Нідоген-1

NID1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1NDX
Ідентифікатори
Символи	NID1, NID, nidogen 1, entactin
Зовнішні ІД	OMIM: 131390 MGI: 97342 HomoloGene: 1878 GeneCards: NID1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• laminin-1 binding; • calcium ion binding; • laminin binding; • collagen binding; • extracellular matrix binding; • proteoglycan binding; • extracellular matrix structural constituent;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • базальна мембрана; • екзосома; • cell periphery; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cell-matrix adhesion; • extracellular matrix disassembly; • extracellular matrix organization; • адгезія клітин; • glomerular basement membrane development; • basement membrane organization; • positive regulation of cell-substrate adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4811
	18073
	ENSG00000116962
	ENSMUSG00000005397
	P14543
	P10493
	NM_002508
	NM_010917
	NP_002499
	NP_035047
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NID1 (англ. Nidogen 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 247 амінокислот, а молекулярна маса — 136 377^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLASSSRIRA	AWTRALLLPL	LLAGPVGCLS	RQELFPFGPG	QGDLELEDGD
DFVSPALELS	GALRFYDRSD	IDAVYVTTNG	IIATSEPPAK	ESHPGLFPPT
FGAVAPFLAD	LDTTDGLGKV	YYREDLSPSI	TQRAAECVHR	GFPEISFQPS
SAVVVTWESV	APYQGPSRDP	DQKGKRNTFQ	AVLASSDSSS	YAIFLYPEDG
LQFHTTFSKK	ENNQVPAVVA	FSQGSVGFLW	KSNGAYNIFA	NDRESVENLA
KSSNSGQQGV	WVFEIGSPAT	TNGVVPADVI	LGTEDGAEYD	DEDEDYDLAT
TRLGLEDVGT	TPFSYKALRR	GGADTYSVPS	VLSPRRAATE	RPLGPPTERT
RSFQLAVETF	HQQHPQVIDV	DEVEETGVVF	SYNTDSRQTC	ANNRHQCSVH
AECRDYATGF	CCSCVAGYTG	NGRQCVAEGS	PQRVNGKVKG	RIFVGSSQVP
IVFENTDLHS	YVVMNHGRSY	TAISTIPETV	GYSLLPLAPV	GGIIGWMFAV
EQDGFKNGFS	ITGGEFTRQA	EVTFVGHPGN	LVIKQRFSGI	DEHGHLTIDT
ELEGRVPQIP	FGSSVHIEPY	TELYHYSTSV	ITSSSTREYT	VTEPERDGAS
PSRIYTYQWR	QTITFQECVH	DDSRPALPST	QQLSVDSVFV	LYNQEEKILR
YALSNSIGPV	REGSPDALQN	PCYIGTHGCD	TNAACRPGPR	TQFTCECSIG
FRGDGRTCYD	IDECSEQPSV	CGSHTICNNH	PGTFRCECVE	GYQFSDEGTC
VAVVDQRPIN	YCETGLHNCD	IPQRAQCIYT	GGSSYTCSCL	PGFSGDGQAC
QDVDECQPSR	CHPDAFCYNT	PGSFTCQCKP	GYQGDGFRCV	PGEVEKTRCQ
HEREHILGAA	GATDPQRPIP	PGLFVPECDA	HGHYAPTQCH	GSTGYCWCVD
RDGREVEGTR	TRPGMTPPCL	STVAPPIHQG	PAVPTAVIPL	PPGTHLLFAQ
TGKIERLPLE	GNTMRKTEAK	AFLHVPAKVI	IGLAFDCVDK	MVYWTDITEP
SIGRASLHGG	EPTTIIRQDL	GSPEGIAVDH	LGRNIFWTDS	NLDRIEVAKL
DGTQRRVLFE	TDLVNPRGIV	TDSVRGNLYW	TDWNRDNPKI	ETSYMDGTNR
RILVQDDLGL	PNGLTFDAFS	SQLCWVDAGT	NRAECLNPSQ	PSRRKALEGL
QYPFAVTSYG	KNLYFTDWKM	NSVVALDLAI	SKETDAFQPH	KQTRLYGITT
ALSQCPQGHN	YCSVNNGGCT	HLCLATPGSR	TCRCPDNTLG	VDCIEQK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Коротка інформація NID1, Наявні структури ...

Закрити

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Remove ads

Zimmermann K., Hoischen S., Hafner M., Nischt R. (1995). Genomic sequences and structural organization of the human nidogen gene (NID). Genomics. 27: 245—250. PMID 7557988 DOI:10.1006/geno.1995.1038
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee H.K., Seo I.A., Park H.K., Park H.T. (2006). Identification of the basement membrane protein nidogen as a candidate ligand for tumor endothelial marker 7 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 580: 2253—2257. PMID 16574105 DOI:10.1016/j.febslet.2006.03.033

Remove ads

[1]
Human PubMed Reference:.
[2]
Mouse PubMed Reference:.
[3]
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7821 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
[4]
UniProt, P14543 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.

Remove ads

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Remove ads

[1] [1]
Human PubMed Reference:.

[2] [2]
Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] [3]
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7821 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] [4]
UniProt, P14543 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]

Нідоген-1

Wikiwand in your browser!

Нідоген-1

Wikiwand in your browser!

Література

Примітки

Див. також