From Wikipedia, the free encyclopedia
Protein LMBR1L je protein koji je kod ljudi kodiran genom LMBR1L.[5][6][7]
Konzorcij za prikupljanje gena sisara (MGC) (http://mgc.nci.nih.gov Arhivirano 25. 2. 2015. na Wayback Machine) nastoji uspostaviti javno dostupne zbirke potpunih ORF cDNK za nekoliko organizama od značaja za biomedicinska istraživanja, uključujući ljude, uključujući i protein LMBR1L. Do danas je identificirano više od 15.200 klonova ljudskih cDNK koji sadrže otvorene okvire čitanja (ORF) cijele dužine putem sistematske analize označenih oznaka sekvence (EST) različitog skupa biblioteka cDNK. Međutim, daljnja sistematska EST analiza više nije efikasan metod za identifikaciju novih cDNK. Kao dio uključivanja u program MGC, razvijen je skalabilni metod za ciljani oporavak klonova cDNK, kako bi se olakšao oporavak gena koji nedostaju iz zbirke MGC. cDNK se sintetizira se iz različitih RNK, nakon čega slijedi amplifikacija transkripata polimeraznom lančanom reakcijom (PCR) u pločama sa 96 komorica, koristeći parove prajmera specifične za gen sa strane ORF-a. Amplikoni se kloniraju u vektor sekvenciranja i dobijaju se sekvence cijele dužine. Sekvence se obrađuju i sastavljaju pomoću Phred-a i Phrap-a, te analiziraju koristeći Consed i brojne, već razrađene bioinformatičke metode. Sekvence se upoređuju sa bazom podataka referentne sekvence (RefSeq), a validacija odstupanja u sekvenci pokušava se upotrebom drugih baza podataka sekvenci, uključujući dbEST i dbSNP. Klonovi sa identičnom sekvencom kao RefSeq ili koji sadrže samo potvrđene promjene postat će dio kolekcije MGCljudskih gena. Također su identificirani klonovi koji sadrže nove varijante prerade ili polimorfizme.
Dužina polipeptidnog lanca je 489 aminokiselina, a molekulska težina 55.209 Da.[8].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEAPDYEVLS | VREQLFHERI | RECIISTLLF | ATLYILCHIF | LTRFKKPAEF | ||||
TTVDDEDATV | NKIALELCTF | TLAIALGAVL | LLPFSIISNE | VLLSLPRNYY | ||||
IQWLNGSLIH | GLWNLVFLFS | NLSLIFLMPF | AYFFTESEGF | AGSRKGVLGR | ||||
VYETVVMLML | LTLLVLGMVW | VASAIVDKNK | ANRESLYDFW | EYYLPYLYSC | ||||
ISFLGVLLLL | VCTPLGLARM | FSVTGKLLVK | PRLLEDLEEQ | LYCSAFEEAA | ||||
LTRRICNPTS | CWLPLDMELL | HRQVLALQTQ | RVLLEKRRKA | SAWQRNLGYP | ||||
LAMLCLLVLT | GLSVLIVAIH | ILELLIDEAA | MPRGMQGTSL | GQVSFSKLGS | ||||
FGAVIQVVLI | FYLMVSSVVG | FYSSPLFRSL | RPRWHDTAMT | QIIGNCVCLL | ||||
VLSSALPVFS | RTLGLTRFDL | LGDFGRFNWL | GNFYIVFLYN | AAFAGLTTLC | ||||
LVKTFTAAVR | AELIRAFGLD | RLPLPVSGFP | QASRKTQHQ |
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.