ATF6 (англ. Activating transcription factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 670 амінокислот, а молекулярна маса — 74 585[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGEPAGVAGT | | MESPFSPGLF | | HRLDEDWDSA | | LFAELGYFTD | | TDELQLEAAN |
ETYENNFDNL | | DFDLDLMPWE | | SDIWDINNQI | | CTVKDIKAEP | | QPLSPASSSY |
SVSSPRSVDS | | YSSTQHVPEE | | LDLSSSSQMS | | PLSLYGENSN | | SLSSAEPLKE |
DKPVTGPRNK | | TENGLTPKKK | | IQVNSKPSIQ | | PKPLLLPAAP | | KTQTNSSVPA |
KTIIIQTVPT | | LMPLAKQQPI | | ISLQPAPTKG | | QTVLLSQPTV | | VQLQAPGVLP |
SAQPVLAVAG | | GVTQLPNHVV | | NVVPAPSANS | | PVNGKLSVTK | | PVLQSTMRNV |
GSDIAVLRRQ | | QRMIKNRESA | | CQSRKKKKEY | | MLGLEARLKA | | ALSENEQLKK |
ENGTLKRQLD | | EVVSENQRLK | | VPSPKRRVVC | | VMIVLAFIIL | | NYGPMSMLEQ |
DSRRMNPSVS | | PANQRRHLLG | | FSAKEAQDTS | | DGIIQKNSYR | | YDHSVSNDKA |
LMVLTEEPLL | | YIPPPPCQPL | | INTTESLRLN | | HELRGWVHRH | | EVERTKSRRM |
TNNQQKTRIL | | QGALEQGSNS | | QLMAVQYTET | | TSSISRNSGS | | ELQVYYASPR |
SYQDFFEAIR | | RRGDTFYVVS | | FRRDHLLLPA | | TTHNKTTRPK | | MSIVLPAINI |
NENVINGQDY | | EVMMQIDCQV | | MDTRILHIKS | | SSVPPYLRDQ | | QRNQTNTFFG |
SPPAATEATH | | VVSTIPESLQ |
Коротка інформація Ідентифікатори, Символи ...
ATF6
|
---|
|
Ідентифікатори |
Символи |
ATF6, ATF6A, ACHM7, activating transcription factor 6 |
Зовнішні ІД |
OMIM: 605537 MGI: 1926157 HomoloGene: 32015 GeneCards: ATF6
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
хвороба Паркінсона, achromatopsia 7, achromatopsia[1] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein heterodimerization activity • ubiquitin protein ligase binding • cAMP response element binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
Клітинна компонента |
• integral component of membrane • комплекс Ґольджі • nuclear envelope • мембрана • endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • нуклеоплазма • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • гіалоплазма
|
Біологічний процес |
• розвиток ока • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Відповідь на незгорнуті білки • ATF6-mediated unfolded protein response • response to unfolded protein • згортання білків • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • positive regulation of apoptotic process • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of ATF6-mediated unfolded protein response
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 1: 161.77 – 161.98 Mb |
Хр. 1: 170.53 – 170.7 Mb |
PubMed search |
[2] |
[3]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
- Zhu C., Johansen F.E., Prywes R. (1997). Interaction of ATF6 and serum response factor. Mol. Cell. Biol. 17: 4957—4966. PMID 9271374 DOI:10.1128/MCB.17.9.4957
- Yoshida H., Haze K., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1998). Identification of the cis-acting endoplasmic reticulum stress response element responsible for transcriptional induction of mammalian glucose-regulated proteins; involvement of basic-leucine zipper transcription factors. J. Biol. Chem. 273: 33741—33749. PMID 9837962 DOI:10.1074/jbc.273.50.33741
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
- Haze K., Yoshida H., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1999). Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol. Biol. Cell. 10: 3787—3799. PMID 10564271 DOI:10.1091/mbc.10.11.3787
- Yoshida H., Matsui T., Yamamoto A., Okada T., Mori K. (2001). XBP1 mRNA is induced by ATF6 and spliced by IRE1 in response to ER stress to produce a highly active transcription factor. Cell. 107: 881—891. PMID 11779464 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00611-0