NANOG (англ. Nanog homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 305 амінокислот, а молекулярна маса — 34 620[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSVDPACPQS | | LPCFEASDCK | | ESSPMPVICG | | PEENYPSLQM | | SSAEMPHTET |
VSPLPSSMDL | | LIQDSPDSST | | SPKGKQPTSA | | EKSVAKKEDK | | VPVKKQKTRT |
VFSSTQLCVL | | NDRFQRQKYL | | SLQQMQELSN | | ILNLSYKQVK | | TWFQNQRMKS |
KRWQKNNWPK | | NSNGVTQKAS | | APTYPSLYSS | | YHQGCLVNPT | | GNLPMWSNQT |
WNNSTWSNQT | | QNIQSWSNHS | | WNTQTWCTQS | | WNNQAWNSPF | | YNCGEESLQS |
CMQFQPNSPA | | SDLEAALEAA | | GEGLNVIQQT | | TRYFSTPQTM | | DLFLNYSMNM |
QPEDV |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
NANOG
|
---|
|
|
Ідентифікатори |
Символи |
NANOG, entrez:79923, Nanog, Nanog homeobox |
Зовнішні ІД |
OMIM: 607937 MGI: 1919200 HomoloGene: 78027 GeneCards: NANOG
|
---|
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
Клітинна компонента |
• ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма
|
Біологічний процес |
• регуляція експресії генів • регуляція диференціювання клітин • multicellular organism development • диференціація клітин • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • endodermal cell fate specification • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • stem cell population maintenance • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of stem cell proliferation
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 12: 7.79 – 7.8 Mb |
Хр. 6: 122.68 – 122.69 Mb |
PubMed search |
[1] |
[2]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.