GABRA5

GABRA5 (англ. Gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 52 146^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDNGMFSGFI		MIKNLLLFCI		SMNLSSHFGF		SQMPTSSVKD		ETNDNITIFT
RILDGLLDGY		DNRLRPGLGE		RITQVRTDIY		VTSFGPVSDT		EMEYTIDVFF
RQSWKDERLR		FKGPMQRLPL		NNLLASKIWT		PDTFFHNGKK		SIAHNMTTPN
KLLRLEDDGT		LLYTMRLTIS		AECPMQLEDF		PMDAHACPLK		FGSYAYPNSE
VVYVWTNGST		KSVVVAEDGS		RLNQYHLMGQ		TVGTENISTS		TGEYTIMTAH
FHLKRKIGYF		VIQTYLPCIM		TVILSQVSFW		LNRESVPART		VFGVTTVLTM
TTLSISARNS		LPKVAYATAM		DWFIAVCYAF		VFSALIEFAT		VNYFTKRGWA
WDGKKALEAA		KIKKKREVIL		NKSTNAFTTG		KMSHPPNIPK		EQTPAGTSNT
TSVSVKPSEE		KTSESKKTYN		SISKIDKMSR		IVFPVLFGTF		NLVYWATYLN
REPVIKGAAS		PK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

GABRA5
Ідентифікатори
Символи	GABRA5, gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, EIEE79, gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha5, DEE79
Зовнішні ІД	OMIM: 137142 MGI: 95617 HomoloGene: 20219 GeneCards: GABRA5
Реагує на сполуку
gaboxadol, isonipecotic acid, isoguvacine, Мусцимол, ZK93423, flumazenil, ZK93426, bretazenil, L-822179, methyl 6,7-dimethoxy-4-ethyl-β-carboline-3-carboxylate, Ro-15-4513, RO4938581, L-838417, ocinaplon, алпразолам, Флунітразепам, triazolam, bicuculline, picrotoxin, CGS8216[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GABA-A receptor activity • transporter activity • ion channel activity • chloride channel activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • transmembrane signaling receptor activity • signaling receptor activity • GABA receptor binding • inhibitory extracellular ligand-gated ion channel activity • benzodiazepine receptor activity • GABA-gated chloride ion channel activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential Клітинна компонента • integral component of membrane • cell body • GABA-A receptor complex • postsynaptic membrane • мембрана • receptor complex • синапс • integral component of plasma membrane • chloride channel complex • neuronal cell body membrane • дендрит (нейробіологія) • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane • dendrite membrane • neuron projection • postsynapse Біологічний процес • gamma-aminobutyric acid signaling pathway • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • cochlea development • associative learning • regulation of neuron apoptotic process • neuron development • chloride transmembrane transport • слух • ion transport • behavioral fear response • brain development • inner ear receptor cell development • chloride transport • іннервація • GO:0072468 сигнальна трансдукція • chemical synaptic transmission • ion transmembrane transport • regulation of membrane potential • nervous system process • synaptic transmission, GABAergic • regulation of postsynaptic membrane potential Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2558	110886
Ensembl	ENSG00000186297	ENSMUSG00000055078
UniProt	P31644	Q8BHJ7
RefSeq (мРНК)	NM_000810 NM_001165037	NM_176942 NM_001362161 NM_001362162
RefSeq (білок)	NP_000801 NP_001158509	NP_795916 NP_001349090 NP_001349091
Локус (UCSC)	Хр. 15: 26.87 – 26.95 Mb	Хр. 7: 57.06 – 57.16 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim Y., Glatt H., Xie W., Sinnett D., Lalande M. (1997). Human gamma-aminobutyric acid-type A receptor alpha5 subunit gene (GABRA5): characterization and structural organization of the 5' flanking region. Genomics. 42: 378—387. PMID 9205108 DOI:10.1006/geno.1997.4770
• Denis N.J., Vasilescu J., Lambert J.-P., Smith J.C., Figeys D. (2007). Tryptic digestion of ubiquitin standards reveals an improved strategy for identifying ubiquitinated proteins by mass spectrometry. Proteomics. 7: 868—874. PMID 17370265 DOI:10.1002/pmic.200600410

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit alpha5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4079 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
5. UniProt, P31644 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 15