NRF1 (англ. Nuclear respiratory factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот, а молекулярна маса — 53 541[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEEHGVTQTE | | HMATIEAHAV | | AQQVQQVHVA | | TYTEHSMLSA | | DEDSPSSPED |
TSYDDSDILN | | STAADEVTAH | | LAAAGPVGMA | | AAAAVATGKK | | RKRPHVFESN |
PSIRKRQQTR | | LLRKLRATLD | | EYTTRVGQQA | | IVLCISPSKP | | NPVFKVFGAA |
PLENVVRKYK | | SMILEDLESA | | LAEHAPAPQE | | VNSELPPLTI | | DGIPVSVDKM |
TQAQLRAFIP | | EMLKYSTGRG | | KPGWGKESCK | | PIWWPEDIPW | | ANVRSDVRTE |
EQKQRVSWTQ | | ALRTIVKNCY | | KQHGREDLLY | | AFEDQQTQTQ | | ATATHSIAHL |
VPSQTVVQTF | | SNPDGTVSLI | | QVGTGATVAT | | LADASELPTT | | VTVAQVNYSA |
VADGEVEQNW | | ATLQGGEMTI | | QTTQASEATQ | | AVASLAEAAV | | AASQEMQQGA |
TVTMALNSEA | | AAHAVATLAE | | ATLQGGGQIV | | LSGETAAAVG | | ALTGVQDANG |
LVQIPVSMYQ | | TVVTSLAQGN | | GPVQVAMAPV | | TTRISDSAVT | | MDGQAVEVVT |
LEQ |
Коротка інформація Ідентифікатори, Символи ...
NRF1
|
---|
|
Ідентифікатори |
Символи |
NRF1, ALPHA-PAL, nuclear respiratory factor 1 |
Зовнішні ІД |
OMIM: 600879 MGI: 1332235 HomoloGene: 3674 GeneCards: NRF1
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
Молекулярна функція |
• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
Клітинна компонента |
• екзосома • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро
|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • mitochondrion organization • generation of precursor metabolites and energy • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
|
Більше даних
|
Ортологи |
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
Ensembl |
|
|
UniProt |
|
|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 7: 129.61 – 129.76 Mb |
Хр. 6: 30.05 – 30.15 Mb |
PubMed search |
[2] |
[3]
|
---|
Вікідані |
|
Закрити
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Virbasius C.A., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1993). NRF-1, an activator involved in nuclear-mitochondrial interactions, utilizes a new DNA-binding domain conserved in a family of developmental regulators. Genes Dev. 7: 2431—2445. PMID 8253388 DOI:10.1101/gad.7.12a.2431
- Gopalakrishnan L., Scarpulla R.C. (1995). Structure, expression, and chromosomal assignment of the human gene encoding nuclear respiratory factor 1. J. Biol. Chem. 270: 18019—18025. PMID 7629110 DOI:10.1074/jbc.270.30.18019
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Spelbrink J.N., Van den Bogert C. (1995). The pre-mRNA of nuclear respiratory factor 1, a regulator of mitochondrial biogenesis, is alternatively spliced in human tissues and cell lines. Hum. Mol. Genet. 4: 1591—1596. PMID 8541844 DOI:10.1093/hmg/4.9.1591
- Gugneja S., Scarpulla R.C. (1997). Serine phosphorylation within a concise amino-terminal domain in nuclear respiratory factor 1 enhances DNA binding. J. Biol. Chem. 272: 18732—18739. PMID 9228045 DOI:10.1074/jbc.272.30.18732
- Andersson U., Scarpulla R.C. (2001). Pgc-1-related coactivator, a novel, serum-inducible coactivator of nuclear respiratory factor 1-dependent transcription in mammalian cells. Mol. Cell. Biol. 21: 3738—3749. PMID 11340167 DOI:10.1128/MCB.21.11.3738-3749.2001