下面是自由及開放原始碼軟件包——即採用自由軟件授權和開源許可證的電腦軟件的列表。符合自由軟件定義的軟件可能稱為自由軟件更為適宜；GNU計劃尤其反對他們的軟件被稱為「開源」。[1]欲知更多有關開源軟件資訊及其理論背景，請參考開源軟件運動和自由軟件運動。不過，幾乎所有的符合開源軟件定義的軟件都是自由軟件，故而也在此列出。
 | 此條目應避免有陳列雜項、瑣碎資料的部分。 (2012年9月8日) |
應用領域
- Blender，用C、C++和Python語言寫成的3D模擬程式，包含服飾、髮型、形體模擬技術
- SimPy，基於佇列理論事件的模擬器，用Python編寫
- FlightGear，適用於Windows、OS X和GNU/Linux的開源航班模擬器
- Godot，可執行於Windows、macOS和Linux等的遊戲引擎
- Open 3D Engine，基於Amazon Lumberyard的遊戲引擎
- Adempiere——ERP（企業資源計劃）商務套件
- Bitcoin——P2P分散型數字貨幣
- 博爾尼塔開源解決方案——業務流程管理
- Compiere——ERP自動化會計解決方案，支援鏈條、銷售清單和銷售訂單
- CiviCRM——針對非盈利組織的組織關係管理軟件
- Cyclos——用於小額信貸機構、補充貨幣系統和時間銀行（timebanks）的軟件
- Dolibarr——基於Web的ERP系統
- Ebase——特別為非盈利組織開發的組織關係管理工具
- Ethereum——P2P分散型數字貨幣 + 公共區塊鏈電子平台
- EOS （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）——P2P分散型數字貨幣 + 公共區塊鏈電子平台
- Frontaccounting——基於Web的複式簿記和ERP系統
- GnuCash——複式簿記
- Grisbi——單式簿記
- HomeBank——用於個人
- IDempiere——Adempiere + OSGI ERP 企業資源計劃
- Ino erp——基於動態Pull的ERP系統
- jFin
- JFire——用Java和JDO寫成的ERP商務套件
- JQuantLib——基於Java的定量金融學應用介面（API）框架，適用於金融工具的估值和更多……
- KMyMoney——複式簿記
- LedgerSMB——複式簿記
- Mifos——微型金融機構管理軟件
- MyEtherWallet （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館） ——以太坊加密貨幣錢包
- Openbravo
- OrangeHRM——商業人力資源管理
- Postbooks——綜合會計及ERP商務套件
- QuickFIX ——用C++寫成，再用C#、Ruby和Python包裝的FIX protocol引擎
- QuickFIX/J——用Java寫成的FIX protocol引擎
- SQL Ledger——複式簿記
- SugarCRM——商業客戶關係管理
- Tryton
- TurboCASH——適用於Windows的複式簿記
- vtiger CRM——客戶關係管理（Customer Relationship Management，CRM）軟件，具備銷售力量自動化、市場管理、客戶服務／支援、庫存管理
- WebERP——基於Web的ERP系統
- Euler Math Toolbox ——有自己的語法, 也可以使用 C 或 Python
- Julia
- JavaScript ——結合Rlab等擴充函數庫
- Octave
- Python——結合NumPy、SciPy、Matplotlib、SymPy等擴充函數庫
- R語言 ——R語言 目前支援數值計算的套件一直在成長, 內建矩陣計算的指令很多, 數值微分 numDeriv,adapt, 符號運算 Ryacas,rSymPy, 微分方程 dsolve, 線性規劃 linprog,Rglpk, 等等, 另外bigmemory、bigalgebra 可以進行大矩陣計算
- SciLab
- 參見參考文獻管理軟件的比較。
- 參見開源生物資訊科學軟件列表
- Chemistry Development Kit
- JOELib
- OpenBabel
- P-GRADE Portal——網格計算軟件，可以通過進階的Web介面建立、解析和顯示工作流程
- CellProfiler
- Endrov
- FIJI (軟件)
- Ilastik
- ImageJ
- IMOD
- ITK
- KNIME
- OsiriX
- VTK
- 3D Slicer
- Active Agenda——操作風險管理及快速應用程式開發平台
- LimeSurvey——線上調查系統
- CP2K
- GAMESS (US)
輔助技術
- CMU Sphinx——卡內基梅隆大學出的演講辨識軟件
- Emacspeak——桌面音頻
- ESpeak——英語和其他語言的緊湊型軟件語音合成器
- Festival Speech Synthesis System
- Modular Audio Recognition Framework——聲音、音頻和演說的NLP處理
- NonVisual Desktop Access——（NVDA）Windows的螢幕閱讀器
- Text2Speech——輕量的易於使用的文字到語音（TTS）軟件
- Dasher——獨立的文字輸入軟件
- Gnopernicus——GNOME 2的AT套件
- Virtual Magnifying Glass——跨平台的螢幕放大工具
數據儲存和管理
- Environment for DeveLoping KDD-Applications Supported by Index-Structures (ELKI)——用Java寫成的數據探勘框架，注重於聚類及離群點檢測方法
- SCaViS——基於Java的數據分析框架
- Konstanz Information Miner (KNIME)
- OpenNN——用C++程式語言寫成的開源神經網絡軟件庫
- Orange (軟件)——對新手和專家開發的數據虛擬化和數據探勘，通過視覺化編程或Python指令碼。擴充於生物資訊科學和文字挖掘。
- RapidMiner——用Java寫成的數據探勘軟件，充分整合Weka，具有350多種操作，用於預處理、機器學習、視覺化等，預覽版以開放原始碼形式發佈
- Scriptella ETL——ETL (Extract-Transform-Load)和指令碼執行工具。支援與J2EE和Spring的整合。提供對CSV、LDAP、XML、JDBC/ODBC及其他數據源的連接。
- Weka——用Java寫成的數據探勘軟件，具備用於分類、回歸和聚類機器學習操作
- JasperSoft——帶可程式化抽象層的數據探勘軟件
- OpenDAM，自由和開源數碼資產管理軟件，用於企業內容管理整合，管理圖像、圖片和影片檔。
- CloverETL商業版
- Konstanz Information Miner (KNIME)
- Pentaho
- SpagoBI
- Talend
網絡及互聯網
- OpenX
- Apache Axis2——Web服務架構（組件可以用Java和C實行）
- Apache Geronimo
- Bonita Open Solution（軟件）——J2EE web應用和Java BPMN2執行引擎
- GlassFish應用程式伺服器
- Jakarta Tomcat——伺服器小程式容器和獨立網頁伺服器
- JBoss應用程式伺服器
- ObjectWeb JOnAS——Java Open Application Server，J2EE應用伺服器
- SmartVariables——通用的網絡共用對象的應用程式伺服器
- TAO (software)——OMG的CORBA標準的C++實現
- Drupal
- eXo Platform
- Liferay
- Oxwall——社區網站軟件
- Sun Java System Portal Server
- uPortal
- Apache Cocoon——web應用框架
- Apache——最流行的網頁伺服器
- AWStats——紀錄檔檔案分析工具
- BookmarkSync——瀏覽器的工具
- Cherokee——快速、有特色的富HTTP伺服器
- CougarXML——用來解析和處理XML代碼的Javascript框架，基於W3C DOM Level-3規格
- curl-loader——強大的開源HTTP/HTTPS/FTP/FTPS載入和測試工具
- Hiawatha——安全、高效能且易於使用的HTTP伺服器
- HTTP File Server——帶拖拽介面的用戶友好型伺服器軟件
- lighttpd——節省資源且快速及功能完善的HTTP伺服器
- Lucee——CFML應用伺服器
- nginx——輕量、高效能的web伺服器/反向代理和e-mail（IMAP/POP3）代理
- NetKernel——互聯網應用伺服器
- Piwik——web分析系統
- Qcodo——PHP5框架
- Squid (software)——web代理快取
- XAMPP——含有Apache和MySQL的web應用包
- Zope——web應用伺服器
教育
- ATutor——基於web的教學內容管理系統（Learning Content Management System，LCMS）
- Chamilo——基於web的電子教學和內容管理系統
- DoceboLMS
- eFront——基於圖示的教學管理系統
- FlightPath——大學的學術通知軟件
- GCompris
- Gnaural——腦波夾帶軟件
- IUP Portfolio
- ILIAS——基於web的教學管理系統（LMS）
- Moodle
- Omeka
- openSIS——基於web的學生資訊和學校管理系統
- Sakai Project——基於web的教學管理系統
- SWAD - 基於web的教學管理系統
- Tux Paint——3–12歲兒童的畫圖應用
- Anki ——基於間隔重複的字卡軟件
- KGeography
- Kiten
- KVerbos
- KTouch
- Tux Typing
- KEduca
檔案管理器
遊戲
系譜
圖形化使用者介面
群組軟件
醫療服務軟件
- OpenEMR——開源電子病歷整合軟件
媒體
- Art of Illusion
- Blender
- K-3D
- OpenFX
- Seamless3d
- Pencil Animation
- SWFTools（用於指令碼）
- Eye of GNOME
- F-spot
- Geeqie
- Gthumb
- Gwenview
- Kphotoalbum
- Opticks
- Dr. DivX
- FFmpeg
- MEncoder
- OggConvert
- Transcode
- Avidemux
- AviSynth
- Blender
- Cinelerra
- DScaler
- DVD Flick
- Kaltura
- Kdenlive
- Kino
- LiVES
- OpenShot Video Editor
- Pitivi
- Shotcut
- VirtualDub
- VirtualDubMod
- VideoLAN Movie Creator——VLMC是基於libVLC的非線性的用於影片建立的編輯應用程式，執行於Windows、Linux和OS X。
- Avidemux
- HandBrake
- Celtx——媒體預生產軟件
- GNOME Subtitles
作業系統
注意這些系統的可用發行版會包含或提供的版本和安裝/附加的不自由不開放原始碼的軟件。
密碼管理器
- KeePass
- Password Safe
- Mitro
個人資訊管理器
- Chandler——由OSAF開發
- KAddressBook
- Kontact
- KOrganizer
- Mozilla Calendar——基於Mozilla的跨平台日曆軟件
- Novell Evolution
- OpenSync (軟件)
- Project.net——商業專案管理
- TeamLab——專案管理和合作平台
程式語言支援
- Bison
- CodeSynthesis XSD——適用於C++的XML Data Binding編譯器
- CodeSynthesis XSD/e——適用於移動和嵌入式裝置的驗證XML解析器/串行器和C++ XML Data Binding生成器
- Flex lexical analyser——詞法剖析器
- Kodos
- Open Scene Graph——3D圖型應用編程介面
- OpenSCDP——開放的智能卡開發平台
- phpCodeGenie
- SableCC——適用於Java和.Net的分析程式的生成程式
- SWIG——用於多種語言的簡化包裝和介面生成器
- ^txt2regex$
- xmlbeansxx——用於C++的XML Data Binding碼產生器
- YAKINDU Statechart Tools——用於C++和Java的狀態圖碼產生器
- GNU Debugger——用於許多程式語言
- Memtest86——x86裝置的RAM壓力測試
- Xnee——記錄和回放測試
螢幕保護裝置
- BOINC
- Electric Sheep
- XScreenSaver
安全
- ClamAV
- ClamWin
- Gateway Anti-Virus
- Lynis
- MyDLP
- dvdisaster
- Foremost
- PhotoRec
- TestDisk
- The Coroner's Toolkit
- The Sleuth Kit
- DBAN
- srm
神學
排版
參見
- 自由及開放原始碼軟件
- GNOME應用程式列表
- GNU軟件套件列表
- KDE應用程式列表
- Unix應用程式列表
- SourceForge.net
- Freshmeat
- Ohloh
- CodePlex
參考資料
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