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生物系统（biological system）是指许多相关的生物单元组成的复杂网络。生物系统的尺度有大有小，会依系统的特性，有不同的结构[1]。像由许多生物形成的族群，就是巨观生物系统的例子。若考虑动物器官及组织的尺度，此一尺度的生物系统有循环系统、呼吸系统及神经系统。在微米及奈米尺寸的生物系统有细胞、细胞器、大分子复合物及调节T细胞通道。
以下是人体解剖学中研究的系统，许多动物也有类似的系统。
- 呼吸系统：用来呼吸的器官，包括咽、喉、支气管、肺和横隔膜。
- 消化系统：消化及处理食物，包括唾腺、食道、胃、肝、胆囊、胰脏、肠、直肠和肛门。
- 心血管系统（心脏和循环系统）：透过心脏及血管，将血液输送到肺部以及身体各部位。
- 泌尿系统：肾脏、输尿管、膀胱及尿道，和人体内的体液平衡、电解质平衡以及排尿有关。
- 皮肤系统：皮肤、头发、脂肪及指甲。
- 骨骼系统：支持身体的结构，并且保护身体内部，包括骨、软骨、韧带及肌腱。
- 内分泌系统：利用内分泌腺产生的激素和身体互动，内分泌包括有下丘脑、脑下垂体、松果体、甲状腺、副甲状腺及胸腺等。
- 淋巴系统：在组织和循环系统之间传送淋巴的组织，包括有淋巴结和淋巴管。淋巴系统的功能也包括免疫反应以及产生抗体。
- 免疫系统：保护生物不被外来物质入侵.
- 神经系统：搜集资讯、传送资讯并且处理资讯，包括有脑、脊髓、周围神经系统、和感官。
- 肌肉系统：可以配合环境，移动，维持姿势，并且产热，可以分为骨骼肌、平滑肌和心肌。
- 生殖系统：性器官，像是卵巢、输卵管、子宫、阴道、乳腺、睾丸、输精管、储精囊、前列腺。
生物系统的表示方式和生物体的功能有关[2]，系统是一组有明确功能的器官。在希腊罗马古典时代（例如盖伦、亚里士多德）即有此概念，但“系统”一词是近代才开始使用。例如神经系统的命名是Monro在1783年命名，但以弗所的鲁弗斯（c. 90-120）是第一个将大脑、脊髓及颅脊神经视为一个解剖学单元，不过鲁弗斯对其功能描述的不多，也没有为此单元命名[3]。
有关身体主要功能（因此也代表所对应的系统）的列举，从古典时代之后就没什么变化，不过各学者会有不同的分类[2]，像亚里士多德、比夏和乔治·居维叶的分类就有不同[4][5]。
用功能分工来标示生物系统的作法源自于1820年代法国生理学家亨利·米尔·爱德华，此概念“将生物视为人工制造的机器，以此观点比较并且进行分析。”。米尔·爱德华的灵感是来亚当·斯密，米尔·爱德华认为“不论是动物或是植物，所有生物的身体都类似一个工厂，而器官就像是工人，不停工作以产生生物生存所需要的各种机制。”对于一些分化程度更高的生物体，分工可能会在不同的器官或是系统中进行[6]。
- 细胞核（只有真核生物才有)：储存遗传物质，细胞的控制中心。
- 胞质溶胶：是细胞质的组成，本身是类似果冻的液体，细胞器悬浮在其中。
- 细胞膜
- 内质网：核膜的外层，其中形成了可以运输物质的通道，可分为粗糙内质网（Rough Endoplasmic Reticulum, RER）和光滑内质网（Smooth Endoplasmic Reticulum, SER）两种。
- 核糖体：细胞内部活动需要的蛋白质会在此合成，无法在其他细胞器中复制。
- 线粒体：细胞中产生能量的细胞器，是细胞内进行呼吸，产生ATP（三磷酸腺苷）的部位。
- 溶酶体：会分解细胞中不想要或是不需要的物质。
- 过氧化物酶体：利用其中的消化酶来分解有毒物质，例如H2O2（过氧化氢）。
- 高尔基体（只有真核生物才有），折叠的网状结构，可以进行物质的处理、运输以及分泌。
- 叶绿体：光合作用所在的位置，储存叶绿素。
- Systems Biology: An Overview （页面存档备份，存于互联网档案馆） by Mario Jardon: A review from the Science Creative Quarterly, 2005.
- Synthesis and Analysis of a Biological System, by Hiroyuki Kurata, 1999.
- It from bit and fit from bit. On the origin and impact of information in the average evolution. Includes how life forms and biological systems originate and from there evolve to become more and more complex, including evolution of genes and memes, into the complex memetics from organisations and multinational corporations and a "global brain", (Yves Decadt, 2000). Book published in Dutch with English paper summary in The Information Philosopher, http://www.informationphilosopher.com/solutions/scientists/decadt/ （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- Schmidt-Rhaesa, A. 2007. The Evolution of Organ Systems. Oxford University Press, Oxford, [2].
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