Globin
From Wikipedia, the free encyclopedia
From Wikipedia, the free encyclopedia
Globini (lat. globus, prema grč. σφαίρα – sfera = kugla, lopta) su natporodica globulsstih proteina sa hemom uključenih u vezivanje i/ili transport kisika. Svi ovi proteini uključuju globinski nabor, seriju od po osam α heliksnih segmenata. Dva istaknuta člana uključuju mioglobin i hemoglobin. Oba ova proteina reverzibilno vezuju kisik preko hemske prostetske grupe. Široko su rasprostranjeni u mnogim organizmima.[2]
Članovi natporodice globina imaju zajednički trodimenzijski nabor.[3] Ovaj 'globinski nabor' sastoji se obično od osam α heliksa, iako neki proteini imaju dodatne spiralne ekstenzije na svojim krajevima.[4] Budući da globinski nabor sadrži samo heliksa, klasifikovan je kao sve-α proteinski nabor.
Globinski nabor nalazi se u njegovom istoimenoj globinu porodice kao i u fikocijaninima. Globinski nabor je tako bio prvi otkriveni proteinski nabor (mioglobin je bio prvi protein čija je struktura riješena).
Osam spirala jezgra globinskog nabora dijele značajnu nelokalnu strukturu, za razliku od drugih strukturnih motiva u kojima su aminokiseline bliske jedna drugoj u primarnoj sekvenci također blizu u prostoru. Heliksi se zbijaju zajedno pod prosječnim uglom od oko 50 stepeni, znatno strmiji od ostalih spiralnih pakovanja kao što je heliksni paket. Tačan ugao pakovanja heliksa zavisi od sekvence proteina, jer je pakovanje posredovano sternim i hidrofobnim interakcijama aminokiselinskih bočnih lanca u blizini interfejsa spirale.
Globini su evoluirali od zajedničkog predačkog proteina i mogu se podijeliti u tri grupe: globini s jednim domenom i dva tipa himernih globina, flavohemoglobina i globin-spojenim senzorima. Bakterije imaju sva tri tipa globina, dok Archaea nemaju flavohemoglobine, a eukarioti nemaju senzore koji su povezani sa globinom.[5][6] Nekoliko funkcionalno različitih hemoglobina može koegzistirati u istoj vrsti.
Poznato je da se osam globina javlja kod kičmenjaka: androglobin, citoglobin, globin E, globin X, globin Y, hemoglobin, mioglobin i neuroglobin.
Iako je nabor globinske natporodice evolucijski visoko prirodno konzerviran, sekvence koje formiraju nabor mogu imati čak 16% identiteta sekvence. Iako specifičnost sekvence nabora nije stroga, hidrofobno jezgro proteina mora se održavati i moraju se izbjegavati hidrofobna obojenja na općenito hidrofilnoj površini izloženoj rastvaraču, kako bi struktura ostala stabilna i rastvorljiva. Najpoznatija mutacija u globinskom naboru je promjena iz glutamata u valin u jednom lancu molekula hemoglobina. Ova mutacija stvara "hidrofobnu pjegu" na površini proteina koja podstiče međumolekulsku agregaciju, događaj koji uzrokuje anemiju srpastih ćelija.
Ljudski geni koji kodiraju globinske proteine uključuju:
Globini uključuju:
HbO (ili GlbO): skraćeni protein sličan hemoglobinu sa nižim afinitetom za kisik od HbN. HbO se povezuje sa membranom bakterijskih ćelija, gde značajno povećava unos kisika u membrane kojima nedostaje ovaj protein. Čini se da HbO reaguje sa terminalnom oksidazom i može sudjelovati u procesu prijenosa kisika/elektrona koji olakšavaju prijenos kisika tokom aerobnog metabolizma.[17]
Globinski nabor (cd01067) također uključuje neke nehemske proteine. Neki od njih su fikobiliproteini, N-terminalni domen dvokomponentnog regulatornog sistema histidin-kinaza, RsbR i RsbN.
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.