From Wikipedia, the free encyclopedia
Otvoreni okvir čitanja 152 hromosoma 9 je protein koji je kod ljudi kodiran genom C9orf152.[5][6] Tačna funkcija proteina nije u potpunosti shvaćena.
C9orf152 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | C9orf152 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | MGI: 2442889 HomoloGene: 52276 GeneCards: C9orf152 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 9: 110.19 – 110.21 Mb | Chr 4: 57.91 – 57.92 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Dužina polipeptidnog lanca je 239 aminokiselina, а molekulska težina 26.314 Da.[7]
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEGLPCPCPA | LPHFWQLRSH | LMAEGSRTQA | PGKGPPLSIQ | FLRAQYEGLK | ||||
RQQRTQAHLL | VLPKGGNTPA | PAESMVNAVW | INKERRSSLS | LEEADSEVEG | ||||
RLEEAAQGCL | QAPKSPWHTH | LEMHCLVQTS | PQDTSHQVHH | RGKLVGSDQR | ||||
LPPEGDTHLF | ETNQMTQQGT | GIPEAAQLPC | QVGNTQTKAV | ESGLKFSTQC | ||||
PLSIKNPHRS | GKPAYYPFPQ | RKTPRISQAA | RNLGLYGSA |
Ljudski gen C9orf152 nalazi se na dugom (q) kraku hromosoma 9.[8] Njegova citogenetička lokacija je u regiji 9q31.1. Ima jednog poznatog alijasa: bA470J20.2.[9] Sekvenca DNK koja kodira C9orf152 sadrži jedan intron.[8] Konačna iRNK sastoji se od 2.698 baznih parova. Nukleotidi 66-68 kodiraju uzvodno u okviru stop kodona.[5]
Otvoreni okvir čitanja 152 hromosoma 9 sadrži 239 aminokiselina. molekulska težina je 26,3 kilodaltona. Protein je najvjerovatnije lociran u jedarnom području ćelija.[10] Vjerovatno ne postoje transmembranske regije.[11] Postoji jedna proteinska izoforma, sa 194 aminokiseline.[12][13]
Unutar kodirajuće sekvence postoje dva mjesta sumoilacije[14][15][16] i jedno mjesto fosforilacije serina.[17]
Predviđeno je da tri regiona formiraju alfa-helikse na konačnom proteinu.[18][19]
C9orf152 se eksprimira u bešici, crijevima, mliječnim žlijezdama i dušniku i u manjoj mjeri u plućima, jetri, prostati, maternici i mozgu.[20] Unutar mozga, ekspresija C9orf152 ograničena je na mirisni režanj.[21] Gene expression was found to increase in the presence of stress, including disease and heat stress.[22]
Veliki broj transkripcijskih faktora stupa u interakciju sa promotorom C9orf152, od kojih su najčešći dva olfaktorno povezana faktora (konkretno, neuronski specifični olfaktorni faktor i olfaktorno povezan protein cinkovog prsta) i element negativnog glukokortikoidnog odgovora.[23]
C9orf152 ima ortologe u sisarima, pticama, gmizavcima i vodozemcima. U košljorribama ili u bilo kojem beskičmenjaku nisu otkriveni ortolozi.[8][12] Sljedeća tabela navodi podskup konzerviranih ortologa.
Naučno ime | Uobičajeno ime | Pristipni broj | Dužina sekvence (aa) | Postotak identiteta | Postotak sličnosti |
---|---|---|---|---|---|
Homo sapiens | Čovjek | NP_001013011.2 | 239 | – | – |
Pan troglodytes | Čimpanze | XP_001145187 | 239 | 98 | 98 |
Tarsius syrichta | Filipinski avetnjak | XP_008064367 | 237 | 78 | 85 |
Ceratotherium simum simum | Nosorog | XP_004423784 | 239 | 78 | 82 |
Sus scrofa | Divlja svinja | XP_003122117 | 239 | 74 | 83 |
Equus caballus | Konj | XP_001491697 | 239 | 74 | 80 |
Tursiops truncatus | Boconosni delfin | XP_004329084 | 234 | 73 | 81 |
Heterocephalus glaber | Goli krtičasti pacov | XP_004903816 | 239 | 74 | 84 |
Orcinus orca | Kit ubica (orka) | XP_004269444 | 231 | 72 | 79 |
Mus musculus | Miš | NP_848842 | 236 | 62 | 72 |
Rattus norvegicus | Pacov | XP_003754080 | 234 | 62 | 70 |
Chelonia mydas | Zelena morska kornjača | XP_007059491 | 267 | 33 | 49 |
Nestor notabilis | Papagaj | XP_010009525 | 265 | 34 | 49 |
Python bivittatus | Mjanmarski pton | XP_007428415 | 234 | 30 | 44 |
Meleagris gallopavo | Divlja ćurka | XP_010710660 | 267 | 29 | 43 |
Pelodiscus sinensis | Kineska mehkooklopna kornjača | XP_006120615 | 268 | 29 | 43 |
Haliaeetus albicilla | Bjelorepi orao | XP_009911401 | 266 | 33 | 48 |
Xenopus tropicalis | Zapadna kandžasta žaba | XP_004915565 | 226 | 31 | 45 |
Razlike među prikazanim ortolozima ukazuju na sporu stopu evolucije.[24]
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.