TBP (англ. TATA-box binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 698[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MDQNNSLPPY | | AQGLASPQGA | | MTPGIPIFSP | | MMPYGTGLTP | | QPIQNTNSLS |
| ILEEQQRQQQ | | QQQQQQQQQQ | | QQQQQQQQQQ | | QQQQQQQQQQ | | QQQQQAVAAA |
| AVQQSTSQQA | | TQGTSGQAPQ | | LFHSQTLTTA | | PLPGTTPLYP | | SPMTPMTPIT |
| PATPASESSG | | IVPQLQNIVS | | TVNLGCKLDL | | KTIALRARNA | | EYNPKRFAAV |
| IMRIREPRTT | | ALIFSSGKMV | | CTGAKSEEQS | | RLAARKYARV | | VQKLGFPAKF |
| LDFKIQNMVG | | SCDVKFPIRL | | EGLVLTHQQF | | SSYEPELFPG | | LIYRMIKPRI |
| VLLIFVSGKV | | VLTGAKVRAE | | IYEAFENIYP | | ILKGFRKTT |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
| TBP
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB |
|
1TGH, 1C9B, 1JFI, 1NVP, 4ROC, 4ROE, 4ROD, 5IY9, 5IYA, 5FUR, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
| | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи |
TBP, GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-box binding protein, TATA-binding protein, TBP1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600075 MGI: 101838 HomoloGene: 2404 GeneCards: TBP
|
|---|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| spinocerebellar ataxia type 17[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• transcription factor binding
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• enzyme binding
• TFIIB-class transcription factor binding
• aryl hydrocarbon receptor binding
• GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
• RNA polymerase III general transcription initiation factor activity
• GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
• RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
• RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма
• transcription factor TFIID complex
• male pronucleus
• female pronucleus
• нуклеоплазма
• transcription factor TFIIA complex
• Пронуклеус
• клітинне ядро
• transcription preinitiation complex
• GO:0009327 protein-containing complex
• transcription factor TFIIIB complex
• transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• termination of RNA polymerase I transcription
• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• transcription initiation from RNA polymerase I promoter
• transcription, DNA-templated
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• Сперматогенез
• DNA-templated transcription, initiation
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• snRNA transcription by RNA polymerase II
• regulation of signal transduction by p53 class mediator
• GO:0022415 viral process
• regulation of transcription by RNA polymerase III
• transcription by RNA polymerase II
• transcription by RNA polymerase III
• RNA polymerase II preinitiation complex assembly
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
• RNA polymerase III preinitiation complex assembly
• GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 170.55 – 170.57 Mb |
Хр. 17: 15.72 – 15.75 Mb |
|---|
| PubMed search |
[2] |
[3]
|
|---|
| Вікідані |
|
Закрити
Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Peterson M.G., Tanese N., Pugh B.F., Tjian R. (1990). Functional domains and upstream activation properties of cloned human TATA binding protein. Science. 248: 1625—1630. PMID 2363050 DOI:10.1126/science.2363050
- Geisberg J.V., Lee W.S., Berk A.J., Ricciardi R.P. (1994). The zinc finger region of the adenovirus E1A transactivating domain complexes with the TATA box binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 2488—2492. PMID 8146144 DOI:10.1073/pnas.91.7.2488
- Veschambre P., Simard P., Jalinot P. (1995). Evidence for functional interaction between the HIV-1 Tat transactivator and the TATA box binding protein in vivo. J. Mol. Biol. 250: 169—180. PMID 7608968 DOI:10.1006/jmbi.1995.0368
- LeRoy G., Orphanides G., Lane W.S., Reinberg D. (1998). Requirement of RSF and FACT for transcription of chromatin templates in vitro. Science. 282: 1900—1904. PMID 9836642 DOI:10.1126/science.282.5395.1900
- Yuan C.X., Gurley W.B. (2000). Potential targets for HSF1 within the preinitiation complex. Cell Stress Chaperones. 5: 229—242. PMID 11005381 DOI:10.1379/1466-1268(2000)005<0229:PTFHWT>2.0.CO;2
- Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200
