软体动物分类表

软体动物（Mollusca）可分为9个大纲，另有一纲的分类未明确，可能纳入软体动物门内，下表中带†号的是化石类群。

生物分类表

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单板纲（Monoplacophora）

• 罩螺目（Tryblidioidea）
• 古祐目（Archinacelloidea）†
• 弓壳目（Cyrtonellida）

无板纲（Aplacophora）

• 毛皮贝目（Caudofoveata）
• 新月贝目（Solenogastres）

多板纲（Polyplacophora）

• 古石鳖亚纲（Paleoloricata）†
  • 目（Chelodida）
  • 目（Septemchitonida）
• 石鳖亚纲（Loricata）/ 新石鳖亚纲（Neoloricata）
  • 鳞侧石鳖目（Lepidopleurida）
  • 石鳖目（Chitonida）
    • 石鳖亚目（Chitonina）
    • 毛肤石鳖亚目（Acanthochitonida）

掘足纲（Scaphopoda）

• 角贝目（Dentaliida）
• 管角贝目（Gadilida）

双壳纲（Bivalvia）

• 古列齿亚纲（Palaeotaxodonta）
  • 湾锦蛤目（Nuculoida）
• 隐齿亚纲（Cryptodonta）
  • 蛏螂目（Solemyoida）
• 翼形亚纲（Pteriomorphia）
  • 蚶目（Arcoida）
  • 贻贝目（Mytiloida）
  • 珍珠贝目（Pterioida）
• 古异齿亚纲（Palaeoheterodonta）
  • 三角蛤目（Trigonioida）
  • 河蚌目（Unionoida）
• 异齿亚纲（Heterodonta）
  • 帘蛤目（Veneroida）
  • 海螂目（Myoida）
• 异韧带亚纲（Anomalodesmata）
  • 笋螂目（Pholadomyoida）

喙壳纲（Rostroconchia）†

• 利培壳目（Ribeirioida）
  • 利培壳科（Ribeiriidae）
  • 敏蜂壳科（Technophoridae）
• 强壮壳目（Ischyrinioida）
  • 强壮壳科（Ischyriniidae）
• 锥鸟壳目（Conocardioida）
  • 始翼壳超科（Eopteriacea）
    • 始翼壳科（Eopteriidae）
  • 锥鸟壳超科（Conocardiacea）
    • 锥鸟壳科（Conocardiidae）
    • 勃氏壳科（Bransoniidae）
    • 马心壳科（Hippocardiidae）

腹足纲（Gastropoda）

主条目：腹足纲的谱系学分类

旧分类系统

• 前鳃亚纲（Prosobranchia）
  • 古腹足目（Archaeogastropoda）
  • 中腹足目（Mesogastropoda）
  • 新腹足目（Neogastropoda）
• 后鳃亚纲（Opithobranchia）
  • 翼足目（Pteropoda）
  • 囊舌目（Sacoglossa）
  • 无腔目（）
• 肺螺亚纲（Pulmonata）
  • 基眼目（Basommatophora）
  • 柄眼目（Stylommatophora）

新分类系统

• 前鳃类（Prosobranchia）
  • 珍珠蜑螺超目（Neritopsina）
  • 新进腹足超目（Caenogastropoda）
    • 吸螺目（Sorbeoconcha）
    • 主扭舌目（Architaenioglossa）
• 有肺类（Pulmonata）
  • 缩眼目（Systellommatophora）
  • 基眼目（Basommatophora）
  • 真肺目（Eupulmonata）

头足纲（Cephalopoda）

• 鹦鹉螺亚纲（Nautiloidea）
  • 鹦鹉螺目（Nautiloidea）
  • 短棒角石目（Plectronocerida）†
  • 爱丽斯木角石目（Ellesmerocerida）†
  • 内角石目（Endocerida）†
  • 珠角石目（Actinocerida）†
  • 触环角石目（Tarphycerida）†
  • 箭钩角石目（Oncocerida）†
  • 杆石目（Bactritida）†
• 直角石亚纲 (Orthoceratoidea) †
  • 袋角石目（Ascocerida）†
  • 直角石目（Orthocerida）†
  • 叠盘角石目（Discosorida）†
  • 假直角石目（Pseudorthocerida）†
  • 喇叭角石目（Lituitida）†
• 菊石亚纲（Ammonoidea）†
  • 拟古菊石目（Agoniatitida）
  • 海神石目（Clymeniida）
  • 棱菊石目（Goniatitida）
  • 前碟菊石目（Prolecanitida）
  • 齿菊石目（Ceratitida）
  • 菊石目（Ammonitida）
• 鞘亚纲（Coleoidea）
  • 箭石下纲（Belemnoidea）†
    • 血箭石目（Hematitida）
    • 沟箭石目（Aulacocerida）
    • 闭箭石目（Phragmoteuthida）
    • 箭石目（Belemnitida）
    • 双箭石目（Diplobelida）
  • 新蛸下纲（Neocoleoidea）
    • 十腕总目 Decapodiformes
      • 目（Boletzkyida）?†
      • 乌贼目（Sepioidea）
      • 耳乌贼目（Sepiolida）
      • 旋乌贼目（Spirulida）
      • 枪形目（Teuthoidea）
        • 开眼亚目（Oegopsida）
        • 闭眼亚目（Myopsida）
    • 八腕总目（Octopodiformes）
      • 八腕目（Octopoda）
        • 有须亚目（Cirrata）
        • 无须亚目（Incirrata）
      • 幽灵蛸目（Vampyromorpha）
        • 亚目（Kelaenina）?†
        • 原枪形亚目（Prototeuthina）†
        • 中鱿亚目（Mesoteuthina）†
        • 幽灵蛸亚目（Vampyromorphina）
      • 口噬目（Trachyteuthis）†

太阳女神螺纲（Helcionelloida）†

• 古鳃亚纲（Archaeobranchia）
  • 太阳女神螺形目（Helcionelliformes）
  • 目（Pelagiellifomes）
• 亚纲（Divasibranchia）
  • 目（Khairkhaniifomes）
• 右鳃亚纲（Dextrobranchia）
  • 目（Onychochiliformes）

竹节石纲（Tentaculita）†

• 竹节石目（Tentaculitida）
• 等环节石目（Homoctenida）
• 珠胚节石目（Dacryoconarida）

可能纳入软体动物门，分类未明确。