From Wikipedia, the free encyclopedia
Gen SCNN1D sa hromosoma1, kodira za δ (delta) podjedinicu epitelnog natrijevog kanala ENaC kod kičmenjaka. ENaC je sastavljen kao heterotrimer od tri homologne podjedinice α, β i γ ili δ, β i γ.[3] Ostale ENAC podjedinice kodirane su pomoću SCNN1A, SCNN1B i SCNN1G.
SCNN1D | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | SCNN1D | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 601328 HomoloGene: 48152 GeneCards: SCNN1D | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
Ensembl |
| ||||||||||||||||||||||||
UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 1: 1.28 – 1.29 Mb | n/a | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [2] | n/a | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
ENaC se eksprimira u epitelnim ćelijama i razlikuje se od napon-ovisnog natrijevog kanala koji je uključen u stvaranje akcijskih potencijala u neuronima. Skraćenica za gene koji kodiraju za naponski-ovisni natrijski kanal počinje sa tri slova: SCN. Za razliku od ovih natrijevih kanala, ENaC je konstitutivno aktivan i ne zavisi od napona. Drugo N u skraćenici (SCNN1D) predstavlja da su to kanali koji nisu naponski ograničeni.
Kod većine kičmenjaka, ioni natrija su glavna determinanta osmolarnosti vanćelijske tečnosti.[4] ENaC omogućava transfer iona natrija preko epitelne ćelijske membrane u takozvanim "zategnutim epitelima" koji imaju nisku permeabilnost. Protok iona natrija kroz epitel utiče na osmolarnost vanćelijske tečnosti. Dakle, ENaC ima centralnu ulogu u regulaciji homeostaze tjelesnih tekućina i elektrolita i posljedično utiče na krvni pritisak.[5]
Pošto amilorid snažno inhibira ENaC, on se takođe naziva "natrijevim kanalom osetljivim na amilorid".
Prvu cDNK koja kodira delta podjedinicu ENaC klonirali su i sekvencirali Waldmann et al. iz iRNK ljudskog bubrega.[6]
Dužina polipeptidnog lanca je 638 aminokiselina, a molekulska težina 70.215 Da.[5]
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAEHRSMDGR | MEAATRGGSH | LQAAAQTPPR | PGPPSAPPPP | PKEGHQEGLV | ||||
ELPASFRELL | TFFCTNATIH | GAIRLVCSRG | NRLKTTSWGL | LSLGALVALC | ||||
WQLGLLFERH | WHRPVLMAVS | VHSERKLLPL | VTLCDGNPRR | PSPVLRHLEL | ||||
LDEFARENID | SLYNVNLSKG | RAALSATVPR | HEPPFHLDRE | IRLQRLSHSG | ||||
SRVRVGFRLC | NSTGGDCFYR | GYTSGVAAVQ | DWYHFHYVDI | LALLPAAWED | ||||
SHGSQDGHFV | LSCSYDGLDC | QARQFRTFHH | PTYGSCYTVD | GVWTAQRPGI | ||||
THGVGLVLRV | EQQPHLPLLS | TLAGIRVMVH | GRNHTPFLGH | HSFSVRPGTE | ||||
ATISIREDEV | HRLGSPYGHC | TAGGEGVEVE | LLHNTSYTRQ | ACLVSCFQQL | ||||
MVETCSCGYY | LHPLPAGAEY | CSSARHPAWG | HCFYRLYQDL | ETHRLPCTSR | ||||
CPRPCRESAF | KLSTGTSRWP | SAKSAGWTLA | TLGEQGLPHQ | SHRQRSSLAK | ||||
INIVYQELNY | RSVEEAPVYS | VPQLLSAMGS | LCSLWFGASV | LSLLELLELL | ||||
LDASALTLVL | GGRRLRRAWF | SWPRASPASG | ASSIKPEASQ | MPPPAGGTSD | ||||
DPEPSGPHLP | RVMLPGVLAG | VSAEESWAGP | QPLETLDT |
Sekvenca gena SCNN1D je prvi put otkrivena Pprojektom ljudskog genoma. SCNN1D se nalazi u kratkom kraku hromozoma 1 (Ensembl baza podataka: ENSG00000162572) i počinje na nukleotidu 1,280.436 na prednjem lancu. Njegova dužina je oko 11.583 bp. Gen kodira nekoliko alternativnih transkripata sa različitim mjestima inicijacije transkripcije i translacije (vidi sliku 1 ispod). U uzorcima iRNK iz ljudskog mozga otkriveni su, klonirani i okarakterizirani alternativni proizvodi prerade.[7][8] Gen ffebhe SCNN1D nalazi se u većini kičmenjaka,[3] ali je izgubljen u genomima miša i pacova.[9] [10]
Ekspresija δ-podjedinice specifična za tkivo je veoma različita od one druge tri podjedinice koje kodiraju SCNN1A, SCNN1B i SCNN1G. Dok su α, β i γ podjedinice eksprimirane uglavnom u tubulskom epitelu bubrega, disajnim putevima,[11] ženskom reproduktiuvnom traktu,[11] debelom crijevu, pljuvačne i znojne žlijezde,[12] δ-podjedinica je eksprimirana uglavnom u mozgu, pankreasu, sjemenicima i jajnicima.[10]
Primarne strukture sve četiri ENaC podjedinice pokazuju snažnu sličnost. Dakle, ova četiri proteina predstavljaju porodicu proteina koji imaju zajedničkog pretka. U globalnom poravnanju (što znači poravnanje sekvenci duž cijele njihove dužine, a ne samo djelomičnih segmenata), ljudska δ podjedinica dijeli 34% identiteta sa α podjedinicom i 23% identiteta sa β i γ podjedinicama.
Sve četiri sekvence ENaC podjedinica imaju dva hidrofobna dijela koja formiraju dva transmembranska segmenta zvana TM1 i TM2.[13] U obliku vezanom za membranu, TM segmenti su ugrađeni u membranski dvosloj, amino- i karboksi-terminalni regioni nalaze se unutar ćelije, a segment između dva TM ostaje izvan ćelije kao vanćelijski region ENaC. Ova vanćelijska regija uključuje oko 70% ostataka svake podjedinice. Dakle, u obliku vezanom za membranu, većina svake podjedinice nalazi se izvan ćelije.
Struktura ENaC-a još nije utvrđena. Ipak, struktura homolognog proteina ASIC1 je riješena.[14][15] Struktura kokošiojeg ASIC1 otkrila je da je ASIC1 sastavljen kao homotrimer od tri identične podjedinice. Autori originalne studije sugerirali su da ASIC1 trimer nalikuje šaki koja drži loptu.[14] Otuda se različiti domeni ASIC1 nazivaju dlan, zglob, prst, palac i β-lopta.[14]
Poravnavanje sekvenci ENaC podjedinica sa ASIC1 sekvencom otkriva da su TM1 i TM2 segmenti i domen dlana konzervirani, a domeni zgloba, prsta i palca imaju insercije u ENaC. Studije mutageneze usmjerene na mjesto na ENaC podjedinicama pružaju dokaz da se mnoge osnovne karakteristike ASIC1 strukturnog modela primjenjuju i na ENaC.[3] Ipak, ENaC je obavezan heterotrimer sastavljen od tri podjedinice kao i αβγ ili βγδ trimer.[16]
Do sada mutacije u delta podjedinici nisu bile povezane sa određenom bolešću.
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.