PyMOL是一個開放原始碼，由用戶贊助的分子三維結構顯示軟件。由Warren Lyford DeLano編寫，並且由DeLano Scientific LLC將它商業化。DeLano Scientific LLC是一個私人的軟件公司，它致力於創造讓普遍的科學與教育社群都能取得的好用軟件工具。
PyMOL適用於創作高質素的小分子或是生物大分子（特別是蛋白質）的三維結構圖像。軟件的作者宣稱，在所有正式發表的科學文獻中的蛋白質結構圖像中，有四分之一是使用PyMOL來製作。
PyMOL是少數可以用在結構生物學領域的開放原始碼視覺化工具。
軟件以Py+MOL命名：「Py」表示它是由一種電腦語言Python所衍生出來的，「MOL」表示它是用於顯示分子（英文為molecule）結構的軟件。
商業化舉措
自2006年8月1日起，DeLano Scientific對於事先編譯過的PyMOL執行程式（包括beta版）的取得採取限定下載的措施。 目前，完全無限制的可執行程式只有付費用戶可以取得。學生和教師可以通過一項聲明來取得教育版PyMOL以用於教學和其它受限制的領域。用戶還可以在一定時間內免費使用評估版本，以便於決定是否購買該軟件。
PyMOL的原始碼目前仍可以免費下載，供用戶編譯。對於Linux、Unix以及Mac OS X等作業系統，非付費用戶可以通過自行編譯原始碼來獲得PyMOL執行程式；而對於Windows的用戶，如果不安裝第三方軟件，則無法編譯原始碼。這表示使用Windows的用戶取得新版PyMOL（PyMOL1.0及之後的版本）執行程式的方式就是成為付費會員，或者使用第三方軟件（如Cygwin）進行編譯[1]。
類似軟件
參考文獻
外部連結
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