NRIP2

Jedarni receptor-interaktivni protein 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NRIP2.

NRIP2
Identifikatori
Aliasi	NRIP2
Vanjski ID-jevi	MGI: 1891884 HomoloGene: 11023 GeneCards: NRIP2
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 12 (čovjek)[1] Bend 12p13.33 Početak 2,825,348 bp[1] Kraj 2,835,544 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 6 (miš)[2] Bend 6|6 F3 Početak 128,376,259 bp[2] Kraj 128,393,390 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • aspartic-type endopeptidase activity Ćelijska komponenta • citoplazma • jedro Biološki proces • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Proteoliza Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	83714	60345
Ensembl	ENSG00000053702	ENSMUSG00000001520
UniProt	Q9BQI9	Q9JHR9
RefSeq (mRNK)	NM_031474	NM_001162858 NM_021717
RefSeq (bjelančevina)	NP_113662	NP_001156330 NP_068363
Lokacija (UCSC)	Chr 12: 2.83 – 2.84 Mb	Chr 6: 128.38 – 128.39 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

U nedavnoj studiji, navodi se da se otkrivanjem kompletne ljudske genomske sekvence fokus prebacuje na identifikaciju gena i na funkcionalnu analizu genskih proizvoda. Generiranje niza cDNK, i sekvenci i fizičkih klonova, koji sadrži potpune i neprekinute regije za kodiranje proteina svih ljudskih gena, pružit će neophodne alate za sistemsku i sveobuhvatnu analizu proteinske funkcije, kako bi se na kraju razumjela molekulska osnova čovjeka. Sekvenciranjem i analizom 500 novih ljudskih cDNK koje sadrže potpuni okvir za kodiranje proteina, dodjeljena je funkcionalna kategorizacija bilo je moguće sekvence za 52% (259) kodiranih proteina, a preostala frakcija nema sličnosti s poznatim proteinima. Poravnavanjem sekvenci cDNK sa sekvencama identificirani su brojni geni koji su ili potpuno promašeni u analizi genomskih sekvenci ili su pogrešno predviđeni. Čini se da su tri od ovih gena prisutna u nekoliko kopija. Može se zaključiti da je sekvenciranje cDNK pune dužine i dalje ključno za tačnu identifikaciju gena. Skup od 500 novih cDNK i još 1.000 potpuno kodiranih cDNK poznatih transkripata koji su identificirani, dodaje se reprezentacija cDNK koja pokrivaju 2% -5% svih ljudskih gena. Time se značajno doprinosi generiranju kataloga gena, koji se sastoji od potpuno kodiranih sekvenci cDNK i klonova, koji bi trebali biti dostupni i postat će neprocjenjiv alat za detaljna funkcionalna proučavanja.^[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 281 aminokiselina, a molekulska težina 31.331 Da.^[7]

10		20		30		40		50
MLFIFPLSLP		WRPSCWKESC		STGQRQAGRS		REDSVTPPPS		SPWPTPPAGA
MSTKQEARRD		EGEARTRGQE		AQLRDRAHLS		QQRRLKQATQ		FLHKDSADLL
PLDSLKRLGT		SKDLQPRSVI		QRRLVEGNPN		WLQGEPPRMQ		DLIHGQESRR
KTSRTEIPAL		LVNCKCQDQL		LRVAVDTGTQ		YNRISAGCLS		RLGLEKRVLK
ASAGDLAPGP		PTQVEQLELQ		LGQETVVCSA		QVVDAESPEF		CLGLQTLLSL
KCCIDLEHGV		LRLKAPFSEL		PFLPLYQEPG		Q

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Reference

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000053702 - Ensembl, maj 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001520 - Ensembl, maj 2017
3. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a Catalog of Human Genes and Proteins: Sequencing and Analysis of 500 Novel Complete Protein Coding Human cDNAs". Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
6. "Entrez Gene: NRIP2 nuclear receptor interacting protein 2".
7. "UniProt, Q9BQI9". Pristupljeno 12. 8. 2021.

Dopunska literatura

• Greiner EF, Kirfel J, Greschik H, et al. (2000). "Differential ligand-dependent protein–protein interactions between nuclear receptors and a neuronal-specific cofactor". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (13): 7160–5. doi:10.1073/pnas.97.13.7160. PMC 16516. PMID 10860982.
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination". Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). "Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing". EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline". Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D415–8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.