MYB (англ. MYB proto-oncogene, transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 72 341[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MARRPRHSIY | | SSDEDDEDFE | | MCDHDYDGLL | | PKSGKRHLGK | | TRWTREEDEK |
LKKLVEQNGT | | DDWKVIANYL | | PNRTDVQCQH | | RWQKVLNPEL | | IKGPWTKEED |
QRVIELVQKY | | GPKRWSVIAK | | HLKGRIGKQC | | RERWHNHLNP | | EVKKTSWTEE |
EDRIIYQAHK | | RLGNRWAEIA | | KLLPGRTDNA | | IKNHWNSTMR | | RKVEQEGYLQ |
ESSKASQPAV | | ATSFQKNSHL | | MGFAQAPPTA | | QLPATGQPTV | | NNDYSYYHIS |
EAQNVSSHVP | | YPVALHVNIV | | NVPQPAAAAI | | QRHYNDEDPE | | KEKRIKELEL |
LLMSTENELK | | GQQVLPTQNH | | TCSYPGWHST | | TIADHTRPHG | | DSAPVSCLGE |
HHSTPSLPAD | | PGSLPEESAS | | PARCMIVHQG | | TILDNVKNLL | | EFAETLQFID |
SFLNTSSNHE | | NSDLEMPSLT | | STPLIGHKLT | | VTTPFHRDQT | | VKTQKENTVF |
RTPAIKRSIL | | ESSPRTPTPF | | KHALAAQEIK | | YGPLKMLPQT | | PSHLVEDLQD |
VIKQESDESG | | IVAEFQENGP | | PLLKKIKQEV | | ESPTDKSGNF | | FCSHHWEGDS |
LNTQLFTQTS | | PVADAPNILT | | SSVLMAPASE | | DEDNVLKAFT | | VPKNRSLASP |
LQPCSSTWEP | | ASCGKMEEQM | | TSSSQARKYV | | NAFSARTLVM |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
MYB
|
---|
|
Наявні структури |
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
Список кодів PDB |
1GUU, 1GV2, 1GV5, 1GVD, 1H88, 1H89, 1IDY, 1IDZ, 1MBE, 1MBF, 1MBG, 1MBH, 1MBJ, 1MBK, 1MSE, 1MSF, 1SB0, 2AGH
| | |
Ідентифікатори |
Символи |
MYB, Cmyb, c-myb, c-myb_CDS, efg, MYB proto-oncogene, transcription factor |
Зовнішні ІД |
OMIM: 189990 MGI: 97249 HomoloGene: 31311 GeneCards: MYB
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
Клітинна компонента |
• nuclear matrix • клітинне ядро • нуклеоплазма
|
Біологічний процес |
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • ремоделювання хроматину • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone H3-K4 methylation • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of histone H3-K9 methylation • positive regulation of T-helper cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • GO:0007067 мітоз • response to hypoxia • positive regulation of collagen biosynthetic process • positive regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • positive regulation of glial cell proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • cellular response to retinoic acid • positive regulation of transforming growth factor beta production • positive regulation of neuron death • positive regulation of hepatic stellate cell proliferation • positive regulation of hepatic stellate cell activation • positive regulation of testosterone secretion • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 6: 135.18 – 135.22 Mb |
Хр. 10: 21 – 21.04 Mb |
PubMed search |
[2] |
[3]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Majello B., Kenyon L.C., Dalla-Favera R. (1986). Human c-myb protooncogene: nucleotide sequence of cDNA and organization of the genomic locus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9636—9640. PMID 3540945 DOI:10.1073/pnas.83.24.9636
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nicolaides N.C., Gualdi R., Casadevall C., Manzella L., Calabretta B. (1991). Positive autoregulation of c-myb expression via Myb binding sites in the 5' flanking region of the human c-myb gene. Mol. Cell. Biol. 11: 6166—6176. PMID 1944282 DOI:10.1128/MCB.11.12.6166
- Matre V., Nordgaard O., Alm-Kristiansen A.H., Ledsaak M., Gabrielsen O.S. (2009). HIPK1 interacts with c-Myb and modulates its activity through phosphorylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 388: 150—154. PMID 19646965 DOI:10.1016/j.bbrc.2009.07.139
- Westin E.H., Gorse K.M., Clarke M.F. (1990). Alternative splicing of the human c-myb gene. Oncogene. 5: 1117—1124. PMID 2202948
- Jacobs S.M., Gorse K.M., Westin E.H. (1994). Identification of a second promoter in the human c-myb proto-oncogene. Oncogene. 9: 227—235. PMID 8302584