From Wikipedia, the free encyclopedia
QRICH1, znan i kao glutaminom bogati protein 1, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom QRICH1 sa hromosoma 3.[5] Jedna od značajnijih karakteristika ovog proteina je da sadrži domen aktiviranja regrutacuje kaspaza, također poznat kao CARD-domen.[6] Kao posjedovanja ovog domena, vjeruje se da je QRICH1 uključen u apoptotske, upalne i imunske puteve odgovora domaćina.[7]
Dužina polipeptidnog lanca je 776 aminokiselina, а molekulska težina 86.436 Da.[8]
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNNSLENTIS | FEEYIRVKAR | SVPQHRMKEF | LDSLASKGPE | ALQEFQQTAT | ||||
TTMVYQQGGN | CIYTDSTEVA | GSLLELACPV | TTSVQPQTQQ | EQQIQVQQPQ | ||||
QVQVQVQVQQ | SPQQVSAQLS | PQLTVHQPTE | QPIQVQVQIQ | GQAPQSAAPS | ||||
IQTPSLQSPS | PSQLQAAQIQ | VQHVQAAQQI | QAAEIPEEHI | PHQQIQAQLV | ||||
AGQSLAGGQQ | IQIQTVGALS | PPPSQQGSPR | EGERRVGTAS | VLQPVKKRKV | ||||
DMPITVSYAI | SGQPVATVLA | IPQGQQQSYV | SLRPDLLTVD | SAHLYSATGT | ||||
ITSPTGETWT | IPVYSAQPRG | DPQQQSITHI | AIPQEAYNAV | HVSGSPTALA | ||||
AVKLEDDKEK | MVGTTSVVKN | SHEEVVQTLA | NSLFPAQFMN | GNIHIPVAVQ | ||||
AVAGTYQNTA | QTVHIWDPQQ | QPQQQTPQEQ | TPPPQQQQQQ | LQVTCSAQTV | ||||
QVAEVEPQSQ | PQPSPELLLP | NSLKPEEGLE | VWKNWAQTKN | AELEKDAQNR | ||||
LAPIGRRQLL | RFQEDLISSA | VAELNYGLCL | MTREARNGEG | EPYDPDVLYY | ||||
IFLCIQKYLF | ENGRVDDIFS | DLYYVRFTEW | LHEVLKDVQP | RVTPLGYVLP | ||||
SHVTEEMLWE | CKQLGAHSPS | TLLTTLMFFN | TKYFLLKTVD | QHMKLAFSKV | ||||
LRQTKKNPSN | PKDKSTSIRY | LKALGIHQTG | QKVTDDMYAE | QTENPENPLR | ||||
CPIKLYDFYL | FKCPQSVKGR | NDTFYLTPEP | VVAPNSPIWY | SVQPISREQM | ||||
GQMLTRILVI | REIQEAIAVA | NASTMH |
Gen QRICH1 dug je 64.363 parova baza i kodira transkript iRNK dužine 3331 bp.[9] QRICH1 nalazi se na hromosomskoj poziciji 3p21.31 i sadrži 11 egzona.[10] Genomska sekvenca počinje na baznom paru 49,057.531 i završava se na baznom paru 49,141.201.[9]
Protein bogat glutaminom 1 dug je 776 aminokiselina. Glutaminski ostaci su u izobilju, a sastoje se od 109 aminokiselina ili 14% ukupnog proteina.[12] Protein sadrži tri različita domena. Prvi, CARD domen, je član natporodice DEATH-nabora i uključen je u signalne puteve apoptoze, imunsku signalizaciju, upale i mehanizme odbrane domaćina.[6] Drugi domen bogat glutaminom sadrži većinu proteina i visoko je konzerviran među ortolozima.[6] Treći domen je domen nepoznate funkcije (DUF3504) pronađen blizu kraja sekvencu proteina.[6] Sva tri ova domena su dobro konzervirana preko tipskih ortologa.
Naučna zajednica nije dobro razumjela tačnu funkciju QRICH1. Međutim, smatra se da je uključen u procese kao što su upala i apoptoza zbog prisustva CARD-domena, blizu početka sekvence proteina.[7] Predviđeno je da se ovaj protein nalazi na jedru i poznato je da stupa u interakciju s proteinima ATXN1 i ATF7IP prikazanim na slici gore.[13]
Svojstva QRICH1 koja su predviđena pomoću Bioinformatics alata:
QRICH1 je eksprimiran na visokom nivou, 3,3 puta većem od prosječnog gena.[23] Eksprimira se sveprisutno u cijelom ljudskom tijelu, iako podaci EST profila otkrivaju da je QRICH1 posebno izražen u tkivima kao što su timus, sjemenici, moždana kora i druga područja mozga, traheja i u embrionskom tkivu. Zdravstvena stanja kao što su tumori zametnih ćelija, leukemija, limfom i hondrosarkom također imaju visoku ekspresiju QRICH1.
QRICH1 je visoko konzerviran među ortolozima sisavra, zajedno sa drugim hordatima kao što su ribe, ptice i vodozemci. Gen ima određenu konzervaciju među insektima, ali nije bilo ortologa u biljkama, gljivama ili kvascima.[24]
Rod i vrsta | Uobičajeno ime | Pristupni broj | Identitet sekvence | Sličnost sekvence | Dužina (AA) | |
Pan troglodytes | Čimpanza | XP_001161499.1 | 99% | 99% | 766 | |
Macaca mulatta | Rezus-makak | XP_001110386.2 | 99% | 99% | 659 | |
Pongo abelii | Orangutan | XP_002813809.1 | 99% | 99% | 777 | |
Mus musculus | Kućni miš | NP_780352.2 | 99% | 99% | 777 | |
Rattus norvegicus | Smeđi pacov | NP_001128004.1 | 99% | 99% | 687 | |
Canis familiaris | Pas | XP_850904.1 | 99% | 99% | 780 | |
Bos taurus | Govedo | NP_001091484.1 | 99% | 99% | 779 | |
Sus scrofa | Divlja svinja | XP_003132250.1 | 99% | 99% | 781 | |
Oryctolagus cuniculus | Evropsaki kunić | XP_002713458.1 | 99% | 99% | 777 | |
Ailuropoda melanoleuca | Gigantski panda | XP_002920598.1 | 99% | 99% | 780 | |
Callithrix jacchus | Marmozet | XP_002758378.1 | 99% | 99% | 777 | |
Equus caballus | Konj | XP_001498380.2 | 98% | 98% | 780 | |
Monodelphis domestica | Oposum | XP_001367745.1 | 95% | 97% | 776 | |
Gallus gallus | Kokoš | XP_001233527.1 | 94% | 96% | 773 | |
Ornithorhynchus anatinus | Kljunar | XP_001505372.1 | 94% | 95% | 741 | |
Taeniopygia guttata | Zebrasta zeba | XP_002187824.1 | 93% | 97% | 772 | |
Xenopus laevis | Afrička kandžasta žaba | NP_001083416.1 | 79% | 85% | 755 | |
Tetraodon nigroviridis | Pufer-riba | CAG11318.1 | 71% | 80% | 729 | |
Danio rerio | Zebrica | NP_001020633.1 | 63% | 73% | 717 | |
Apis mellifera | Pčela | XP_624959.2 | 47% | 64% | 1356 | |
Camponotus floridanus | Mrav sjekač | EFN71787.1 | 45% | 63% | 1724 | |
QRICH1 ima pet paraloga od kojih svi kodiraju protein cinkovog prsta.[25]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.