CX3CL1

CX3CL1 (англ. C-X3-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 42 203^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPISLSWLL		RLATFCHLTV		LLAGQHHGVT		KCNITCSKMT		SKIPVALLIH
YQQNQASCGK		RAIILETRQH		RLFCADPKEQ		WVKDAMQHLD		RQAAALTRNG
GTFEKQIGEV		KPRTTPAAGG		MDESVVLEPE		ATGESSSLEP		TPSSQEAQRA
LGTSPELPTG		VTGSSGTRLP		PTPKAQDGGP		VGTELFRVPP		VSTAATWQSS
APHQPGPSLW		AEAKTSEAPS		TQDPSTQAST		ASSPAPEENA		PSEGQRVWGQ
GQSPRPENSL		EREEMGPVPA		HTDAFQDWGP		GSMAHVSVVP		VSSEGTPSRE
PVASGSWTPK		AEEPIHATMD		PQRLGVLITP		VPDAQAATRR		QAVGLLAFLG
LLFCLGVAMF		TYQSLQGCPR		KMAGEMAEGL		RYIPRSCGSN		SYVLVPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

CX3CL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1B2T, 1F2L, 3ONA, 4XT1, 4XT3
Ідентифікатори
Символи	CX3CL1, ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, fractalkine, neurotactin, C-X3-C motif chemokine ligand 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601880 MGI: 1097153 HomoloGene: 2251 GeneCards: CX3CL1
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • chemokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CCR chemokine receptor binding • signaling receptor binding • integrin binding • CX3C chemokine receptor binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • defense response • positive regulation of inflammatory response • monocyte chemotaxis • cytokine-mediated signaling pathway • chemokine-mediated signaling pathway • angiogenesis involved in wound healing • cellular response to tumor necrosis factor • Загоєння ран • leukocyte chemotaxis • neutrophil chemotaxis • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of transforming growth factor beta1 production • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • адгезія клітин • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to interleukin-1 • leukocyte adhesive activation • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • cell chemotaxis • lymphocyte chemotaxis • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • positive regulation of calcium-independent cell-cell adhesion • хемотаксис • integrin activation • negative regulation of cell migration • leukocyte migration involved in inflammatory response • macrophage chemotaxis • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6376	20312
Ensembl	ENSG00000006210	ENSMUSG00000031778
UniProt	P78423	O35188
RefSeq (мРНК)	NM_002996 NM_001304392	NM_009142
RefSeq (білок)	NP_001291321 NP_002987	NP_033168
Локус (UCSC)	Хр. 16: 57.37 – 57.39 Mb	Хр. 8: 95.5 – 95.51 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
• Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2012). Integrins alphavbeta3 and alpha4beta1 act as coreceptors for fractalkine, and the integrin-binding defective mutant of fractalkine is an antagonist of CX3CR1. J. Immunol. 189: 5809—5819. PMID 23125415 DOI:10.4049/jimmunol.1200889
• Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2014). The chemokine fractalkine can activate integrins without CX3CR1 through direct binding to a ligand-binding site distinct from the classical RGD-binding site. PLoS ONE. 9: E96372—E96372. PMID 24789099 DOI:10.1371/journal.pone.0096372
• Mizoue L.S., Bazan J.F., Johnson E.C., Handel T.M. (1999). Solution structure and dynamics of the CX3C chemokine domain of fractalkine and its interaction with an N-terminal fragment of CX3CR1. Biochemistry. 38: 1402—1414. PMID 9931005 DOI:10.1021/bi9820614
• Hoover D.M., Mizoue L.S., Handel T.M., Lubkowski J. (2000). The crystal structure of the chemokine domain of fractalkine shows a novel quaternary arrangement. J. Biol. Chem. 275: 23187—23193. PMID 10770945 DOI:10.1074/jbc.M002584200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10647 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-24 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P78423 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16