RORC (англ. RAR related orphan receptor C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 58 195[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MDRAPQRQHR | | ASRELLAAKK | | THTSQIEVIP | | CKICGDKSSG | | IHYGVITCEG |
| CKGFFRRSQR | | CNAAYSCTRQ | | QNCPIDRTSR | | NRCQHCRLQK | | CLALGMSRDA |
| VKFGRMSKKQ | | RDSLHAEVQK | | QLQQRQQQQQ | | EPVVKTPPAG | | AQGADTLTYT |
| LGLPDGQLPL | | GSSPDLPEAS | | ACPPGLLKAS | | GSGPSYSNNL | | AKAGLNGASC |
| HLEYSPERGK | | AEGRESFYST | | GSQLTPDRCG | | LRFEEHRHPG | | LGELGQGPDS |
| YGSPSFRSTP | | EAPYASLTEI | | EHLVQSVCKS | | YRETCQLRLE | | DLLRQRSNIF |
| SREEVTGYQR | | KSMWEMWERC | | AHHLTEAIQY | | VVEFAKRLSG | | FMELCQNDQI |
| VLLKAGAMEV | | VLVRMCRAYN | | ADNRTVFFEG | | KYGGMELFRA | | LGCSELISSI |
| FDFSHSLSAL | | HFSEDEIALY | | TALVLINAHR | | PGLQEKRKVE | | QLQYNLELAF |
| HHHLCKTHRQ | | SILAKLPPKG | | KLRSLCSQHV | | ERLQIFQHLH | | PIVVQAAFPP |
| LYKELFSTET | | ESPVGLSK |
Коротка інформація Наявні структури, PDB ...
| RORC
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB |
|
3B0W, 3KYT, 3L0J, 3L0L, 4NB6, 4NIE, 4QM0, 4S14, 4WLB, 4WPF, 4WQP, 4XT9, 4YMQ, 4ZJR, 4ZJW, 4ZOM, 5C4O, 5APK, 5APJ, 5APH, 5C4U, 5C4S, 5C4T, 4YPQ, 5AYG, 5IXK, 5IZ0, 5EJV, 5ETH
| | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи |
RORC, NR1F3, RORG, RZR-GAMMA, RZRG, TOR, RAR-related orphan receptor gamma, IMD42, RAR related orphan receptor C |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602943 MGI: 104856 HomoloGene: 21051 GeneCards: RORC
|
|---|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| запальні захворювання кишківника[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding
• sequence-specific DNA binding
• ligand-activated transcription factor activity
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• zinc ion binding
• зв'язування з іоном металу
• steroid hormone receptor activity
• GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• oxysterol binding
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
• transcription coactivator binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма
• клітинне ядро
• ядерні тільця
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• ритмічний процес
• cellular response to sterol
• negative regulation of thymocyte apoptotic process
• circadian regulation of gene expression
• regulation of fat cell differentiation
• transcription, DNA-templated
• regulation of steroid metabolic process
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• multicellular organism development
• regulation of glucose metabolic process
• циркадний ритм
• xenobiotic metabolic process
• positive regulation of circadian rhythm
• adipose tissue development
• T-helper 17 cell differentiation
• Peyer's patch development
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• T-helper cell differentiation
• lymph node development
• steroid hormone mediated signaling pathway
• intracellular receptor signaling pathway
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• cytokine-mediated signaling pathway
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 151.81 – 151.83 Mb |
Хр. 3: 94.28 – 94.31 Mb |
|---|
| PubMed search |
[2] |
[3]
|
|---|
| Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Hirose T., Smith R.J., Jetten A.M. (1994). ROR gamma: the third member of ROR/RZR orphan receptor subfamily that is highly expressed in skeletal muscle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1976—1983. PMID 7811290 DOI:10.1006/bbrc.1994.2902
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jetten A.M. (2009). Retinoid-related orphan receptors (RORs): critical roles in development, immunity, circadian rhythm, and cellular metabolism. Nucl. Recept. Signal. 7: 3—35. PMID 19381306 DOI:10.1621/nrs.07003
- Wang Y., Kumar N., Crumbley C., Griffin P.R., Burris T.P. (2010). A second class of nuclear receptors for oxysterols: Regulation of RORalpha and RORgamma activity by 24S-hydroxycholesterol (cerebrosterol). Biochim. Biophys. Acta. 1801: 917—923. PMID 20211758 DOI:10.1016/j.bbalip.2010.02.012
- Solt L.A., Burris T.P. (2012). Action of RORs and their ligands in (patho)physiology. Trends Endocrinol. Metab. 23: 619—627. PMID 22789990 DOI:10.1016/j.tem.2012.05.012
