Лактотрансферин

Лактотрансферин (англ. Lactotransferrin) – білок, який кодується геном LTF, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 710 амінокислот, а молекулярна маса — 78 182^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLVFLVLLF		LGALGLCLAG		RRRSVQWCAV		SQPEATKCFQ		WQRNMRKVRG
PPVSCIKRDS		PIQCIQAIAE		NRADAVTLDG		GFIYEAGLAP		YKLRPVAAEV
YGTERQPRTH		YYAVAVVKKG		GSFQLNELQG		LKSCHTGLRR		TAGWNVPIGT
LRPFLNWTGP		PEPIEAAVAR		FFSASCVPGA		DKGQFPNLCR		LCAGTGENKC
AFSSQEPYFS		YSGAFKCLRD		GAGDVAFIRE		STVFEDLSDE		AERDEYELLC
PDNTRKPVDK		FKDCHLARVP		SHAVVARSVN		GKEDAIWNLL		RQAQEKFGKD
KSPKFQLFGS		PSGQKDLLFK		DSAIGFSRVP		PRIDSGLYLG		SGYFTAIQNL
RKSEEEVAAR		RARVVWCAVG		EQELRKCNQW		SGLSEGSVTC		SSASTTEDCI
ALVLKGEADA		MSLDGGYVYT		AGKCGLVPVL		AENYKSQQSS		DPDPNCVDRP
VEGYLAVAVV		RRSDTSLTWN		SVKGKKSCHT		AVDRTAGWNI		PMGLLFNQTG
SCKFDEYFSQ		SCAPGSDPRS		NLCALCIGDE		QGENKCVPNS		NERYYGYTGA
FRCLAENAGD		VAFVKDVTVL		QNTDGNNNEA		WAKDLKLADF		ALLCLDGKRK
PVTEARSCHL		AMAPNHAVVS		RMDKVERLKQ		VLLHQQAKFG		RNGSDCPDKF
CLFQSETKNL		LFNDNTECLA		RLHGKTTYEK		YLGPQYVAGI		TNLKKCSTSP
LLEACEFLRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Лактотрансферин
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PMS, 1B0L, 1BKA, 1CB6, 1DSN, 1EH3, 1FCK, 1H43, 1H44, 1H45, 1HSE, 1L5T, 1LCF, 1LCT, 1LFG, 1LFH, 1LFI, 1LGB, 1N76, 1SQY, 1U62, 1VFD, 1VFE, 1XV4, 1XV7, 1Z6V, 1Z6W, 2BJJ, 2DP4, 2GMC, 2GMD, 2HD4
Ідентифікатори
Символи	LTF, GIG12, HEL110, HLF2, LF, lactotransferrin
Зовнішні ІД	OMIM: 150210 MGI: 96837 HomoloGene: 1754 GeneCards: LTF
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • DNA binding • heparin binding • protein serine/threonine kinase activator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • lipopolysaccharide binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity Клітинна компонента • цитоплазма • secretory granule • extracellular region • cell surface • specific granule • phagocytic vesicle lumen • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • specific granule lumen • tertiary granule lumen • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • positive regulation of osteoblast proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of chondrocyte proliferation • negative regulation of osteoclast development • осифікація • regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of viral process • процес імунної системи • negative regulation of ATP-dependent activity • antibacterial humoral response • bone morphogenesis • iron ion homeostasis • positive regulation of bone mineralization involved in bone maturation • negative regulation of apoptotic process • ion transport • transcription, DNA-templated • протеоліз • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity • negative regulation of single-species biofilm formation in or on host organism • negative regulation by host of viral process • negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • GO:0032657 regulation of cytokine production • negative regulation of tumor necrosis factor (ligand) superfamily member 11 production • retina homeostasis • negative regulation of viral genome replication • innate immune response in mucosa • positive regulation of osteoblast differentiation • humoral immune response • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • siderophore-dependent iron import into cell • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • вроджений імунітет • negative regulation of membrane potential • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity • GO:0015915 транспорт • antifungal humoral response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4057	17002
Ensembl	ENSG00000012223	ENSMUSG00000032496
UniProt	P02788	P08071
RefSeq (мРНК)	NM_002343 NM_001199149 NM_001321121 NM_001321122	NM_008522
RefSeq (білок)	NP_001186078 NP_001308050 NP_001308051 NP_002334	NP_032548
Локус (UCSC)	Хр. 3: 46.44 – 46.49 Mb	Хр. 9: 110.85 – 110.87 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз, антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт іонів, транспорт заліза, транспорт, остеогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, ДНК, з молекулою гепарину. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.

Література

• Rey M.W., Woloshuk S.L., de Boer H.A., Pieper F.R. (1990). Complete nucleotide sequence of human mammary gland lactoferrin. Nucleic Acids Res. 18: 5288—5288. PMID 2402455 DOI:10.1093/nar/18.17.5288
• Siebert P.D., Huang B.C. (1997). Identification of an alternative form of human lactoferrin mRNA that is expressed differentially in normal tissues and tumor-derived cell lines. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 2198—2203. PMID 9122171 DOI:10.1073/pnas.94.6.2198
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Teng C.T., Liu Y., Yang N., Walmer D., Panella T. (1992). Differential molecular mechanism of the estrogen action that regulates lactoferrin gene in human and mouse. Mol. Endocrinol. 6: 1969—1981. PMID 1480183 DOI:10.1210/mend.6.11.1480183
• Powell M.J., Ogden J.E. (1990). Nucleotide sequence of human lactoferrin cDNA. Nucleic Acids Res. 18: 4013—4013. PMID 2374734 DOI:10.1093/nar/18.13.4013
• Hunter H.N., Demcoe A.R., Jenssen H., Gutteberg T.J., Vogel H.J. (2005). Human lactoferricin is partially folded in aqueous solution and is better stabilized in a membrane mimetic solvent. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 3387—3395. PMID 16048952 DOI:10.1128/AAC.49.8.3387-3395.2005

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6720 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
4. UniProt, P02788 (англ.) . Архів оригіналу за 23 січня 2017. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

• Хромосома 3