Pdx1 (англ. Pancreatic and duodenal homeobox 1) – білок, який кодується геном PDX1, розташованим у людей на довгому плечі 13-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот, а молекулярна маса — 30 771[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNGEEQYYAA | | TQLYKDPCAF | | QRGPAPEFSA | | SPPACLYMGR | | QPPPPPPHPF |
PGALGALEQG | | SPPDISPYEV | | PPLADDPAVA | | HLHHHLPAQL | | ALPHPPAGPF |
PEGAEPGVLE | | EPNRVQLPFP | | WMKSTKAHAW | | KGQWAGGAYA | | AEPEENKRTR |
TAYTRAQLLE | | LEKEFLFNKY | | ISRPRRVELA | | VMLNLTERHI | | KIWFQNRRMK |
WKKEEDKKRG | | GGTAVGGGGV | | AEPEQDCAVT | | SGEELLALPP | | PPPPGGAVPP |
AAPVAAREGR | | LPPGLSASPQ | | PSSVAPRRPQ | | EPR |
Коротка інформація Ідентифікатори, Символи ...
Pdx1
|
---|
|
Ідентифікатори |
Символи |
PDX1, GSF, IDX-1, IPF1, IUF1, MODY4, PAGEN1, PDX-1, STF-1, pancreatic and duodenal homeobox 1 |
Зовнішні ІД |
OMIM: 600733 MGI: 102851 HomoloGene: 175 GeneCards: PDX1
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
partial pancreatic agenesis, maturity-onset diabetes of the young type 9[1] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • protein heterodimerization activity • promoter-specific chromatin binding
|
Клітинна компонента |
• цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма
|
Біологічний процес |
• exocrine pancreas development • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glucose homeostasis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • insulin secretion • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • generation of precursor metabolites and energy • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • positive regulation of cell population proliferation • nitric oxide mediated signal transduction • glucose metabolic process • animal organ morphogenesis • pancreas development • liver development • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • morphogenesis of embryonic epithelium • digestive tract development • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • endocrine pancreas development • type B pancreatic cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • detection of glucose • smoothened signaling pathway • central nervous system development • response to wounding • response to glucose • response to iron(II) ion • response to chlorate • регуляція експресії генів • positive regulation of cell death • GO:1904578 response to organic cyclic compound • animal organ regeneration • response to nutrient levels • positive regulation of insulin secretion • response to vitamin • response to lipid • response to cytokine • response to nicotine • response to leucine • response to alkaloid • positive regulation of DNA binding • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • response to glucocorticoid • transdifferentiation • response to fatty acid
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 13: 27.92 – 27.93 Mb |
Хр. 5: 147.21 – 147.21 Mb |
PubMed search |
[2] |
[3]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Цей білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Транскрипційний фактор залучений до розвитку підшлункової залози та дозрівання β-клітин. Відповідний ген, що його кодує, носить назву Pdx1 (у гризунів) або Ipf1 (в людини).
- Stoffers D.A., Zinkin N.T., Stanojevic V., Clarke W.L., Habener J.F. (1997). Pancreatic agenesis attributable to a single nucleotide deletion in the human IPF1 gene coding sequence. Nat. Genet. 15: 106—110. PMID 8988180 DOI:10.1038/ng0197-106
- Francis J., Chakrabarti S.K., Garmey J.C., Mirmira R.G. (2005). Pdx-1 links histone H3-Lys-4 methylation to RNA polymerase II elongation during activation of insulin transcription. J. Biol. Chem. 280: 36244—36253. PMID 16141209 DOI:10.1074/jbc.M505741200