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艱難擬梭菌[1]（學名：Clostridioides difficile，C. diff）又稱艱難類梭菌[2]，舊名艱難梭菌[3]（Clostridium difficile）、困難梭狀芽孢桿菌[4]、困難梭狀桿菌[5][6]，屬厭氧性擬梭菌屬細菌，一般寄生在人的腸道內。厭氧性細菌是指那些在無氧條件下要比在有氧環境下生長好的細菌，而人的腸道正好是一個相對無氧的環境。如果過度服用某些抗生素，艱難擬梭菌的菌群生長速度加快，影響腸道中其他細菌，引發炎症。
艱難擬梭菌是梭菌屬的一個成員，對氧十分敏感，很難分離培養，故得名。梭菌屬成員很多，可分為幾個群，其中有幾個成員對人是致病性的。最著名的有產氣莢膜梭菌、破傷風梭菌和肉毒梭菌。產氣莢膜梭菌可引起傷口氣性壞疽、食物中毒、肌肉壞死、梭菌蜂窩織炎等，破傷風梭菌可引起破傷風，肉毒梭菌可引起肉毒中毒。肉毒中毒的典型臨床特徵是急性弛緩麻痹，先從雙側顱神經阻礙開始，包括面部、頭顱和咽部的肌肉，然後對稱性下降，包括喉部和肢體肌肉。由於舌或咽部肌癱瘓可引起的呼吸困難，隔膜和肋部的癱瘓可能引起死亡。產氣莢膜梭菌是一種常見的引起食物中毒的細菌。
艱難擬梭菌發現於1935年，但直到1977年發現本菌與臨床長期使用某些抗生素（氨苄青黴素、頭孢黴素、紅黴素、氯林可黴素等）引起的偽膜性結腸炎有關，方被重視。
艱難擬梭菌廣泛分布於自然環境中，如土壤、乾草、沙、一些大型動物（牛、驢和馬）的糞便，及狗、貓、齧齒動物和人的糞便，除此之外還大量存在於水和動物的腸道中。嬰兒的糞便中常含有艱難擬梭菌，為新生嬰兒腸道中正常菌群，大約50% 12月齡嬰兒的腸道中有艱難擬梭菌，2歲以上兒童的帶菌率大約為3%，但此菌在健康成人中出現頻率較低，無症狀帶菌的成人在瑞典是1.9%，在日本為15.4%，這種細菌會產生腸毒素和細胞毒素[7]，是一種能引起偽膜性結腸炎的厭氧梭菌屬細菌[8]，也是一種導致住院病人腹瀉的常見細菌，病徵由輕度以至嚴重的腹瀉。
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主要為 toxin A（TcdA）、toxin B（TcdB）[9][10]，藉由將尿苷二磷酸葡萄糖 (UDP-glucose）的葡萄糖轉移至 Rho small GTPase（醣基化）使其失活，這將導致：
艱難擬梭菌可定植於人體腸道而不出現症狀，因為腸道正常菌叢可壓制其生長，但當使用大量廣譜抗生素(如頭孢菌素)，會殺死正常菌叢，使艱難擬梭菌大量增生並產生毒素，導致腹瀉、噁心、發燒，甚至導致偽膜性結腸炎及毒性巨結腸症(Toxic megacolon)致死。
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