CD40 (англ. CD40 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 30 619[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MVRLPLQCVL | | WGCLLTAVHP | | EPPTACREKQ | | YLINSQCCSL | | CQPGQKLVSD |
| CTEFTETECL | | PCGESEFLDT | | WNRETHCHQH | | KYCDPNLGLR | | VQQKGTSETD |
| TICTCEEGWH | | CTSEACESCV | | LHRSCSPGFG | | VKQIATGVSD | | TICEPCPVGF |
| FSNVSSAFEK | | CHPWTSCETK | | DLVVQQAGTN | | KTDVVCGPQD | | RLRALVVIPI |
| IFGILFAILL | | VLVFIKKVAK | | KPTNKAPHPK | | QEPQEINFPD | | DLPGSNTAAP |
| VQETLHGCQP | | VTQEDGKESR | | ISVQERQ |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
| CD40
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи |
CD40, Bp50, CDW40, TNFRSF5, p50, CD40 (protein), CD40 molecule |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 109535 MGI: 88336 HomoloGene: 954 GeneCards: CD40
|
|---|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| ревматоїдний артрит, CD40 deficiency[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding
• signal transducer activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• tumor necrosis factor-activated receptor activity
• enzyme binding
• ubiquitin protein ligase binding
• protein domain specific binding
• signaling receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма
• integral component of membrane
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• extracellular region
• cell surface
• CD40 receptor complex
• екзосома
• external side of plasma membrane
• міжклітинний простір
• soma
• varicosity
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of protein phosphorylation
• positive regulation of MAP kinase activity
• positive regulation of interleukin-12 production
• protein kinase B signaling
• positive regulation of protein kinase C signaling
• процес імунної системи
• cellular calcium ion homeostasis
• tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
• immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway
• platelet activation
• multicellular organism development
• B cell activation
• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• response to lipopolysaccharide
• B cell proliferation
• cellular response to mechanical stimulus
• positive regulation of endothelial cell apoptotic process
• regulation of cell population proliferation
• positive regulation of B cell proliferation
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• defense response to virus
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• regulation of immune response
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• apoptotic signaling pathway
• positive regulation of isotype switching to IgG isotypes
• cellular response to lipopolysaccharide
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• defense response to protozoan
• response to bacterium
• response to nutrient levels
• response to cobalamin
• response to interferon-gamma
• cellular response to erythropoietin
• cellular response to interleukin-1
• cellular response to tumor necrosis factor
• response to peptide
• inflammatory response
• positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein
• positive regulation of blood vessel endothelial cell migration
• positive regulation of angiogenesis
• GO:0034622 protein-containing complex assembly
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 20: 46.12 – 46.13 Mb |
Хр. 2: 164.9 – 164.91 Mb |
|---|
| PubMed search |
[2] |
[3]
|
|---|
| Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг.
Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Також секретований назовні.
- Tone M., Tone Y., Fairchild P.J., Wykes M., Waldmann H. (2001). Regulation of CD40 function by its isoforms generated through alternative splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1751—1756. PMID 11172023 DOI:10.1073/pnas.98.4.1751
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
- Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40. FEBS Lett. 358: 113—118. PMID 7530216 DOI:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
- Bajorath J., Aruffo A. (1997). Construction and analysis of a detailed three-dimensional model of the ligand binding domain of the human B cell receptor CD40. Proteins. 27: 59—70. PMID 9037712 DOI:10.1002/(SICI)1097-0134(199701)27:1<59::AID-PROT7>3.3.CO;2-Z
- Stamenkovic I., Clark E.A., Seed B. (1989). A B-lymphocyte activation molecule related to the nerve growth factor receptor and induced by cytokines in carcinomas. EMBO J. 8: 1403—1410. PMID 2475341
