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肉鳍鱼总纲（学名：Sarcopterygii，英语：lobe-finned fish）是硬骨鱼类的一个演化支，与辐鳍鱼互为姐妹群。肉鳍鱼的特点是鳍的主体是一个内有多关节内骨骼（附肢骨骼）和骨骼肌的附肢（而不像辐鳍鱼那样是仅有皮肤覆盖棘骨的折扇形鳍），在胸鳍和腹鳍的基部有胛骨和强劲的肌肉与肋骨相连，和之后四足动物的四肢同源。此总纲之下包括腔棘鱼纲及肺鱼四足纲[1][2]，而所有陆地脊椎动物都演化自肺鱼四足纲中的四足形类。
肉鳍鱼最早出现在距今4.23亿年前的志留纪晚期，在石炭纪和二叠纪时期兴盛并成为淡水生态系统的顶级物种，但在二叠纪末大灭绝中受到重创，大部分于距今6500万年前的晚白垩纪绝种。其中的腔棘鱼曾被认为完全灭绝，直到1938年才在非洲东南的印度洋深海捕捉到现生的活体，之后并在印度等地区多次被发现而证实仍然存活于深海中，目前仅存一目二种，即矛尾鱼，被认为是鱼类中的活化石。
目前已知体型最大的肉鳍鱼为石炭纪时期苏格兰的希氏根齿鱼，体长可超过7米（23英尺）。现存体型最大的腔棘鱼为西印度洋矛尾鱼，体长可达2米（6英尺7英寸），体重可达110千克（240英磅）；体型最大的肺鱼为非洲肺鱼科，体长同样可达2米（6英尺7英寸），重量可以达到50千克（110英磅）[3][4]。
分子遗传学表明，包括人类在内的陆生脊椎动物（四足动物）都属于这一演化支，依据化石研究推测，有可能是在大约 3.6 亿年前从肉鳍鱼类中的类似蝶柱鱼的祖先演化而来[5][6]。四足类祖先的鳔因直接从空气进行气体交换的能力变强逐渐演化成了肺，因此更适应泥盆纪晚期遍布湿地的河岸带生态位，其两对硬骨化的偶鳍也逐渐演化成了更强健的四肢。而志留纪—泥盆纪陆地革命后空气含氧量持续提升，加上之后泥盆纪末大灭绝中普遍水体缺氧造成的筛选压力更有利那些能直接呼吸空气的族群，使得幸存的四足形类（坚头类）最终演化成出原始的两栖动物。而由于两栖动物中离片椎类的强势，使得其它被边缘化的两栖动物不得不去适应更远离水体的生态位，其中一支——爬行形类最终演化出了可以完全脱离水体进行繁殖的羊膜动物。这些羊膜动物很快分化出合弓类和蜥形类两大演化支，并在石炭纪雨林崩溃事件后的二叠纪成为优势的陆生动物，其中一些还在三叠纪先后返回水域生态系统成为海洋爬行动物。
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肺鱼四足纲（Dipnotetrapodomorpha）除了包含现存的肺鱼纲和四足形上纲，也包含史前的爪齿鱼类，而扇鳍纲则是个只包含前两者的泛群、但不包含爪齿鱼类。肺鱼四足大纲与扇鳍类的关系取决于爪齿鱼类的地位，如果爪齿鱼类较接近肺鱼四足类而不是棘腔鱼纲，则扇鳍类为肺鱼四足类的下级分支；如果爪齿鱼类不属于这里，则肺鱼四足大纲可能成为扇鳍纲的异名：
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依照 2017 年《硬骨鱼支序分类法》，本总纲与其它现生硬骨鱼的演化关系如下[1][7]：
| 有颌下门 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gnathostomata |
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