bis-ureje
- 2.B.22 Porodica anionskih transportera (IAT) funkcionalizovanih imidazolijem
- 2.B.23 Porodica transmembranskih homotetramera Zn2+/Co2+: Protonnski sintetski asntiporter, Rocker (Rocker)
- 2.B.24 Porodica Šablon:Chem name anionskih nosača (BBP-AC)
- 2.B.25 Porodica Lipid-Flip-Flop (PLFF) posredovana peptidima
- 2.B.26 Porodica konjugata (BIBCC) Šablon:Not a typo Šablon:Not a typo
- 2.B.27 Porodica tris-urea anionskih transportera
- 2.B.29 Porodica anionofornih morskih alkaloida tambjamina
2.C Energezatori vođeni ionskim gradijentom
- 2.C.1 Porodica pomoćnih proteina TonB-ExbB-ExbD/TolA-TolQ-TolR (TonB) za energiziranje aktivni transport|aktivnog transporta posredovanog receptorom vanjske membrane (OMR)
3. Primarni aktivni transporteri
3.A. Transporteri vođeni hidrolizom P-P veze
- 3.A.1 ABC transporter uključujući BtuCD, transporter za unos molibdata, regulator transmembranske provodljivosti cistične fibroze i druge
- 3.A.2 Natporodica H+- ili Na+-translocirajuća F-tip ATPaza, V-tip ATPaza i A-tip ATPase
- 3.A.3 Natporodica P-tipa ATPaza
- 3.A.4 Porodica efluksa arsenita i antimonita
- 3.A.5 Opći sekretorni put (Sec) translokona (preproteinska translokaza SecY)
- 3.A.6 Porodica sekretornih puteva tipa III (vezano za virulenciju) (IIISP)
- 3.A.7 Porodica sekretornog puta tipa IV (konjugatni DNK-proteinski transfer ili VirB) (IVSP)
- 3.A.8 Porodica mitohondrijske proteinske translokaze (MPT).
- 3.A.9 Porodica translokaze proteina omotača hloroplasta (CEPT ili Tic-Toc)
- 3.A.10 Porodica H+, Na+-translocirajuća H+, Na+-translocirajuća pirofosfataza
- 3.A.11 Porodica transportera DNK za transformaciju DNK (DNK-T) vezana za bakterijsku kompetenciju
- 3.A.12 Porodica septnih DNK translokatora (S-DNA-T).
- 3.A.13 Porodica eksportera filamentnih faga (FPhE).
- 3.A.14 Porodica fimbrilina/eksportera proteina (FPE).
- 3.A.15 Porodica glavne terminalne grane (MTB) koja luči protein vanjske membrane
- 3.A.16 Porodica endoplazmatskretikulumskog retrotranslokona (ER-RT).
- 3.A.17 Porodica fagnog T7 Injektisoma (T7 Injektisom)
- 3.A.18 Porodica jedarnih eksportera iRNK (iRNK-E).
- 3.A.19 Porodica TMS kompleksa za prepoznavanje/umetanje (TRC).
- 3.A.20 Porodica importera peroksisomnih proteina (PPI).
- 3.A.21 Porodica biogeneze/kompleksa insercije membranskih proteina usidreni repom C-terminala (TAMP-B)
- 3.A.22 Porodica TREX/TAP jedarnog eksportnog kompleksa iRNK (TREX) povezan s transkripcijom
- 3.A.23 Porodica simbioze/sekretornog puta virulencije tipa VI (VISP)
- 3.A.24 Porodica sistema za izlučivanje proteina tipa VII ili ESX (T7SS).
- 3.A.25 Porodica mehanizama nalik na ERAD (SELMA) specifična za sumbionte
- 3.A.26 Porodica eksportnih proteina Plasmodium-skog translokona (PTEX)
3.B Transporteri vođeni dekarboksilacijom
- 3.B.1 Porodica Na+-transportne dekarboksilaze karboksilne kiseline (NaT-DC)
3.C Transporteri sa metiltransferom
- 3.C.1 Porodica Na+ koja prenosi metiltetrahidrometanopterin: koenzim M-metiltransferaza (NaT-MMM)
3.D. Oksidoredukcioni transporteri
Oni uključuju brojne transmembranske proteine slične citohromu b, uključujući koenzim Q-citohrom c reduktazu (citohrom bc1); kompleks citohroma b6f; format dehidrogenaza, respiratorna nitrat- reduktaza; sukcinat-koenzim Q reduktaza (fumarat-reduktaza) i sukcinat-dehidrogenaza.
- 3.D.1 Porodica [[NADH:ubikinon-reduktaza (H+-translokacija)|H+ ili Na+-translocirajuća NADH dehidrogenaza ("kompleks I")
- 3.D.2 Porodica proton-translocirajuće transhidrogenaze (PTH).
- 3.D.3 Natporodica proton-translocirajućeg kvinola: citohrom c reduktaza)
- 3.D.4 Natporodica citohrom-oksidaza koja translocira proton (COX)
- 3.D.5 Porodica Na+-translocirajuća NADH:kinon dehidrogenaza (Na-NDH ili NQR)
- 3.D.6 Porodica pretpostavljenih iona (H+ ili Na+)-translocirajućih NADH:Feredoksin-oksidoreduktaza (NFO ili RNF)
- 3.D.7 Porodica H2:Heterodisulfid oksidoreduktaza (HHO)
- 3.D.8 Porodica Na+- ili H+-pumpanja formil-metanofuranskih dehidrogenaza (FMF-DH)
- 3.D.9 Porodica H+-translocirajućih F420H2 dehidrogenaza (F420H2DH)
- 3.D.10 Porodica prokariotske sukcinat-dehidrogenaze (SDH).
3.E. Transporteri vođeni apsorpcijom svjetlosti
- Proteini slični bakteriorodopsinu, uključujući rodopsin (vidi također opsin)
- Bakterijski fotosintetički reakcijski centar i fotosistem I i II
- Kopleks svjetlosnog upijanjae bakterija i hloroplasta
4. Grupni translokatori
4.A Grupni translokatori vođeni fosfotransferom
- 4.A.1 Porodica PTS glukoza-glukozida (Glc)
- 4.A.2 Porodica PTS fruktoza-manitol (Fru).
- 4.A.3 Porodica PTS laktoza-N,N'-diacetilhitobioza-β-glukozida (Lac)
- 4.A.4 Porodica PTS glucitol (crijeva).
- 4.A.5 Porodica PTS galaktitola (Gat).
- 4.A.6 Porodica PTS manoza-fruktoza-sorboza
- 4.A.7 Porodica PTS L-askorbata (L-Asc).
4.B Transporteri preuzimanja nikotinamid ribonukleozida
- 4.B.1 Porodica permeaze preuzimanja nikotinamid-ribonukleozida (NR) (PnuC)
4.C Acil CoA ligazom spregnuti transporteri
- 4.C.1 Predložena porodica transportera masnih kiselina (FAT).
- 4.C.2 Porodica karnitin O-acil transferaza (CrAT).
- 4.C.3 Porodica Acyl-CoA tioesteraza (AcoT).
4.D Polisaharid-sintaza/eksporteri
- 4.D.1 Porodica pretpostavljene vektorske polimerizacije glikozila (VGP).
- 4.D.2 Porodica glikozil-transferaze 2 (GT2).
- 4.D.3 Porodica glikan-glukozil transferaze (OpgH).
4.E. Grupni translokatori katalizirani vakuolskim polifosfatnim polimerazom
- 4.E.1 Porodica vakuolske (acidokalcisom) polifosfatne polimeraze (V-PPP)
5. Transportni nosači elektrona
5.A Transmembranski 2-elektronski prijenosnici
- 5.A.1 Porodica oksidoreduktaze D (DsbD) disulfidne veze
- 5.A.2 Porodica disulfidne veze oksidoreduktaze B (DsbB).
- 5.A.3 Porodica oksidoreduktaze (PMO) koja sadrži prokariotski molibdopterin
5.B Transmembranski 1-elektronski prijenosni nosači
- 5.B.1 Porodica fagocitnih (gp91phox) NADPH oksidaza
- 5.B.2 Porodica eukariotskih citohrom b561 (Cytb561)
- 5.B.3 Porodica geobakterskog nanonizova elektronskog transfera (G-NET).
- 5.B.4 Porodica natkompleksa I (PSI) biljnih fotosistema
- 5.B.5 Porodica vanćelijskih metalnih oksido-reduktaza (EMOR).
- 5.B.6 Porodica transmembranskih epitelnih antigenih proteina-3 feri-reduktaze (STEAP)
- 5.B.7 Porodica YedZ (YedZ)
- 5.B.8 Porodica porin/citohrom kompleksa (ET-PCC) za prijenos elektrona preko vanjske membrane
- 5.B.9 Porodica porin-citohrom c (Cyc2).
8. Pomoćni faktori uključeni u transport
8.A Pomoćni transportni proteini
8.B Ribosomski sintetizirani proteinski/peptidni toksini koji ciljaju kanale i nosače
8.C Neribozomski sintetizirani toksini koji ciljaju kanale i nosače
9. Nepotpuno okarakterizirani transportni sistemi
9.A Prepoznati transporteri nepoznatog biohemijskog mehanizma
9.B Pretpostavljeni transportni proteini
9.C Funkcionalno karakterizirani transporteri bez identifikovanih sekvenci
Reference
Vanjski linkovi
Wikiwand in your browser!
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.