RORA (англ. RAR related orphan receptor A) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 523 амінокислот, а молекулярна маса — 58 975[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESAPAAPDP | | AASEPGSSGA | | DAAAGSRETP | | LNQESARKSE | | PPAPVRRQSY |
SSTSRGISVT | | KKTHTSQIEI | | IPCKICGDKS | | SGIHYGVITC | | EGCKGFFRRS |
QQSNATYSCP | | RQKNCLIDRT | | SRNRCQHCRL | | QKCLAVGMSR | | DAVKFGRMSK |
KQRDSLYAEV | | QKHRMQQQQR | | DHQQQPGEAE | | PLTPTYNISA | | NGLTELHDDL |
SNYIDGHTPE | | GSKADSAVSS | | FYLDIQPSPD | | QSGLDINGIK | | PEPICDYTPA |
SGFFPYCSFT | | NGETSPTVSM | | AELEHLAQNI | | SKSHLETCQY | | LREELQQITW |
QTFLQEEIEN | | YQNKQREVMW | | QLCAIKITEA | | IQYVVEFAKR | | IDGFMELCQN |
DQIVLLKAGS | | LEVVFIRMCR | | AFDSQNNTVY | | FDGKYASPDV | | FKSLGCEDFI |
SFVFEFGKSL | | CSMHLTEDEI | | ALFSAFVLMS | | ADRSWLQEKV | | KIEKLQQKIQ |
LALQHVLQKN | | HREDGILTKL | | ICKVSTLRAL | | CGRHTEKLMA | | FKAIYPDIVR |
LHFPPLYKEL | | FTSEFEPAMQ | | IDG |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
RORA
|
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4f/Protein_RORA_PDB_1n83.png/250px-Protein_RORA_PDB_1n83.png) |
|
Ідентифікатори |
Символи |
RORA, NR1F1, ROR1, ROR2, ROR3, RZR-ALPHA, RZRA, RAR related orphan receptor A, IDDECA |
Зовнішні ІД |
OMIM: 600825 MGI: 104661 HomoloGene: 56594 GeneCards: RORA
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
шизофренія, бронхіальна астма, депресія клінічна[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
холестерол[2] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • ligand-activated transcription factor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription coactivator binding • transcription corepressor binding • oxysterol binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
Біологічний процес |
• negative regulation of fat cell differentiation • nitric oxide biosynthetic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cGMP metabolic process • ритмічний процес • cellular response to sterol • cellular response to tumor necrosis factor • cerebellar Purkinje cell differentiation • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cerebellar granule cell precursor proliferation • regulation of steroid metabolic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of smoothened signaling pathway • muscle cell differentiation • intracellular receptor signaling pathway • regulation of glucose metabolic process • regulation of circadian rhythm • Ангіогенез • cellular response to interleukin-1 • xenobiotic metabolic process • positive regulation of circadian rhythm • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • T-helper 17 cell differentiation • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • negative regulation of inflammatory response • cellular response to hypoxia • triglyceride homeostasis • regulation of macrophage activation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • циркадний ритм • cytokine-mediated signaling pathway • cholesterol homeostasis • multicellular organism development
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e2/PBB_GE_RORA_210479_s_at_fs.png/640px-PBB_GE_RORA_210479_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/48/PBB_GE_RORA_210426_x_at_fs.png/640px-PBB_GE_RORA_210426_x_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 15: 60.49 – 61.23 Mb |
Хр. 9: 68.56 – 69.3 Mb |
PubMed search |
[3] |
[4]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг.
Білок має вузол для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Валері Ху відкрила, що ген RORA, який може перебувати під позитивною регуляцією андрогенів, призводить до накопичення додаткового тестостерону, який може спричиняти більшу частоту проявів аутизму у чоловіків.[7][8][9][10]
- Becker-Andre M., Andre E., Delamarter J.F. (1993). Identification of nuclear receptor mRNAs by RT-PCR amplification of conserved zinc-finger motif sequences. Biochem. Biophys. Res. Commun. 194: 1371—1379. PMID 7916608 DOI:10.1006/bbrc.1993.1976
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Harding H.P., Atkins G.B., Jaffe A.B., Seo W.J., Lazar M.A. (1997). Transcriptional activation and repression by RORalpha, an orphan nuclear receptor required for cerebellar development. Mol. Endocrinol. 11: 1737—1746. PMID 9328355 DOI:10.1210/mend.11.11.0002
- Lau P., Bailey P., Dowhan D.H., Muscat G.E. (1999). Exogenous expression of a dominant negative RORalpha1 vector in muscle cells impairs differentiation: RORalpha1 directly interacts with p300 and myoD. Nucleic Acids Res. 27: 411—420. PMID 9862959 DOI:10.1093/nar/27.2.411
- Sundvold H., Lien S. (2001). Identification of a novel peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) gamma promoter in man and transactivation by the nuclear receptor RORalpha1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287: 383—390. PMID 11554739 DOI:10.1006/bbrc.2001.5602
- Moraitis A.N., Giguere V. (2003). The co-repressor hairless protects RORalpha orphan nuclear receptor from proteasome-mediated degradation. J. Biol. Chem. 278: 52511—52518. PMID 14570920 DOI:10.1074/jbc.M308152200