From Wikipedia, the free encyclopedia
COMM protein 4 sa domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom COMMD4.[5][6]
COMMD4 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | COMMD4 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 616701 MGI: 1913449 HomoloGene: 9865 GeneCards: COMMD4 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 15: 75.34 – 75.34 Mb | Chr 9: 57.06 – 57.07 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Hartz (2015) mapirala je gen COMMD4 u hromosomskoj poziciji 15q24.2, na osnovu poravnanja sekvence COMMD4 (GenBank AK000459) sa genomskom sekvencom (GRCh38).[7]
Dužina polipeptidnog lanca je 199 aminokiselina, a molekulska težina 21.764 Da.[8].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRFRFCGDLD | CPDWVLAEIS | TLAKMSSVKL | RLLCSQVLKE | LLGQGIDYEK | ||||
ILKLTADAKF | ESGDVKATVA | VLSFILSSAA | KHSVDGESLS | SELQQLGLPK | ||||
EHAASLCRCY | EEKQSPLQKH | LRVCSLRMNR | LAGVGWRVDY | TLSSSLLQSV | ||||
EEPMVHLRLE | VAAAPGTPAQ | PVAMSLSADK | FQVLLAELKQ | AQTLMSSLG |
Masenom spektrometrijskom analizom proteina koji su povezani sa MURR1 (COMMD1) u liziranim ćelijaama HEK293, nakon čega slijede analiza baze podataka i PCR amplifikacija, Burstein et al. (2005) klonirali su COMMD4. Izvedeni protein ima domen metabolizma bakra MURR1 (COMM) koji je bogat leucinom i za koji je predviđeno da stvara beta-listove. Analiza baze podataka otkrila je ekspresiju COMMD4 u svih 13 ispitanih ljudskih tkiva, s najvećom ekspresijom u sjemenicim, plućima i timusu, a najmanjom u jajnicima, koži i pankreasu.
Analizom koimunoprecipitacije, Burstein et al. (2005) otkrili su da je COMMD4 komunicirao s endogenim COMMD1 iz ćelija HEK293. COMMD4 je snažno inhibirao TNF, posredovanu aktivaciju NF-kappa-B. Analize proteina pokazale su da je COMMD4 povezan sa NF-kappa-B podjedinicama RELA, RELB i p105 (NFKB1), ali ne i sa p100 (NFKB2) ili CREL (REL ). Nokdaun endogenog COMMD4 putem interferencijske RNK povisio je TNF-zavisnu aktivaciju gena CIAP2 (BIRC3), koji reaguje na NF-kappa-B. Mao et al. (2011) otkrili su da je COMMD4 stupio u interakciju s nizom specifičnih kulina označenih epitopom, komponentama multimernih kompleksa ubikvitin-ligaze poznatih kao kulin RING-ligaze (CRL). COMMD4 koji je taložen iz ljudskih ćelijskih linija podržavao je poliubikvitinaciju in vitro, vjerovatno zbog svoje interakcije s CRL.[9][10]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.